1. Gene
  2. FTSJ3 - FtsJ RNA 2'-O-methyltransferase 3 Gene

FTSJ3 - FtsJ RNA 2'-O-methyltransferase 3 Gene

中文名称:FtsJ RNA 2'-O-甲基转移酶 3

种属: Homo sapiens

同用名: SPB1; EPCS3

基因 ID: 117246 | 基因类型: protein coding

关于 FTSJ3

Cytogenetic location: 17q23.3 Genomic coordinates (GRCh38): 17:63,819,433-63,827,663 (from NCBI)

This gene has 16 transcripts (splice variants), 211 orthologues and 2 paralogues. Ubiquitous expression in kidney (RPKM 14.7), lymph node (RPKM 12.1) and 25 other tissues.

功能概要

虽然该基因的功能尚不清楚,但该基因的存在得到了 mRNA 和 EST 数据的支持。可以从与大肠杆菌 FtsJ 蛋白和可能参与胚胎发生的小鼠蛋白的氨基酸序列相似性推断编码蛋白的可能功能。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

Although the function of this gene is not known, the existence of this gene is supported by mRNA and EST data. A possible function of the encoded protein can be inferred from amino acid sequence similarity to the E.coli FtsJ protein and to a mouse protein possibly involved in embryogenesis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

FTSJ3 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_017647.4 NP_060117.3 pre-rRNA 2'-O-ribose RNA methyltransferase FTSJ3
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables RNA 2'-O-methyltransferase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
30626973 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21903422 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in RNA methylation IDA
IDA: 通过直接分析推断
30626973 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

FTSJ3 蛋白结构

FtsJ

FtsJ: FtsJ-like methyltransferase (24 - 200)

DUF3381

DUF3381: Domain of unknown function (DUF3381) (232 - 397)

Spb1_C

Spb1_C: Spb1 C-terminal domain (624 - 841)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 800
  • 847 a.a.
蛋白主名 其他名称

pre-rRNA 2'-O-ribose RNA methyltransferase FTSJ3

2'-O-ribose RNA methyltransferase SPB1 homolog

FTSJ3 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra FTSJ3 Q8IY81 SSX2 Homo sapiens Q16385-2
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra FTSJ3 Q8IY81 SSX2 Homo sapiens Q16385-2
Y2H Array
32296183
Intra FTSJ3 Q8IY81 H1-4 Homo sapiens P10412
Crosslink
30021884
Intra FTSJ3 Q8IY81 H1-2 Homo sapiens P16403
Crosslink
30021884
Intra FTSJ3 Q8IY81 OAS3 Homo sapiens Q9Y6K5
Anti Tag CoIP
21903422
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Canis familiaris FTSJ3 VGNC VGNC:41004
Bos taurus FTSJ3 VGNC VGNC:29139
Felis catus FTSJ3 VGNC VGNC:62386
Mus musculus FTSJ3 MGD MGI:1860295
Macaca mulatta FTSJ3 VGNC VGNC:72734
Rattus norvegicus FTSJ3 RGD RGD:1307110