1. Gene
  2. COMMD6 - COMM domain containing 6 Gene

COMMD6 - COMM domain containing 6 Gene

中文名称:含 COMM 域 6

种属: Homo sapiens

同用名: Acrg

基因 ID: 170622 | 基因类型: protein coding

关于 COMMD6

Cytogenetic location: 13q22.2 Genomic coordinates (GRCh38): 13:75,525,214-75,549,439 (from NCBI)

This gene has 13 transcripts (splice variants), 178 orthologues and 2 paralogues. Ubiquitous expression in ovary (RPKM 31.5), adrenal (RPKM 27.0) and 25 other tissues.

功能概要

COMMD6 属于 NF-kappa-B 家族 (参见 RELA;MIM 164014) - 以存在 COMM 结构域为特征的抑制蛋白 (参见 COMMD1;MIM 607238) (de Bie 等人,2006 [PubMed 16573520]) 。[OMIM 提供,2009 年 3 月]

COMMD6 belongs to a family of NF-kappa-B (see RELA; MIM 164014)-inhibiting proteins characterized by the presence of a COMM domain (see COMMD1; MIM 607238) (de Bie et al., 2006 [PubMed 16573520]).[supplied by OMIM, Mar 2009]

COMMD6 基因产物(5)

mRNA Protein Name
NM_001287392.2 NP_001274321.1 COMM domain-containing protein 6 isoform c
NM_001287393.2 NP_001274322.1 COMM domain-containing protein 6 isoform c
NM_001287394.2 NP_001274323.1 COMM domain-containing protein 6 isoform c
NM_203495.4 NP_987091.1 COMM domain-containing protein 6 isoform b
NM_203497.4 NP_987093.1 COMM domain-containing protein 6 isoform a
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables NF-kappaB binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16573520 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
15799966 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
acts upstream of or within negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
16573520 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

COMMD6 蛋白结构

COMM_domain

COMM_domain: COMM domain (13 - 84)

  • 0
  • 85 a.a.
蛋白主名 其他名称

COMM domain-containing protein 6

Acrg embryonic lethality minimal region ortholog

COMMD6 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 CCDC93 Homo sapiens Q567U6 35271311
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 CCDC93 Homo sapiens Q567U6 37172566
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 CCDC93 Homo sapiens Q567U6 25355947
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 CCDC93 Homo sapiens Q567U6 33961781
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 COMMD1 Homo sapiens Q8N668 32296183
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 COMMD1 Homo sapiens Q8N668 32296183
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 COMMD1 Homo sapiens Q8N668 25416956
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 COMMD1 Homo sapiens Q8N668 32296183
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 COMMD1 Homo sapiens Q8N668 23563313
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 COMMD9 Homo sapiens Q9P000 35271311
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 COMMD9 Homo sapiens Q9P000 37172566
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 COMMD9 Homo sapiens Q9P000 32296183
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 COMMD9 Homo sapiens Q9P000 33961781
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 HSPA6 Homo sapiens P17066 32296183
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 HSPA6 Homo sapiens P17066 32296183
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 CCDC22 Homo sapiens O60826 37172566
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 CCDC22 Homo sapiens O60826 33961781
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 CCDC22 Homo sapiens O60826 23563313
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 CCDC22 Homo sapiens O60826 23563313
种属内
COMMD6 Q7Z4G1 CCDC22 Homo sapiens O60826 35271311
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus COMMD6 VGNC VGNC:61076
Mus musculus COMMD6 MGD MGI:1913450
Canis familiaris COMMD6 VGNC VGNC:54288
Rattus norvegicus COMMD6 RGD RGD:1560745
Macaca mulatta COMMD6 VGNC VGNC:103800