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RNF169 - ring finger protein 169 Gene

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中文名称：无名指蛋白 169

种属: Homo sapiens

基因 ID: 254225 | 基因类型: protein coding

关于 RNF169

Cytogenetic location: 11q13.4 Genomic coordinates (GRCh38): 11:74,748,849-74,842,413 (from NCBI)

This gene has 2 transcripts (splice variants), 199 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in esophagus (RPKM 6.7), bone marrow (RPKM 6.4) and 25 other tissues.

功能概要

启用 K63 连接的多聚泛素修饰依赖性蛋白结合活性和核小体结合活性。参与细胞对 DNA 损伤刺激的反应和双链断裂修复的负调节。位于胞质溶胶中；核腔;和双链断裂位点。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding activity and nucleosome binding activity. Involved in cellular response to DNA damage stimulus and negative regulation of double-strand break repair. Located in cytosol; nuclear lumen; and site of double-strand break. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

RNF169 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_001098638.2 NP_001092108.1 E3 ubiquitin-protein ligase RNF169
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
22492721 GOA
enables nucleosome binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
22742833 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
32296183 GOA
enables ubiquitin-modified histone reader activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
22492721 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in DNA damage response IDA
IDA: 通过直接分析推断
22733822 GOA
involved in DNA damage response IMP
IMP: 通过突变表型推断
22492721 GOA
involved in double-strand break repair via homologous recombination IDA
IDA: 通过直接分析推断
22492721 GOA
involved in negative regulation of double-strand break repair IDA
IDA: 通过直接分析推断
22742833 GOA
involved in negative regulation of double-strand break repair IMP
IMP: 通过突变表型推断
22492721 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in nucleoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
22492721 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
22733822 GOA
located in site of double-strand break IDA
IDA: 通过直接分析推断
22492721 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

RNF169 蛋白结构

zf-C3HC4_3

zf-C3HC4_3: Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) (66 - 108)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 708 a.a.
蛋白主名 其他名称

E3 ubiquitin-protein ligase RNF169

RING-type E3 ubiquitin transferase RNF169

RNF169 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra RNF169 Q8NCN4 HOOK2 Homo sapiens Q96ED9-2
Y2H Array
32296183
Intra RNF169 Q8NCN4 HOOK2 Homo sapiens Q96ED9-2
Validated Y2H
32296183
Intra RNF169 Q8NCN4 HOOK2 Homo sapiens Q96ED9-2
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNF169 Q8NCN4 PIBF1 Homo sapiens Q4G0R1
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNF169 Q8NCN4 PIBF1 Homo sapiens Q4G0R1
Y2H Array
32296183
Intra RNF169 Q8NCN4 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Y2H Array
32296183
Intra RNF169 Q8NCN4 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNF169 Q8NCN4 HSF2BP Homo sapiens O75031
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNF169 Q8NCN4 HSF2BP Homo sapiens O75031
Y2H Array
32296183
Intra RNF169 Q8NCN4 CEP70 Homo sapiens Q8NHQ1
Validated Y2H
32296183
Intra RNF169 Q8NCN4 CEP70 Homo sapiens Q8NHQ1
Y2H Array
32296183
Intra RNF169 Q8NCN4 CEP70 Homo sapiens Q8NHQ1
Y2H Prey Pooling
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS12063 RNF169 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus RNF169 VGNC VGNC:34034
Felis catus RNF169 VGNC VGNC:104325
Canis familiaris RNF169 VGNC VGNC:45644
Macaca mulatta RNF169 VGNC VGNC:107634
Mus musculus RNF169 MGD MGI:1920257
Rattus norvegicus RNF169 RGD RGD:1583288
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