1. Gene
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RAVER1 - ribonucleoprotein, PTB binding 1 Gene

中文名称:核糖核蛋白,PTB 结合 1

种属: Homo sapiens

基因 ID: 125950 | 基因类型: protein coding

关于 RAVER1

Cytogenetic location: 19p13.2 Genomic coordinates (GRCh38): 19:10,316,212-10,333,529 (from NCBI)

This gene has 7 transcripts (splice variants), 194 orthologues and 7 paralogues. Ubiquitous expression in spleen (RPKM 11.2), bone marrow (RPKM 11.0) and 25 other tissues.

功能概要

启用 RNA 结合活性。预计通过剪接体参与调节 mRNA 的选择性剪接。预计位于细胞质中。预计活跃于核心。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Enables RNA binding activity. Predicted to be involved in regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome. Predicted to be located in cytoplasm. Predicted to be active in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

RAVER1 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001366174.1 NP_001353103.1 ribonucleoprotein PTB-binding 1 isoform 2
NM_133452.3 NP_597709.3 ribonucleoprotein PTB-binding 1 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
18377426 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

RAVER1 蛋白结构

(78 - 132)

RRM_1

RRM_1: RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) (152 - 220)

(241 - 310)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 756 a.a.
蛋白主名 其他名称

ribonucleoprotein PTB-binding 1

protein raver-1

RAVER1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra RAVER1 Q8IY67 TOB1 Homo sapiens P50616
TAP
18377426
Intra RAVER1 Q8IY67 GRAP2 Homo sapiens O75791
Y2H Array
32296183
Intra RAVER1 Q8IY67 GRAP2 Homo sapiens O75791
Y2H Prey Pooling
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta RAVER1 VGNC VGNC:101482
Rattus norvegicus RAVER1 RGD RGD:1359190
Felis catus RAVER1 VGNC VGNC:102686
Canis familiaris RAVER1 VGNC VGNC:108253
Bos taurus RAVER1 VGNC VGNC:55304
Mus musculus RAVER1 MGD MGI:1919016