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GATC - glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C Gene

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中文名称：谷氨酰 tRNA 氨基转移酶 C 亚基

种属: Homo sapiens

同用名: 15E1.2; COXPD42

基因 ID: 283459 | 基因类型: protein coding

关于 GATC

Cytogenetic location: 12q24.31 Genomic coordinates (GRCh38): 12:120,446,444-120,463,749 (from NCBI)

This gene has 3 transcripts (splice variants), 194 orthologues and is associated with 1 phenotype. Ubiquitous expression in thyroid (RPKM 15.5), lymph node (RPKM 14.0) and 25 other tissues.

功能概要

启用谷氨酰胺酰-tRNA 合酶 (谷氨酰胺水解) 活性。通过转酰胺作用和线粒体翻译参与谷氨酰胺酰-tRNAGln 生物合成。位于线粒体中。谷氨酰-tRNA (Gln) 氨基转移酶复合物的一部分。涉及联合氧化磷酸化缺陷 42。[由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables glutaminyl-tRNA synthase (glutamine-hydrolyzing) activity. Involved in glutaminyl-tRNAGln biosynthesis via transamidation and mitochondrial translation. Located in mitochondrion. Part of glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase complex. Implicated in combined Oxidative Phosphorylation deficiency 42. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

GATC 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_176818.3 NP_789788.1 glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
19805282 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in glutaminyl-tRNAGln biosynthesis via transamidation IDA
IDA: 通过直接分析推断
19805282 GOA
involved in mitochondrial translation IMP
IMP: 通过突变表型推断
19805282 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
19805282 GOA
part of glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
19805282 GOA
located in mitochondrion IDA
IDA: 通过直接分析推断
19805282 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

GATC 蛋白结构

Glu-tRNAGln

Glu-tRNAGln: Glu-tRNAGln amidotransferase C subunit (52 - 116)

  • 0
  • 100
  • 136 a.a.
蛋白主名 其他名称

glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial

glu-AdT subunit C

GATC 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra GATC O43716 CTAG1A Homo sapiens P78358
Validated Y2H
32296183
Intra GATC O43716 CTAG1A Homo sapiens P78358
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra GATC O43716 CTAG1A Homo sapiens P78358
Y2H Array
32296183
Intra GATC O43716 TOMM20L Homo sapiens Q6UXN7
Validated Y2H
32296183
Intra GATC O43716 TOMM20L Homo sapiens Q6UXN7
Y2H Array
32296183
Intra GATC O43716 TOMM20L Homo sapiens Q6UXN7
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra GATC O43716 SRSF11 Homo sapiens Q05519-2
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra GATC O43716 SRSF11 Homo sapiens Q05519-2
Validated Y2H
32296183
Intra GATC O43716 SRSF11 Homo sapiens Q05519-2
Y2H Array
32296183
Intra GATC O43716 QRSL1 Homo sapiens Q9H0R6
Anti Tag CoIP
33961781
Intra GATC O43716 QRSL1 Homo sapiens Q9H0R6
Anti Tag CoIP
28514442
Intra GATC O43716 QRSL1 Homo sapiens Q9H0R6
GMS
19805282
Intra GATC O43716 ALOX5 Homo sapiens P09917
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra GATC O43716 ALOX5 Homo sapiens P09917
Validated Y2H
32296183
Intra GATC O43716 ALOX5 Homo sapiens P09917
Y2H Array
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Combined Oxidative Phosphorylation Deficiency 42

COXPD42
Combined Oxidative Phosphorylation Deficiency
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Cutaneous Infectious Botulism

Cutaneous Toxin-Mediated Botulism

Inoculation Botulism

Skin Infectious Botulism

Skin Toxin-Mediated Botulism
Lactic Acidosis

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疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

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Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

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Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-150741 ODN 2216 / 否
HY-RS05299 GATC Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus GATC MGD MGI:1923776
Rattus norvegicus GATC RGD RGD:1309698
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