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SYTL5 - synaptotagmin like 5 Gene

中文名称:突触结合蛋白 5

种属: Homo sapiens

同用名: slp5

基因 ID: 94122 | 基因类型: protein coding

关于 SYTL5

This gene has 2 transcripts (splice variants), 206 orthologues and 31 paralogues. Broad expression in stomach (RPKM 4.3), placenta (RPKM 2.5) and 17 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白属于突触结合蛋白样 (Slp) 蛋白家族,其 N 端含有一个独特的同源结构域,称为 Slp 同源结构域 (SHD) 。 SHD 充当 Rab27A 的结合位点,在蛋白质转运中发挥作用。该基因的表达仅限于胎盘和肝脏,表明它可能参与特定组织中依赖于 Rab27A 的膜运输。已发现该基因编码不同亚型的可变剪接转录物变体。[RefSeq 提供,2009 年 9 月]

The protein encoded by this gene belongs to the synaptotagmin-like (Slp) protein family, which contains a unique homology domain at the N-terminus, referred to as the Slp homology domain (SHD). The SHD functions as a binding site for Rab27A, which plays a role in protein transport. Expression of this gene is restricted to placenta and liver, suggesting that it might be involved in Rab27A-dependent membrane trafficking in specific tissues. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2009]

SYTL5 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001163334.1 NP_001156806.1 synaptotagmin-like protein 5 isoform 2
NM_001163335.2 NP_001156807.1 synaptotagmin-like protein 5 isoform 1
NM_138780.3 NP_620135.1 synaptotagmin-like protein 5 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
12051743 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

SYTL5 蛋白结构

FYVE_2

FYVE_2: FYVE-type zinc finger (13 - 123)

C2

C2: C2 domain (424 - 510)

C2

C2: C2 domain (589 - 677)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 730 a.a.
蛋白主名 其他名称

synaptotagmin-like protein 5

exophilin 9

SYTL5 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SYTL5 Q8TDW5 RAB27B Homo sapiens O00194 25416956
种属内
SYTL5 Q8TDW5 RAB27B Homo sapiens O00194 33961781
种属内
SYTL5 Q8TDW5 RAB27B Homo sapiens O00194 25416956
种属内
SYTL5 Q8TDW5 RAB27B Homo sapiens O00194 25416956
种属间
SYTL5 Q8TDW5 Rab27a Mus musculus Q9ERI2 12051743
种属间
SYTL5 Q8TDW5 Rab3a Mus musculus P63011 12051743
种属间
SYTL5 Q8TDW5 Rab6a Mus musculus P35279 12051743
种属间
SYTL5 Q8TDW5 Rab6a Mus musculus P35279 12051743
种属内
SYTL5 Q8TDW5 CEP70 Homo sapiens Q8NHQ1 25416956
种属内
SYTL5 Q8TDW5 CEP70 Homo sapiens Q8NHQ1 25416956
种属内
SYTL5 Q8TDW5 WAC Homo sapiens Q9BTA9 25416956
种属内
SYTL5 Q8TDW5 WAC Homo sapiens Q9BTA9 25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus SYTL5 RGD RGD:631342
Macaca mulatta SYTL5 VGNC VGNC:78125
Canis familiaris SYTL5 VGNC VGNC:47054
Bos taurus SYTL5 VGNC VGNC:35549
Mus musculus SYTL5 MGD MGI:2668451
Felis catus SYTL5 VGNC VGNC:65908