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HDX - highly divergent homeobox Gene

中文名称:高度分化的同源框

种属: Homo sapiens

同用名: CXorf43; D030011N01Rik

基因 ID: 139324 | 基因类型: protein coding

关于 HDX

Cytogenetic location: Xq21.1 Genomic coordinates (GRCh38): X:84,317,878-84,502,453 (from NCBI)

This gene has 6 transcripts (splice variants), 200 orthologues and 17 paralogues. Low expression observed in reference dataset.

功能概要

预测可实现 DNA 结合转录因子活性、RNA 聚合酶 II 特异性和 RNA 聚合酶 II 顺式调节区序列特异性 DNA 结合活性。预计参与 RNA 聚合酶 II 的转录调控。预测位于核内。预测是染色质的一部分。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to be located in nucleus. Predicted to be part of chromatin. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

HDX 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001177478.2 NP_001170949.1 highly divergent homeobox isoform 2
NM_001177479.2 NP_001170950.1 highly divergent homeobox isoform 1
NM_144657.5 NP_653258.2 highly divergent homeobox isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
20211142 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

HDX 蛋白结构

Homeobox

Homeobox: Homeobox domain (438 - 495)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 690 a.a.
蛋白主名 其他名称

highly divergent homeobox

HDX 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
HDX Q7Z353 MID2 Homo sapiens Q9UJV3-2
Validated Y2H
32296183
种属内
HDX Q7Z353 BOLA1 Homo sapiens Q9Y3E2
Validated Y2H
32296183
种属内
HDX Q7Z353 CTNNA3 Homo sapiens Q9UI47-2
Validated Y2H
32296183
种属内
HDX Q7Z353 LNX1 Homo sapiens Q8TBB1
Validated Y2H
32296183
种属内
HDX Q7Z353 SUFU Homo sapiens Q9UMX1
Validated Y2H
32296183
种属内
HDX Q7Z353 RTN4IP1 Homo sapiens Q8WWV3
Validated Y2H
32296183
种属内
HDX Q7Z353 TSGA10 Homo sapiens Q9BZW7
Validated Y2H
32296183
种属内
HDX Q7Z353 GCC1 Homo sapiens Q96CN9
Validated Y2H
32296183
种属内
HDX Q7Z353 FHL5 Homo sapiens Q5TD97
Y2H Array
32296183
种属内
HDX Q7Z353 FHL5 Homo sapiens Q5TD97
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
HDX Q7Z353 TTC5 Homo sapiens Q8N0Z6
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus HDX VGNC VGNC:106765
Macaca mulatta HDX VGNC VGNC:73242
Canis familiaris HDX VGNC VGNC:41632
Rattus norvegicus HDX RGD RGD:1563666
Felis catus HDX VGNC VGNC:62775
Mus musculus HDX MGD MGI:2685226