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LSAMP - limbic system associated membrane protein Gene

中文名称:边缘系统相关膜蛋白

种属: Homo sapiens

同用名: LAMP; IGLON3

基因 ID: 4045 | 基因类型: protein coding

关于 LSAMP

Cytogenetic location: 3q13.31 Genomic coordinates (GRCh38): 3:115,802,374-116,445,487 (from NCBI)

This gene has 7 transcripts (splice variants), 219 orthologues and 5 paralogues. Biased expression in brain (RPKM 19.9), prostate (RPKM 5.4) and 9 other tissues.

功能概要

该基因编码免疫球蛋白 LAMP、OBCAM 和 neurotrimin (IgLON) 蛋白家族的成员。编码的前原蛋白经过蛋白水解处理,生成神经元表面糖蛋白。 This protein may act as a selective homophilic adhesion molecule during axon guidance and neuronal growth in the developing limbic system.所编码的蛋白质也可能起到肿瘤抑制因子的作用,并可能在神经精神疾病中发挥作用。选择性剪接会产生多种转录物变体,其中至少一种会编码经过蛋白水解处理的前原蛋白。[RefSeq 提供,2016 年 1 月]

This gene encodes a member of the immunoglobulin LAMP, OBCAM and neurotrimin (IgLON) family of proteins. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate a neuronal surface glycoprotein. This protein may act as a selective homophilic adhesion molecule during axon guidance and neuronal growth in the developing limbic system. The encoded protein may also function as a tumor suppressor and may play a role in neuropsychiatric disorders. Alternative splicing results in multiple transcript variants, at least one of which encodes a preproprotein that is proteolytically processed. [provided by RefSeq, Jan 2016]

LSAMP 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001318915.2 NP_001305844.1 limbic system-associated membrane protein isoform 2 precursor
NM_002338.5 NP_002329.2 limbic system-associated membrane protein isoform 1 preproprotein
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21982860 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

LSAMP 蛋白结构

I-set

I-set: Immunoglobulin I-set domain (34 - 128)

I-set

I-set: Immunoglobulin I-set domain (132 - 215)

I-set

I-set: Immunoglobulin I-set domain (222 - 305)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 338 a.a.
蛋白主名 其他名称

limbic system-associated membrane protein

IgLON family member 3

LSAMP 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
LSAMP Q13449 CENPV Homo sapiens Q7Z7K6 32814053
种属内
LSAMP Q13449 CENPV Homo sapiens Q7Z7K6 32814053
种属内
LSAMP Q13449 CENPV Homo sapiens Q7Z7K6 32814053
种属内
LSAMP Q13449 THAP3 Homo sapiens Q8WTV1 32814053
种属内
LSAMP Q13449 THAP3 Homo sapiens Q8WTV1 32814053
种属内
LSAMP Q13449 THAP3 Homo sapiens Q8WTV1 32814053
种属内
LSAMP Q13449 NTM Homo sapiens Q9P121 21982860
种属内
LSAMP Q13449 METTL27 Homo sapiens Q8N6F8 32814053
种属内
LSAMP Q13449 METTL27 Homo sapiens Q8N6F8 32814053
种属内
LSAMP Q13449 METTL27 Homo sapiens Q8N6F8 32814053
种属内
LSAMP Q13449 BECN1 Homo sapiens Q14457 32814053
种属内
LSAMP Q13449 BECN1 Homo sapiens Q14457 32814053
种属内
LSAMP Q13449 BECN1 Homo sapiens Q14457 32814053
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

重组 LSAMP 蛋白

目录号 产品名 蛋白编号 纯度
HY-P70414 LSAMP Protein, Human (HEK293, His) Q13449 (V29-N315) ≥95%

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus LSAMP VGNC VGNC:68095
Rattus norvegicus LSAMP RGD RGD:71102
Canis familiaris LSAMP VGNC VGNC:42836
Bos taurus LSAMP VGNC VGNC:106809
Macaca mulatta LSAMP VGNC VGNC:74450
Mus musculus LSAMP MGD MGI:1261760
Others LSAMP NCBI