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MRPL18 - mitochondrial ribosomal protein L18 Gene

中文名称:线粒体核糖体蛋白 L18

种属: Homo sapiens

同用名: L18mt; HSPC071; MRP-L18

基因 ID: 29074 | 基因类型: protein coding

关于 MRPL18

Cytogenetic location: 6q25.3 Genomic coordinates (GRCh38): 6:159,789,812-159,798,429 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants) and 210 orthologues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 18.5), colon (RPKM 17.9) and 25 other tissues.

功能概要

该核基因编码线粒体核糖体较大的 39S 亚基的蛋白质成分。这种蛋白质还可能有助于将核编码的 5S rRNA 导入线粒体。可变剪接导致多个转录变体,其中大部分预计不会编码蛋白质。在 16 号染色体上发现了该基因的假基因。[RefSeq 提供,2016 年 1 月]

This nuclear gene encodes a protein component of the larger 39S subunit of mitochondrial ribosome. This protein may also aid in the import of nuclear-encoded 5S rRNA into mitochondria. Alternative splicing results in multiple transcript variants, most of which are not predicted to encode a protein. A pseudogene of this gene is found on chromosome 16. [provided by RefSeq, Jan 2016]

MRPL18 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001318817.2 NP_001305746.1 39S ribosomal protein L18, mitochondrial isoform 2
NM_014161.5 NP_054880.2 39S ribosomal protein L18, mitochondrial isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables 5S rRNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
21685364 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
28514442 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in rRNA import into mitochondrion IDA
IDA: 通过直接分析推断
21685364 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of mitochondrial large ribosomal subunit IDA
IDA: 通过直接分析推断
25278503 GOA
located in mitochondrion IDA
IDA: 通过直接分析推断
28892042 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

MRPL18 蛋白结构

Ribosomal_L18p

Ribosomal_L18p: Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast (79 - 146)

  • 0
  • 100
  • 180 a.a.
蛋白主名 其他名称

39S ribosomal protein L18, mitochondrial

mitochondrial large ribosomal subunit protein uL18m

MRPL18 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra MRPL18 Q9H0U6 LAPTM5 Homo sapiens Q13571
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra MRPL18 Q9H0U6 LAPTM5 Homo sapiens Q13571
Y2H Array
32296183
Intra MRPL18 Q9H0U6 MRPL38 Homo sapiens Q96DV4
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra MRPL18 Q9H0U6 MRPL38 Homo sapiens Q96DV4
Anti Tag CoIP
33961781
Intra MRPL18 Q9H0U6 MRPL38 Homo sapiens Q96DV4
Y2H Array
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus MRPL18 VGNC VGNC:31621
Mus musculus MRPL18 MGD MGI:1914931
Canis familiaris MRPL18 VGNC VGNC:43382
Felis catus MRPL18 VGNC VGNC:63596
Rattus norvegicus MRPL18 RGD RGD:1306387