1. Gene
  2. NUP43 - nucleoporin 43 Gene

NUP43 - nucleoporin 43 Gene

中文名称:核孔蛋白 43

种属: Homo sapiens

同用名: p42; bA350J20.1

基因 ID: 348995 | 基因类型: protein coding

关于 NUP43

Cytogenetic location: 6q25.1 Genomic coordinates (GRCh38): 6:149,724,315-149,749,358 (from NCBI)

This gene has 6 transcripts (splice variants) and 214 orthologues. Ubiquitous expression in lymph node (RPKM 6.0), appendix (RPKM 5.2) and 25 other tissues.

功能概要

大分子在细胞质和细胞核之间的双向运输通过嵌入核膜的核孔复合物 (NPC) 发生。 NPC 由子复合体组成,NUP43 是此类子复合体 Nup107-160 的一部分 (Loiodice 等人,2004 [PubMed 15146057]) 。[OMIM 提供,2008 年 3 月]

Bidirectional transport of macromolecules between the cytoplasm and nucleus occurs through nuclear pore complexes (NPCs) embedded in the nuclear envelope. NPCs are composed of subcomplexes, and NUP43 is part of one such subcomplex, Nup107-160 (Loiodice et al., 2004 [PubMed 15146057]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

NUP43 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_198887.3 NP_942590.1 nucleoporin Nup43
基因本体论
  • 分子功能
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
15146057 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
colocalizes with kinetochore IDA
IDA: 通过直接分析推断
15146057 GOA
located in nuclear envelope IDA
IDA: 通过直接分析推断
24315095 GOA
part of nuclear pore outer ring IDA
IDA: 通过直接分析推断
17360435 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

NUP43 蛋白结构

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (211 - 246)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (254 - 290)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 380 a.a.
蛋白主名 其他名称

nucleoporin Nup43

nucleoporin 43kDa

NUP43 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
NUP43 Q8NFH3 PARK7 Homo sapiens Q99497 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 PARK7 Homo sapiens Q99497 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 PARK7 Homo sapiens Q99497 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 LAMP2 Homo sapiens P13473-2 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 LAMP2 Homo sapiens P13473-2 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 LAMP2 Homo sapiens P13473-2 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 PRPF40A Homo sapiens O75400-2 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 PRPF40A Homo sapiens O75400-2 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 PRPF40A Homo sapiens O75400-2 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 CCK Homo sapiens P06307 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 CCK Homo sapiens P06307 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 CCK Homo sapiens P06307 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 TTR Homo sapiens P02766 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 TTR Homo sapiens P02766 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 TTR Homo sapiens P02766 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 HEXB Homo sapiens P07686 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 HEXB Homo sapiens P07686 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 HEXB Homo sapiens P07686 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 CASP6 Homo sapiens P55212 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 CASP6 Homo sapiens P55212 32814053
种属内
NUP43 Q8NFH3 CASP6 Homo sapiens P55212 32814053
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Familial Atrial Fibrillation

Atrial Fibrillation, Familial

Atfb

Atrial Fibrillation Autosomal Dominant

Autosomal Dominant Atrial Fibrillation

Auricular Fibrillation

Atrial Fibrillation

Atrial Fibrillation, Familial, 1

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Canis familiaris NUP43 VGNC VGNC:44055
Bos taurus NUP43 VGNC VGNC:32361
Rattus norvegicus NUP43 RGD RGD:1596513
Mus musculus NUP43 MGD MGI:1917162
Macaca mulatta NUP43 VGNC VGNC:83438
Felis catus NUP43 VGNC VGNC:63926