GTF2A1 - general transcription factor IIA subunit 1 Gene

中文名称：一般转录因子 IIA 亚基 1

种属: Homo sapiens

同用名: TF2A1; TFIIA; TFIIAL; TFIIA-42

基因 ID: 2957 | 基因类型: protein coding

关于 GTF2A1

Cytogenetic location: 14q31.1 Genomic coordinates (GRCh38): 14:81,175,452-81,221,390 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants), 213 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in thyroid (RPKM 15.3), testis (RPKM 12.9) and 25 other tissues.

功能概要

包含 TATA 的 II 类基因的准确转录起始涉及 RNA 聚合酶 II (POLR2A；MIM 180660) 和几个一般起始因子的有序组装 (由 DeJong 和 Roeder 总结，1993 [PubMed 8224848]) 。其中一个因素是 TFIIA，当从 HeLa 提取物中纯化时，它由 35、19 和 12 kD 亚基组成。[OMIM 提供，2010 年 7 月]

Accurate transcription initiation on TATA-containing class II genes involves the ordered assembly of RNA polymerase II (POLR2A; MIM 180660) and several general initiation factors (summarized by DeJong and Roeder, 1993 [PubMed 8224848]). One of these factors is TFIIA, which when purified from HeLa extracts consists of 35-, 19-, and 12-kD subunits.[supplied by OMIM, Jul 2010]

GTF2A1 基因产物(3)

mRNA	Protein	Name
NM_001278940.2	NP_001265869.1	transcription initiation factor IIA subunit 1 isoform 3
NM_015859.4	NP_056943.1	transcription initiation factor IIA subunit 1 isoform 1
NM_201595.3	NP_963889.1	transcription initiation factor IIA subunit 1 isoform 2

基因本体论

分子功能
生物过程
细胞组分

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables DNA binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	7724559	GOA
enables RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	29111974	GOA
enables RNA polymerase II general transcription initiation factor activity	IDA IDA: 通过直接分析推断	27193682	GOA
enables RNA polymerase II general transcription initiation factor binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	8626665	GOA
enables TBP-class protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	7724559	GOA
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	8006019	GOA
enables protein heterodimerization activity	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	8626665	GOA

生物过程 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
involved in positive regulation of transcription by RNA polymerase II	IDA IDA: 通过直接分析推断	10022900	GOA
involved in positive regulation of transcription initiation by RNA polymerase II	IDA IDA: 通过直接分析推断	11030333	GOA
involved in transcription by RNA polymerase II	IDA IDA: 通过直接分析推断	7724559	GOA

细胞组分 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
located in nucleus	IDA IDA: 通过直接分析推断	10022900	GOA
part of transcription factor TFIIA complex	IDA IDA: 通过直接分析推断	7724559	GOA
part of transcription factor TFIIA complex	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	8626665	GOA
part of transcription factor TFIID complex	IDA IDA: 通过直接分析推断	27193682	GOA
part of transcription preinitiation complex	IDA IDA: 通过直接分析推断	8224850	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

GTF2A1 蛋白结构

TFIIA

0
100
200
300
376 a.a.

蛋白主名

其他名称

transcription initiation factor IIA subunit 1

TFIIA alpha/beta subunits

GTF2A1 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
种属内	GTF2A1	P52655	SP4	Homo sapiens	Q02446	Validated Y2H	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	SP4	Homo sapiens	Q02446	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	SP4	Homo sapiens	Q02446	Y2H Array	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	FKBP1A	Homo sapiens	Q0VDC6	Y2H Array	32814053
种属内	GTF2A1	P52655	FKBP1A	Homo sapiens	Q0VDC6	Validated Y2H	32814053
种属内	GTF2A1	P52655	FKBP1A	Homo sapiens	Q0VDC6	Y2H Pooling	32814053
种属内	GTF2A1	P52655	GTF2A2	Homo sapiens	P52657	Anti Tag CoIP	28514442
种属内	GTF2A1	P52655	GTF2A2	Homo sapiens	P52657	Pull Down	8626665
种属内	GTF2A1	P52655	GTF2A2	Homo sapiens	P52657	Y2H Prey Pooling	25416956
种属内	GTF2A1	P52655	GTF2A2	Homo sapiens	P52657	Validated Y2H	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	GTF2A2	Homo sapiens	P52657	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	GTF2A2	Homo sapiens	P52657	Y2H Array	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	GTF2A2	Homo sapiens	P52657	Y2H Array	25416956
种属内	GTF2A1	P52655	NFYA	Homo sapiens	P23511-2	Y2H Array	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	NFYA	Homo sapiens	P23511-2	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	PRR20D	Homo sapiens	P86480	Validated Y2H	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	PRR20D	Homo sapiens	P86480	Y2H Array	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	PRR20D	Homo sapiens	P86480	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	ERN1	Homo sapiens	O75460-2	Validated Y2H	32814053
种属内	GTF2A1	P52655	ERN1	Homo sapiens	O75460-2	Y2H Array	32814053
种属内	GTF2A1	P52655	ERN1	Homo sapiens	O75460-2	Y2H Pooling	32814053
种属内	GTF2A1	P52655	FGFR3	Homo sapiens	P22607	Y2H Pooling	32814053
种属内	GTF2A1	P52655	FGFR3	Homo sapiens	P22607	Validated Y2H	32814053
种属内	GTF2A1	P52655	FGFR3	Homo sapiens	P22607	Y2H Array	32814053
种属内	GTF2A1	P52655	HRAS	Homo sapiens	P01112	Validated Y2H	32814053
种属内	GTF2A1	P52655	HRAS	Homo sapiens	P01112	Y2H Array	32814053
种属内	GTF2A1	P52655	HRAS	Homo sapiens	P01112	Y2H Pooling	32814053
种属内	GTF2A1	P52655	TBP	Homo sapiens	P20226	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	GTF2A1	P52655	TBP	Homo sapiens	P20226	Anti Tag CoIP	28514442
种属内	GTF2A1	P52655	PSMC6	Homo sapiens	P62333	Validated Y2H	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	PSMC6	Homo sapiens	P62333	Y2H Array	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	PSMC6	Homo sapiens	P62333	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	NFYA	Homo sapiens	P23511	Y2H Prey Pooling	25416956
种属内	GTF2A1	P52655	NFYA	Homo sapiens	P23511	Validated Y2H	25416956
种属内	GTF2A1	P52655	PMP22	Homo sapiens	A0A6Q8PF08	Validated Y2H	32814053
种属内	GTF2A1	P52655	PMP22	Homo sapiens	A0A6Q8PF08	Y2H Array	32814053
种属内	GTF2A1	P52655	PMP22	Homo sapiens	A0A6Q8PF08	Y2H Pooling	32814053
种属内	GTF2A1	P52655	BIRC7	Homo sapiens	Q96CA5	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	BIRC7	Homo sapiens	Q96CA5	Validated Y2H	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	BIRC7	Homo sapiens	Q96CA5	Y2H Array	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	TBPL1	Homo sapiens	P62380	Y2H Array	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	TBPL1	Homo sapiens	P62380	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	GTF2A1	P52655	TBPL1	Homo sapiens	P62380	Anti Tag CoIP	28514442
种属内	GTF2A1	P52655	TBPL1	Homo sapiens	P62380	Validated Y2H	32296183
种属内	GTF2A1	P52655	TBPL1	Homo sapiens	P62380	Y2H Prey Pooling	32296183

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-RS05892	GTF2A1 Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否
HY-RS05896	GTF2F1 Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否
HY-RS05898	GTF2H1 Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否
HY-RS05904	GTF2IRD1 Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Mus musculus	GTF2A1	MGD	MGI:1933277
Bos taurus	GTF2A1	VGNC	VGNC:29691
Canis familiaris	GTF2A1	VGNC	VGNC:41541
Macaca mulatta	GTF2A1	VGNC	VGNC:73305
Rattus norvegicus	GTF2A1	RGD	RGD:69246
Felis catus	GTF2A1	VGNC	VGNC:104398

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