1. Gene
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WDR12 - WD repeat domain 12 Gene

中文名称:WD 重复域 12

种属: Homo sapiens

同用名: YTM1

基因 ID: 55759 | 基因类型: protein coding

关于 WDR12

Cytogenetic location: 2q33.2 Genomic coordinates (GRCh38): 2:202,874,261-202,911,673 (from NCBI)

This gene has 9 transcripts (splice variants), 218 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in testis (RPKM 5.2), kidney (RPKM 3.9) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码 WD 重复蛋白家族的一个成员。 WD 重复是大约 40 个氨基酸的最小保守区域,通常由 gly-his 和 trp-asp (GH-WD) 括起来,这可能有助于异源三聚体或多蛋白复合物的形成。该家族的成员参与多种细胞过程,包括细胞周期进程、信号转导、细胞凋亡和基因调控。该蛋白在氨基酸水平上与小鼠 WD 重复结构域 12 蛋白高度相似。该基因编码的蛋白质是影响核糖体大亚基成熟的核仁蛋白复合物的组成部分。[RefSeq 提供,2008 年 12 月]

This gene encodes a member of the WD repeat protein family. WD repeats are minimally conserved regions of approximately 40 Amino acids typically bracketed by gly-his and trp-asp (GH-WD), which may facilitate formation of heterotrimeric or multiprotein complexes. Members of this family are involved in a variety of cellular processes, including cell cycle progression, signal transduction, Apoptosis, and gene regulation. This protein is highly similar to the mouse WD repeat domain 12 protein at the amino acid level. The protein encoded by this gene is a component of a nucleolar protein complex that affects maturation of the large ribosomal subunit.[provided by RefSeq, Dec 2008]

WDR12 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001371664.1 NP_001358593.1 ribosome biogenesis protein WDR12 isoform 2
NM_018256.4 NP_060726.3 ribosome biogenesis protein WDR12 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16043514 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of PeBoW complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
16043514 GOA
located in nucleolus IDA
IDA: 通过直接分析推断
16043514 GOA
located in nucleoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
16043514 GOA
part of preribosome, large subunit precursor IDA
IDA: 通过直接分析推断
17353269 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

WDR12 蛋白结构

NLE

NLE: NLE (NUC135) domain (3 - 70)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (100 - 127)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (131 - 171)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (182 - 217)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (248 - 284)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (289 - 325)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (337 - 371)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (378 - 409)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 423 a.a.
蛋白主名 其他名称

ribosome biogenesis protein WDR12

WD repeat-containing protein 12

WDR12 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
WDR12 Q9GZL7 BOP1 Homo sapiens Q14137 35271311
种属内
WDR12 Q9GZL7 PES1 Homo sapiens O00541 35271311
种属内
WDR12 Q9GZL7 PES1 Homo sapiens O00541 16043514
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus WDR12 MGD MGI:1927241
Rattus norvegicus WDR12 RGD RGD:735072
Bos taurus WDR12 VGNC VGNC:36882
Canis familiaris WDR12 VGNC VGNC:48351
Felis catus WDR12 VGNC VGNC:67015