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TMEM88 - transmembrane protein 88 Gene

中文名称:跨膜蛋白 88

种属: Homo sapiens

基因 ID: 92162 | 基因类型: protein coding

关于 TMEM88

Cytogenetic location: 17p13.1 Genomic coordinates (GRCh38): 17:7,855,066-7,856,099 (from NCBI)

This gene has 2 transcripts (splice variants) and 90 orthologues. Broad expression in fat (RPKM 7.7), placenta (RPKM 7.1) and 23 other tissues.

功能概要

预测启用 PDZ 域绑定活动。参与经典 Wnt 信号通路的负调控;蛋白质定位于质膜;和蛋白质稳定。位于胞质溶胶和质膜中。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Predicted to enable PDZ domain binding activity. Involved in negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; protein localization to plasma membrane; and protein stabilization. Located in cytosol and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

TMEM88 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001319941.1 NP_001306870.1 transmembrane protein 88 isoform 2
NM_203411.2 NP_981956.1 transmembrane protein 88 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
26359454 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of canonical Wnt signaling pathway IDA
IDA: 通过直接分析推断
26359454 GOA
involved in negative regulation of canonical Wnt signaling pathway IMP
IMP: 通过突变表型推断
21044957 GOA
involved in protein localization to plasma membrane IGI
IGI: 通过遗传相互作用推断
21044957 GOA
involved in protein stabilization IGI
IGI: 通过遗传相互作用推断
26359454 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytosol IDA
IDA: 通过直接分析推断
26359454 GOA
located in plasma membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
21044957 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断
蛋白主名 其他名称

transmembrane protein 88

TMEM88 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra TMEM88 Q6PEY1 ZDHHC22 Homo sapiens Q8N966
Validated Y2H
32296183
Intra TMEM88 Q6PEY1 MFF Homo sapiens Q9GZY8-5
Validated Y2H
32296183
Intra TMEM88 Q6PEY1 VRK2 Homo sapiens Q86Y07
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus TMEM88 VGNC VGNC:36120
Mus musculus TMEM88 MGD MGI:1914270
Macaca mulatta TMEM88 VGNC VGNC:79922
Felis catus TMEM88 VGNC VGNC:99561
Canis familiaris TMEM88 VGNC VGNC:47611
Rattus norvegicus TMEM88 RGD RGD:1561781