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FRMD5 - FERM domain containing 5 Gene

中文名称:含 FERM 域 5

种属: Homo sapiens

同用名: NEDEMA

基因 ID: 84978 | 基因类型: protein coding

关于 FRMD5

Cytogenetic location: 15q15.3 Genomic coordinates (GRCh38): 15:43,870,764-44,199,473 (from NCBI)

This gene has 12 transcripts (splice variants), 306 orthologues and 10 paralogues. Biased expression in brain (RPKM 6.9), heart (RPKM 4.6) and 4 other tissues.

功能概要

启用整合素结合活性和蛋白激酶结合活性。参与细胞运动的负调节;细胞粘附的正向调节;和细胞迁移的调节。位于 adherens 路口。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Enables Integrin binding activity and protein kinase binding activity. Involved in negative regulation of cell motility; positive regulation of cell adhesion; and regulation of cell migration. Located in adherens junction. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

FRMD5 基因产物(7)

mRNA Protein Name
NM_001286490.2 NP_001273419.1 FERM domain-containing protein 5 isoform 3
NM_001286491.2 NP_001273420.1 FERM domain-containing protein 5 isoform 4
NM_001322949.2 NP_001309878.1 FERM domain-containing protein 5 isoform 6
NM_001322950.2 NP_001309879.1 FERM domain-containing protein 5 isoform 7
NM_001322951.2 NP_001309880.1 FERM domain-containing protein 5 isoform 8
NM_001411124.1 NP_001398053.1 FERM domain-containing protein 5 isoform 9
NM_032892.5 NP_116281.2 FERM domain-containing protein 5 isoform 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables integrin binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
25448675 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
22846708 GOA
enables protein kinase binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
25448675 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of cell motility IMP
IMP: 通过突变表型推断
25448675 GOA
involved in positive regulation of cell adhesion IMP
IMP: 通过突变表型推断
25448675 GOA
involved in regulation of cell migration IMP
IMP: 通过突变表型推断
22846708 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in adherens junction IDA
IDA: 通过直接分析推断
22846708 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

FRMD5 蛋白结构

FERM_N

FERM_N: FERM N-terminal domain (21 - 98)

FERM_M

FERM_M: FERM central domain (100 - 210)

FERM_C

FERM_C: FERM C-terminal PH-like domain (216 - 300)

FA

FA: FERM adjacent (FA) (308 - 353)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 570 a.a.
蛋白主名 其他名称

FERM domain-containing protein 5

FRMD5 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
FRMD5 Q7Z6J6 ITGB5 Homo sapiens P18084
Anti Tag CoIP
25448675
种属内
FRMD5 Q7Z6J6 CTNND1 Homo sapiens O60716
Anti Bait CoIP
22846708
种属内
FRMD5 Q7Z6J6 CTNND1 Homo sapiens O60716
IF
22846708
种属内
FRMD5 Q7Z6J6 CTNND1 Homo sapiens O60716
Anti Tag CoIP
22846708
种属内
FRMD5 Q7Z6J6 ROCK1 Homo sapiens Q13464
Anti Bait CoIP
25448675
种属内
FRMD5 Q7Z6J6 ROCK1 Homo sapiens Q13464
Anti Tag CoIP
25448675
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus FRMD5 VGNC VGNC:29116
Canis familiaris FRMD5 VGNC VGNC:40982
Macaca mulatta FRMD5 VGNC VGNC:72797
Felis catus FRMD5 VGNC VGNC:62362
Rattus norvegicus FRMD5 RGD RGD:1561554
Mus musculus FRMD5 MGD MGI:2442557