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SYNGR2 - synaptogyrin 2 Gene

中文名称:突触蛋白 2

种属: Homo sapiens

基因 ID: 9144 | 基因类型: protein coding

关于 SYNGR2

Cytogenetic location: 17q25.3 Genomic coordinates (GRCh38): 17:78,168,545-78,172,964 (from NCBI)

This gene has 9 transcripts (splice variants), 267 orthologues and 3 paralogues. Ubiquitous expression in prostate (RPKM 65.0), lung (RPKM 62.5) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码一种完整的膜蛋白,包含四个跨膜区和一个酪氨酸磷酸化的 C 末端胞质尾部。这种蛋白质的确切功能尚不清楚,但对类似大鼠蛋白质的研究表明,它可能在调节非神经元细胞的膜交通方面发挥作用。该基因属于突触蛋白基因家族。可变剪接导致多个转录本变体。[RefSeq 提供,2016 年 2 月]

This gene encodes an integral membrane protein containing four transmembrane regions and a C-terminal cytoplasmic tail that is tyrosine phosphorylated. The exact function of this protein is unclear, but studies of a similar rat protein suggest that it may play a role in regulating membrane traffic in non-neuronal cells. The gene belongs to the synaptogyrin gene family. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2016]

SYNGR2 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001320523.2 NP_001307452.1 synaptogyrin-2 isoform 2
NM_001363778.1 NP_001350707.1 synaptogyrin-2 isoform 3
NM_004710.7 NP_004701.1 synaptogyrin-2 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25416956 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

SYNGR2 蛋白结构

MARVEL

MARVEL: Membrane-associating domain (20 - 163)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 224 a.a.
蛋白主名 其他名称

synaptogyrin-2

cellugyrin

SYNGR2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SYNGR2 O43760 SCARA3 Homo sapiens Q6AZY7
Y2H Array
25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus SYNGR2 RGD RGD:621334
Mus musculus SYNGR2 MGD MGI:1328324
Bos taurus SYNGR2 VGNC VGNC:107278