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PLXNB1 - plexin B1 Gene

中文名称:丛素 B1

种属: Homo sapiens

同用名: SEP; PLXN5; PLEXIN-B1

基因 ID: 5364 | 基因类型: protein coding

关于 PLXNB1

Cytogenetic location: 3p21.31 Genomic coordinates (GRCh38): 3:48,403,854-48,430,310 (from NCBI)

This gene has 19 transcripts (splice variants), 276 orthologues and 8 paralogues. Ubiquitous expression in skin (RPKM 13.8), kidney (RPKM 13.0) and 24 other tissues.

功能概要

启用信号蛋白受体活性。参与多个过程,包括细胞粘附的负调节;调节细胞形状;和脑信号蛋白-丛蛋白信号通路。是质膜的组成部分。信号蛋白受体复合体的一部分。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Enables semaphorin receptor activity. Involved in several processes, including negative regulation of cell adhesion; regulation of cell shape; and semaphorin-plexin signaling pathway. Is integral component of plasma membrane. Part of semaphorin receptor complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

PLXNB1 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001130082.3 NP_001123554.1 plexin-B1 precursor
NM_002673.6 NP_002664.2 plexin-B1 precursor
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
12730235 GOA
enables semaphorin receptor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
19843518 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of cell adhesion IDA
IDA: 通过直接分析推断
15218527 GOA
involved in regulation of cell shape IDA
IDA: 通过直接分析推断
19843518 GOA
involved in regulation of cytoskeleton organization IDA
IDA: 通过直接分析推断
19843518 GOA
involved in semaphorin-plexin signaling pathway IDA
IDA: 通过直接分析推断
15218527 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in plasma membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
19843518 GOA
part of semaphorin receptor complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
19843518 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

PLXNB1 蛋白结构

Sema

Sema: Sema domain (36 - 440)

PSI

PSI: Plexin repeat (481 - 528)

TIG

TIG: IPT/TIG domain (1070 - 1158)

TIG

TIG: IPT/TIG domain (1162 - 1248)

TIG

TIG: IPT/TIG domain (1252 - 1374)

Plexin_cytopl

Plexin_cytopl: Plexin cytoplasmic RasGAP domain (1561 - 2102)

  • 0
  • 400
  • 800
  • 1200
  • 1600
  • 2000
  • 2135 a.a.
蛋白主名 其他名称

plexin-B1

plexin 5

PLXNB1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
PLXNB1 O43157 MET Homo sapiens P08581
Anti Tag CoIP
12198496
种属内
PLXNB1 O43157 MET Homo sapiens P08581
Anti Bait CoIP
15184888
种属内
PLXNB1 O43157 MET Homo sapiens P08581
Anti Tag CoIP
22404908
种属内
PLXNB1 O43157 RND3 Homo sapiens P61587
Affinity Techniques
14732713
种属内
PLXNB1 O43157 MST1R Homo sapiens Q04912
Anti Bait CoIP
15184888
种属内
PLXNB1 O43157 RND1 Homo sapiens Q92730
CoIP
12730235
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

重组 PLXNB1 蛋白

目录号 产品名 蛋白编号 纯度
HY-P700428 Plexin B1 Protein, Human (HEK293, mFc) O43157 (L20-Q535) ≥95%

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta PLXNB1 VGNC VGNC:76187
Felis catus PLXNB1 VGNC VGNC:68918
Bos taurus PLXNB1 VGNC VGNC:33061
Canis familiaris PLXNB1 VGNC VGNC:44722
Mus musculus PLXNB1 MGD MGI:2154238
Rattus norvegicus PLXNB1 RGD RGD:1310564
Others PLXNB1 NCBI