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RAB39A - RAB39A, member RAS oncogene family Gene

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中文名称：RAB39A，成员 RAS 致癌基因家族

种属: Homo sapiens

同用名: K28; RAB39

基因 ID: 54734 | 基因类型: protein coding

关于 RAB39A

Cytogenetic location: 11q22.3 Genomic coordinates (GRCh38): 11:107,928,448-107,963,482 (from NCBI)

This gene has 1 transcript (splice variant), 208 orthologues and 68 paralogues. Broad expression in brain (RPKM 2.3), appendix (RPKM 1.8) and 16 other tissues.

功能概要

预测启用 GTPase 活动。参与吞噬体酸化和吞噬体-溶酶体融合。位于吞噬泡内。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Predicted to enable GTPase activity. Involved in phagosome acidification and phagosome-lysosome fusion. Located in phagocytic vesicle. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

RAB39A 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_017516.3 NP_059986.1 ras-related protein Rab-39A
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
24349490 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in phagosome acidification IMP
IMP: 通过突变表型推断
21255211 GOA
involved in phagosome-lysosome fusion IMP
IMP: 通过突变表型推断
21255211 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in phagocytic vesicle IDA
IDA: 通过直接分析推断
21255211 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

RAB39A 蛋白结构

Ras

Ras: Ras family (10 - 176)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 217 a.a.
蛋白主名 其他名称

ras-related protein Rab-39A

RAB39, member RAS oncogene family

RAB39A 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
RAB39A Q14964 BLZF1 Homo sapiens Q9H2G9
Y2H Array
32296183
种属内
RAB39A Q14964 BLZF1 Homo sapiens Q9H2G9
Validated Y2H
25416956
种属内
RAB39A Q14964 BLZF1 Homo sapiens Q9H2G9
Validated Y2H
32296183
种属内
RAB39A Q14964 BLZF1 Homo sapiens Q9H2G9
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
RAB39A Q14964 BLZF1 Homo sapiens Q9H2G9
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
RAB39A Q14964 BLZF1 Homo sapiens Q9H2G9
Y2H Array
25416956
种属内
RAB39A Q14964 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Y2H Array
32296183
种属内
RAB39A Q14964 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
RAB39A Q14964 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Validated Y2H
25416956
种属内
RAB39A Q14964 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Y2H Array
25416956
种属内
RAB39A Q14964 GORASP2 Homo sapiens Q9H8Y8
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
RAB39A Q14964 GORASP2 Homo sapiens Q9H8Y8
Validated Y2H
32296183
种属内
RAB39A Q14964 GORASP2 Homo sapiens Q9H8Y8
Y2H Array
32296183
种属内
RAB39A Q14964 BECN1 Homo sapiens Q14457
Anti Tag CoIP
24349490
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Waisman Syndrome

Early-Onset Parkinsonism-Intellectual Disability Syndrome

Bgmr

Wsn

Laxova-Opitz Syndrome

WSMN

Parkinsonism, Early-Onset, With Mental Retardation

Basal Ganglion Disorder With Mental Retardation

Basal Ganglia Disorder With Intellectual Disability

Laxova Brown Hogan Syndrome

X-Linked Recessive Basal Ganglia Disorder With Intellectual Disability
疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS11553 RAB39A Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus RAB39A VGNC VGNC:104319
Bos taurus RAB39A VGNC VGNC:33647
Mus musculus RAB39A MGD MGI:2442855
Macaca mulatta RAB39A VGNC VGNC:81537
Rattus norvegicus RAB39A RGD RGD:1311286
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