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RBM11 - RNA binding motif protein 11 Gene

中文名称:RNA 结合基序蛋白 11

种属: Homo sapiens

基因 ID: 54033 | 基因类型: protein coding

关于 RBM11

Cytogenetic location: 21q11.2 Genomic coordinates (GRCh38): 21:14,216,157-14,228,372 (from NCBI)

This gene has 6 transcripts (splice variants), 135 orthologues and 1 paralogue. Broad expression in ovary (RPKM 1.3), thyroid (RPKM 1.3) and 21 other tissues.

功能概要

启用 poly (U) RNA 结合活性和蛋白质同源二聚化活性。通过剪接体作用于对氧化应激的细胞反应的上游或细胞内的反应以及可变 mRNA 剪接的调节。位于核斑点。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Enables poly(U) RNA binding activity and protein homodimerization activity. Acts upstream of or within cellular response to oxidative stress and regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome. Located in nuclear speck. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

RBM11 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001320602.2 NP_001307531.1 splicing regulator RBM11 isoform 2
NM_144770.5 NP_658983.3 splicing regulator RBM11 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables poly(U) RNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
21984414 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25416956 GOA
enables protein homodimerization activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
21984414 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
acts upstream of or within cellular response to oxidative stress IDA
IDA: 通过直接分析推断
21984414 GOA
acts upstream of or within regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
21984414 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in nuclear speck IDA
IDA: 通过直接分析推断
21984414 GOA
located in nucleoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
21984414 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
21984414 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

RBM11 蛋白结构

RRM_1

RRM_1: RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) (12 - 80)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 281 a.a.
蛋白主名 其他名称

splicing regulator RBM11

putative RNA-binding protein 11

RBM11 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
RBM11 P57052 ZFHX3 Homo sapiens Q15911-2
Validated Y2H
32296183
种属内
RBM11 P57052 SNRPC Homo sapiens Q5TAL4
Validated Y2H
25416956
种属内
RBM11 P57052 SNRPC Homo sapiens Q5TAL4
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
RBM11 P57052 JPH3 Homo sapiens Q8WXH2
Y2H Array
32814053
种属内
RBM11 P57052 JPH3 Homo sapiens Q8WXH2
Validated Y2H
32814053
种属内
RBM11 P57052 JPH3 Homo sapiens Q8WXH2
Y2H Pooling
32814053
种属内
RBM11 P57052 GPATCH2L Homo sapiens Q9NWQ4-1
Validated Y2H
32296183
种属内
RBM11 P57052 SAXO4 Homo sapiens Q7Z5V6-2
Validated Y2H
32296183
种属内
RBM11 P57052 ZCCHC8 Homo sapiens Q6NZY4
Anti Tag CoIP
28514442
种属内
RBM11 P57052 ZCCHC8 Homo sapiens Q6NZY4
Y2H Fragment Pooling
35914814
种属内
RBM11 P57052 ZCCHC8 Homo sapiens Q6NZY4
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
RBM11 P57052 PIBF1 Homo sapiens Q4G0R1
Validated Y2H
32296183
种属内
RBM11 P57052 GADD45GIP1 Homo sapiens Q8TAE8
Validated Y2H
32296183
种属内
RBM11 P57052 PMP22 Homo sapiens A0A6Q8PF08
Validated Y2H
32814053
种属内
RBM11 P57052 PMP22 Homo sapiens A0A6Q8PF08
Y2H Array
32814053
种属内
RBM11 P57052 PMP22 Homo sapiens A0A6Q8PF08
Y2H Pooling
32814053
种属内
RBM11 P57052 HTRA2 Homo sapiens O43464
Y2H Array
32814053
种属内
RBM11 P57052 HTRA2 Homo sapiens O43464
Y2H Pooling
32814053
种属内
RBM11 P57052 HTRA2 Homo sapiens O43464
Validated Y2H
32814053
种属内
RBM11 P57052 NDUFV2 Homo sapiens P19404
Y2H Pooling
32814053
种属内
RBM11 P57052 NDUFV2 Homo sapiens P19404
Validated Y2H
32814053
种属内
RBM11 P57052 NDUFV2 Homo sapiens P19404
Y2H Array
32814053
种属内
RBM11 P57052 GLIS2 Homo sapiens Q9BZE0
Validated Y2H
32296183
种属内
RBM11 P57052 DTX2 Homo sapiens Q86UW9
Validated Y2H
32296183
种属内
RBM11 P57052 ENKD1 Homo sapiens Q9H0I2
Validated Y2H
32296183
种属内
RBM11 P57052 ZNF414 Homo sapiens Q96IQ9
Validated Y2H
32296183
种属内
RBM11 P57052 ATOSB Homo sapiens Q7L5A3
Validated Y2H
32296183
种属内
RBM11 P57052 SCNM1 Homo sapiens Q9BWG6
Validated Y2H
32296183
种属内
RBM11 P57052 PRPH Homo sapiens P41219
Y2H Pooling
32814053
种属内
RBM11 P57052 PRPH Homo sapiens P41219
Validated Y2H
32814053
种属内
RBM11 P57052 PRPH Homo sapiens P41219
Y2H Array
32814053
种属内
RBM11 P57052 QKI Homo sapiens Q96PU8
Y2H Array
25416956
种属内
RBM11 P57052 FLNA Homo sapiens P21333-2
Y2H Pooling
32814053
种属内
RBM11 P57052 FLNA Homo sapiens P21333-2
Validated Y2H
32814053
种属内
RBM11 P57052 FLNA Homo sapiens P21333-2
Y2H Array
32814053
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta RBM11 VGNC VGNC:76681
Rattus norvegicus RBM11 RGD RGD:1305195
Canis familiaris RBM11 VGNC VGNC:45405
Mus musculus RBM11 MGD MGI:2447622
Felis catus RBM11 VGNC VGNC:69263
Bos taurus RBM11 VGNC VGNC:33784