1. Gene
  2. GTF2A2 - general transcription factor IIA subunit 2 Gene

GTF2A2 - general transcription factor IIA subunit 2 Gene

中文名称:一般转录因子 IIA 亚基 2

种属: Homo sapiens

同用名: TF2A2; TFIIA; T18745; TFIIAS; HsT18745; TFIIA-12; TFIIA-gamma

基因 ID: 2958 | 基因类型: protein coding

关于 GTF2A2

Cytogenetic location: 15q22.2 Genomic coordinates (GRCh38): 15:59,638,062-59,657,515 (from NCBI)

This gene has 10 transcripts (splice variants) and 184 orthologues. Broad expression in testis (RPKM 46.4), colon (RPKM 13.2) and 24 other tissues.

功能概要

包含 TATA 的 II 类基因的准确转录起始涉及 RNA 聚合酶 II (POLR2A;MIM 180660) 和一般起始因子 TFIIA、TFIIB (MIM 189963) 、TFIID (MIM 313650) 、TFIIE (MIM 189962) 、TFIIF 的有序组装 (MIM 189968) 、TFIIG/TFIIJ 和 TFIIH (MIM 189972) 。第一步涉及通过 TATA 结合亚基 (TBP;MIM 600075) 识别 TATA 元件,并且可能受 TFIIA 调节,TFIIA 是一种与 TFIID 中的 TBP 和 TBP 相关因子 (TAF;MIM 600475) 相互作用的因子。 TFIIA 在酵母中有 2 个亚基 (43 和 12 kD) ,在高等真核生物中有 3 个亚基。在 HeLa 提取物中,它由分别由 GTF2A1 (MIM 600520) 的 N 和 C 末端区域编码的 35-kD α 亚基和 19-kD β 亚基以及由 GTF2A2 编码的 12-kD γ 亚基组成 ( DeJong 等人,1995 [PubMed 7724559]) .[OMIM 提供,2008 年 3 月]

Accurate transcription initiation on TATA-containing class II genes involves the ordered assembly of RNA polymerase II (POLR2A; MIM 180660) and the general initiation factors TFIIA, TFIIB (MIM 189963), TFIID (MIM 313650), TFIIE (MIM 189962), TFIIF (MIM 189968), TFIIG/TFIIJ, and TFIIH (MIM 189972). The first step involves recognition of the TATA element by the TATA-binding subunit (TBP; MIM 600075) and may be regulated by TFIIA, a factor that interacts with both TBP and a TBP-associated factor (TAF; MIM 600475) in TFIID. TFIIA has 2 subunits (43 and 12 kD) in yeast and 3 subunits in higher eukaryotes. In HeLa extracts, it consists of a 35-kD alpha subunit and a 19-kD beta subunit encoded by the N- and C-terminal regions of GTF2A1 (MIM 600520), respectively, and a 12-kD gamma subunit encoded by GTF2A2 (DeJong et al., 1995 [PubMed 7724559]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

GTF2A2 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001320929.2 NP_001307858.1 transcription initiation factor IIA subunit 2
NM_001320930.2 NP_001307859.1 transcription initiation factor IIA subunit 2
NM_004492.3 NP_004483.1 transcription initiation factor IIA subunit 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables RNA polymerase II general transcription initiation factor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
7958899 GOA
enables RNA polymerase II general transcription initiation factor binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
8626665 GOA
enables TBP-class protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
7724559 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
7724559 GOA
enables protein heterodimerization activity IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
8626665 GOA
enables protein homodimerization activity IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
8626665 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
10022900 GOA
part of transcription factor TFIIA complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
7724559 GOA
part of transcription factor TFIIA complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
8626665 GOA
part of transcription factor TFIID complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
27193682 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

GTF2A2 蛋白结构

TFIIA_gamma_N

TFIIA_gamma_N: Transcription initiation factor IIA, gamma subunit, helical domain (1 - 49)

TFIIA_gamma_C

TFIIA_gamma_C: Transcription initiation factor IIA, gamma subunit (51 - 100)

  • 0
  • 100
  • 109 a.a.
蛋白主名 其他名称

transcription initiation factor IIA subunit 2

TFIIA gamma subunit

GTF2A2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
GTF2A2 P52657 TRIM7 Homo sapiens Q9C029 32296183
种属内
GTF2A2 P52657 TRIM7 Homo sapiens Q9C029 32296183
种属内
GTF2A2 P52657 TRIM7 Homo sapiens Q9C029 32296183
种属内
GTF2A2 P52657 TBP Homo sapiens P20226 33961781
种属内
GTF2A2 P52657 TBP Homo sapiens P20226 8626665
种属内
GTF2A2 P52657 TBP Homo sapiens P20226 7724559
种属内
GTF2A2 P52657 GTF2A1 Homo sapiens P52655 32296183
种属内
GTF2A2 P52657 GTF2A1 Homo sapiens P52655 33961781
种属内
GTF2A2 P52657 GTF2A1 Homo sapiens P52655 31515488
种属内
GTF2A2 P52657 GTF2A1 Homo sapiens P52655 32296183
种属内
GTF2A2 P52657 GTF2A1 Homo sapiens P52655 25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus GTF2A2 VGNC VGNC:67492
Bos taurus GTF2A2 VGNC VGNC:29692
Rattus norvegicus GTF2A2 RGD RGD:620720
Macaca mulatta GTF2A2 VGNC VGNC:84345
Canis familiaris GTF2A2 VGNC VGNC:41542
Mus musculus GTF2A2 MGD MGI:1933289