1. Gene
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SMU1 - SMU1 DNA replication regulator and spliceosomal factor Gene

中文名称:SMU1 DNA 复制调节因子和剪接体因子

种属: Homo sapiens

同用名: BWD; SMU-1; fSAP57

基因 ID: 55234 | 基因类型: protein coding

关于 SMU1

Cytogenetic location: 9p21.1 Genomic coordinates (GRCh38): 9:33,041,765-33,076,674 (from NCBI)

This gene has 1 transcript (splice variant) and 212 orthologues. Ubiquitous expression in brain (RPKM 7.9), thyroid (RPKM 7.2) and 25 other tissues.

功能概要

通过剪接体参与 mRNA 剪接。位于核内。 U2 型预催化剪接体的一部分。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Involved in mRNA splicing, via spliceosome. Located in nucleus. Part of U2-type precatalytic spliceosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

SMU1 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_018225.3 NP_060695.2 WD40 repeat-containing protein SMU1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21516116 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in mRNA splicing, via spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
28781166 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of U2-type precatalytic spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
28781166 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
28781166 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

SMU1 蛋白结构

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (214 - 242)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (265 - 292)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (296 - 333)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (339 - 377)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (475 - 512)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 513 a.a.
蛋白主名 其他名称

WD40 repeat-containing protein SMU1

DNA replication regulator and spliceosomal factor

SMU1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SMU1 Q2TAY7 CERT1 Homo sapiens Q9Y5P4-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SMU1 Q2TAY7 CERT1 Homo sapiens Q9Y5P4-2
Validated Y2H
32296183
种属内
SMU1 Q2TAY7 CERT1 Homo sapiens Q9Y5P4-2
Y2H Array
32296183
种属内
SMU1 Q2TAY7 MSS51 Homo sapiens Q4VC12
Validated Y2H
32296183
种属内
SMU1 Q2TAY7 MSS51 Homo sapiens Q4VC12
Y2H Array
32296183
种属内
SMU1 Q2TAY7 MSS51 Homo sapiens Q4VC12
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SMU1 Q2TAY7 TLX3 Homo sapiens O43711
Y2H Array
32296183
种属内
SMU1 Q2TAY7 TLX3 Homo sapiens O43711
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SMU1 Q2TAY7 RASSF10 Homo sapiens A6NK89
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SMU1 Q2TAY7 RASSF10 Homo sapiens A6NK89
Y2H Array
32296183
种属内
SMU1 Q2TAY7 IK Homo sapiens Q13123
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
SMU1 Q2TAY7 IK Homo sapiens Q13123
Anti Tag CoIP
28514442
种属内
SMU1 Q2TAY7 IK Homo sapiens Q13123
Anti Tag CoIP
34694367
种属内
SMU1 Q2TAY7 IK Homo sapiens Q13123
Anti Tag CoIP
22365833
种属内
SMU1 Q2TAY7 WFS1 Homo sapiens O76024
Validated Y2H
32814053
种属内
SMU1 Q2TAY7 WFS1 Homo sapiens O76024
Y2H Pooling
32814053
种属内
SMU1 Q2TAY7 WFS1 Homo sapiens O76024
Y2H Array
32814053
种属内
SMU1 Q2TAY7 NDUFV1 Homo sapiens P49821
Validated Y2H
32814053
种属内
SMU1 Q2TAY7 NDUFV1 Homo sapiens P49821
Y2H Array
32814053
种属内
SMU1 Q2TAY7 NDUFV1 Homo sapiens P49821
Y2H Pooling
32814053
种属内
SMU1 Q2TAY7 MRFAP1L1 Homo sapiens Q96HT8
Y2H Array
32296183
种属内
SMU1 Q2TAY7 MRFAP1L1 Homo sapiens Q96HT8
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
SMU1 Q2TAY7 MRFAP1L1 Homo sapiens Q96HT8
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SMU1 Q2TAY7 MRFAP1L1 Homo sapiens Q96HT8
Y2H
21516116
种属内
SMU1 Q2TAY7 MRFAP1L1 Homo sapiens Q96HT8
Validated Y2H
32296183
种属内
SMU1 Q2TAY7 MRFAP1 Homo sapiens Q9Y605
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SMU1 Q2TAY7 MRFAP1 Homo sapiens Q9Y605
Y2H Array
32296183
种属内
SMU1 Q2TAY7 MRFAP1 Homo sapiens Q9Y605
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Influenza

Flu

Influenza With Non-Respiratory Manifestation

Influenza With Other Manifestations

Influenza, Human

Influenza, Susceptibility To

Seasonal Influenza, Virus Identified

Mandibular Cancer

Mandibular Neoplasms

Malignant Neoplasm Of Inferior Maxilla

Malignant Neoplasm Of Lower Jaw Bone

Malignant Neoplasm Of Mandible

Mandible Cancer

Mandibular Neoplasm

Neoplasm Of Mandible

Exudative Vitreoretinopathy 2, X-Linked

EVR2

Evrx

Fevrx

X-Linked Exudative Vitreoretinopathy 2

Exudative Vitreoretinopathy, Familial, 2

Fevr, X-Linked

Vitreoretinopathy, Exudative 2

Exudative Vitreoretinopathy Familial 2

Fevr X-Linked

X-Linked Familial Exudative Vitreoretinopathy

Vitreoretinopathy, Exudative, X-Linked, Type 2

Exudative Vitreoretinopathy, Familial, X-Linked Recessive

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus SMU1 RGD RGD:620694
Macaca mulatta SMU1 VGNC VGNC:77733
Bos taurus SMU1 VGNC VGNC:35038
Canis familiaris SMU1 VGNC VGNC:46578
Felis catus SMU1 VGNC VGNC:97637
Mus musculus SMU1 MGD MGI:1915546