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WSB1 - WD repeat and SOCS box containing 1 Gene

中文名称:含 WD 重复和 SOCS 盒 1

种属: Homo sapiens

同用名: SWIP1; WSB-1

基因 ID: 26118 | 基因类型: protein coding

关于 WSB1

Cytogenetic location: 17q11.1 Genomic coordinates (GRCh38): 17:27,294,114-27,315,926 (from NCBI)

This gene has 17 transcripts (splice variants), 214 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in spleen (RPKM 64.5), lung (RPKM 63.6) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码 WD 蛋白亚家族的一个成员。该蛋白质与小鼠和小鸡蛋白质具有高度序列同一性。它包含几个跨越大部分蛋白质的 WD 重复序列和 C 末端的 SOCS 框。已发现该基因编码不同亚型的可变剪接转录物变体。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

This gene encodes a member of the WD-protein subfamily. This protein shares a high sequence identity to mouse and chick proteins. It contains several WD-repeats spanning most of the protein and an SOCS box in the C-terminus. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

WSB1 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001348350.2 NP_001335279.1 WD repeat and SOCS box-containing protein 1 isoform 3
NM_015626.10 NP_056441.6 WD repeat and SOCS box-containing protein 1 isoform 1
NM_134265.4 NP_599027.1 WD repeat and SOCS box-containing protein 1 isoform 2
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
18093972 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

WSB1 蛋白结构

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (161 - 199)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (207 - 242)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (249 - 284)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (308 - 338)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (356 - 378)

SOCS_box

SOCS_box: SOCS box (384 - 420)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 421 a.a.
蛋白主名 其他名称

WD repeat and SOCS box-containing protein 1

SOCS box-containing WD protein SWiP-1

WSB1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
WSB1 Q9Y6I7 VHL Homo sapiens P40337-2 32814053
种属内
WSB1 Q9Y6I7 VHL Homo sapiens P40337-2 32814053
种属内
WSB1 Q9Y6I7 VHL Homo sapiens P40337-2 32814053
种属间
WSB1 Q9Y6I7 Hipk2 Mus musculus Q9QZR5 18093972
种属间
WSB1 Q9Y6I7 Hipk2 Mus musculus Q9QZR5 18093972
种属内
WSB1 Q9Y6I7 LRRK2 Homo sapiens Q5S007 27273569
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus WSB1 MGD MGI:1926139
Macaca mulatta WSB1 VGNC VGNC:79186
Felis catus WSB1 VGNC VGNC:67091
Canis familiaris WSB1 VGNC VGNC:48435
Bos taurus WSB1 VGNC VGNC:36971
Rattus norvegicus WSB1 RGD RGD:1307835