TRIM7 - tripartite motif containing 7 Gene

中文名称：含三方基序 7

种属: Homo sapiens

同用名: GNIP; RNF90

基因 ID: 81786 | 基因类型: protein coding

关于 TRIM7

Cytogenetic location: 5q35.3 Genomic coordinates (GRCh38): 5:181,193,924-181,205,196 (from NCBI)

This gene has 7 transcripts (splice variants), 178 orthologues and 80 paralogues. Biased expression in skin (RPKM 5.6), esophagus (RPKM 2.8) and 8 other tissues.

功能概要

由该基因编码的蛋白质是三联基序 (TRIM) 家族的成员。 TRIM 基序包括三个锌结合域、一个 RING、一个 B-box 类型 1、一个 B-box 类型 2 和一个卷曲螺旋区域。该蛋白质定位于细胞核和细胞质，可能代表参与糖原合成的启动。可变剪接导致多个转录本变体。[RefSeq 提供，2013 年 7 月]

The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1, a B-box type 2, and a coiled-coil region. The protein localizes to both the nucleus and the cytoplasm, and may represent a participant in the initiation of glycogen synthesis. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2013]

TRIM7 基因产物(6)

mRNA	Protein	Name
NM_033342.4	NP_203128.1	E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7 isoform 4
NM_203293.3	NP_976038.1	E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7 isoform 1
NM_203294.2	NP_976039.1	E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7 isoform 3
NM_203295.2	NP_976040.1	E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7 isoform 3
NM_203296.2	NP_976041.1	E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7 isoform 3
NM_203297.2	NP_976042.1	E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7 isoform 2

基因本体论

分子功能
生物过程
细胞组分

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	25416956	GOA
enables ubiquitin protein ligase activity	IDA IDA: 通过直接分析推断	35893676	GOA

生物过程 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
involved in antiviral innate immune response	IDA IDA: 通过直接分析推断	35893676	GOA

细胞组分 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
is active in cytoplasm	IDA IDA: 通过直接分析推断	35893676	GOA
located in cytoplasm	IDA IDA: 通过直接分析推断	11331580	GOA
located in nucleus	IDA IDA: 通过直接分析推断	11331580	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

TRIM7 蛋白结构

zf-C3HC4_4

zf-B_box

PRY

SPRY

0
100
200
300
400
511 a.a.

蛋白主名

其他名称

E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7

RING finger protein 90

TRIM7 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
种属内	TRIM7	Q9C029	CFL2	Homo sapiens	Q9Y281	Validated Y2H	32296183
种属内	TRIM7	Q9C029	IRAK4	Homo sapiens	Q9NWZ3	Validated Y2H	32296183
种属内	TRIM7	Q9C029	CTNNAL1	Homo sapiens	Q9UBT7	Validated Y2H	32296183
种属内	TRIM7	Q9C029	SIAH1	Homo sapiens	Q8IUQ4	Validated Y2H	25416956
种属内	TRIM7	Q9C029	SIAH1	Homo sapiens	Q8IUQ4	Y2H Array	25416956
种属内	TRIM7	Q9C029	RSPH14	Homo sapiens	Q9UHP6	Validated Y2H	32296183
种属内	TRIM7	Q9C029	MAD2L2	Homo sapiens	Q9UI95	Validated Y2H	32296183

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称

别名

Noonan Syndrome 7

NS7	Noonan Syndrome, Type 7

疾病名称	别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia	Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-159082	E3 ligase Ligand 28		/	否
HY-RS15069	TRIM7 Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Bos taurus	TRIM7	VGNC	VGNC:36351
Felis catus	TRIM7	VGNC	VGNC:66552
Macaca mulatta	TRIM7	VGNC	VGNC:79022
Rattus norvegicus	TRIM7	RGD	RGD:1307328
Mus musculus	TRIM7	MGD	MGI:2137353
Canis familiaris	TRIM7	VGNC	VGNC:47836
Others	TRIM7	NCBI

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