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GTF2E2 - general transcription factor IIE subunit 2 Gene

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中文名称：一般转录因子 IIE 亚基 2

种属: Homo sapiens

同用名: FE; TTD6; TF2E2; TFIIE-B

基因 ID: 2961 | 基因类型: protein coding

关于 GTF2E2

Cytogenetic location: 8p12 Genomic coordinates (GRCh38): 8:30,578,318-30,658,236 (from NCBI)

This gene has 5 transcripts (splice variants), 205 orthologues and is associated with 3 phenotypes. Ubiquitous expression in testis (RPKM 12.1), lymph node (RPKM 9.3) and 25 other tissues.

功能概要

一般转录因子 IIE (TFIIE) 是 RNA 聚合酶 II 转录起始复合物的一部分，招募 TFIIH 并且对于 RNA 聚合酶 II 的启动子清除至关重要。 TFIIE 是 alpha 和 beta 亚基的异二聚体 (有时是异四聚体) 。该基因编码的蛋白质代表 TFIIE 的 β 亚基。[RefSeq 提供，2017 年 1 月]

The general transcription factor IIE (TFIIE) is part of the RNA polymerase II transcription initiation complex, recruiting TFIIH and being essential for promoter clearance by RNA polymerase II. TFIIE is a heterodimer (and sometimes heterotetramer) of alpha and beta subunits. The protein encoded by this gene represents the beta subunit of TFIIE. [provided by RefSeq, Jan 2017]

GTF2E2 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001348353.1 NP_001335282.1 transcription initiation factor IIE subunit beta isoform 2
NM_002095.6 NP_002086.1 transcription initiation factor IIE subunit beta isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables RNA polymerase II general transcription initiation factor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
27193682 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
7926747 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in transcription by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
27193682 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of transcription factor TFIID complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
27193682 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

GTF2E2 蛋白结构

TFIIE_beta

TFIIE_beta: TFIIE beta subunit core domain (73 - 145)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 291 a.a.
蛋白主名 其他名称

transcription initiation factor IIE subunit beta

TFIIE beta subunit

GTF2E2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra GTF2E2 P29084 KAT5 Homo sapiens Q92993
Validated Y2H
32296183
Intra GTF2E2 P29084 GTF2E1 Homo sapiens P29083
Anti Tag CoIP
33961781
Intra GTF2E2 P29084 GTF2E1 Homo sapiens P29083
EM
16547462
Intra GTF2E2 P29084 GTF2E1 Homo sapiens P29083
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra GTF2E2 P29084 GTF2E1 Homo sapiens P29083
Crosslink
16547462
Intra GTF2E2 P29084 GTF2E1 Homo sapiens P29083
Y2H Array
32296183
Intra GTF2E2 P29084 GTF2E1 Homo sapiens P29083
Anti Tag CoIP
28514442
Intra GTF2E2 P29084 EXOC8 Homo sapiens Q8IYI6
Y2H Array
32296183
Intra GTF2E2 P29084 EXOC8 Homo sapiens Q8IYI6
Validated Y2H
32296183
Intra GTF2E2 P29084 PICK1 Homo sapiens Q9NRD5
Validated Y2H
32296183
Intra GTF2E2 P29084 PICK1 Homo sapiens Q9NRD5
Y2H Array
32296183
Intra GTF2E2 P29084 PICK1 Homo sapiens Q9NRD5
Y2H Prey Pooling
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Trichothiodystrophy 6, Nonphotosensitive

TTD6

Nonphotosensitive Trichothiodystrophy 6

Trichothiodystrophy 6, Non-Photosensitive
Trichothiodystrophy

Ttd

Amish Brittle Hair Syndrome

Bids Syndrome

Brittle Hair-Intellectual Impairment-Decreased Fertility-Short Stature Syndrome

Ibids

Pibids

Trichothiodystrophy Syndromes
Ichthyosis

Ichthyoses

Non-Syndromic Ichthyosis

Congenital Ichthyosis
疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

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Lymphoplasmacytic Lymphoma

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS05895 GTF2E2 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Canis familiaris GTF2E2 VGNC VGNC:41545
Mus musculus GTF2E2 MGD MGI:1915403
Rattus norvegicus GTF2E2 RGD RGD:1310134
Bos taurus GTF2E2 VGNC VGNC:29694
Felis catus GTF2E2 VGNC VGNC:67496
Macaca mulatta GTF2E2 VGNC VGNC:73308
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