IK - IK cytokine Gene

中文名称：IK 细胞因子

种属: Homo sapiens

同用名: RED; RER; CSA2

基因 ID: 3550 | 基因类型: protein coding

关于 IK

Cytogenetic location: 5q31.3 Genomic coordinates (GRCh38): 5:140,647,829-140,662,480 (from NCBI)

This gene has 10 transcripts (splice variants), 191 orthologues and 2 paralogues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 59.6), bone marrow (RPKM 39.1) and 25 other tissues.

功能概要

由该基因编码的蛋白质通过其 RED 重复序列 (一段重复的精氨酸、谷氨酸和天冬氨酸残基) 进行鉴定。蛋白质定位于细胞核内的离散点，不包括核仁。其功能未知。该基因映射到 5 号染色体；然而，2 号染色体上可能存在假基因。[RefSeq 提供，2008 年 7 月]

The protein encoded by this gene was identified by its RED repeat, a stretch of repeated arginine, glutamic acid and aspartic acid residues. The protein localizes to discrete dots within the nucleus, excluding the nucleolus. Its function is unknown. This gene maps to chromosome 5; however, a pseudogene may exist on chromosome 2. [provided by RefSeq, Jul 2008]

IK 基因产物(1)

mRNA	Protein	Name
NM_006083.4	NP_006074.2	protein Red

基因本体论

分子功能
生物过程
细胞组分

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables identical protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	22365833	GOA
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	22190034	GOA

生物过程 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
involved in mRNA splicing, via spliceosome	IDA IDA: 通过直接分析推断	28781166	GOA
involved in mitotic cell cycle	IMP IMP: 通过突变表型推断	24252166	GOA
involved in mitotic spindle assembly checkpoint signaling	IMP IMP: 通过突变表型推断	22351768	GOA
involved in protein localization to kinetochore	IMP IMP: 通过突变表型推断	22351768	GOA

细胞组分 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
part of U2-type precatalytic spliceosome	IDA IDA: 通过直接分析推断	28781166	GOA
colocalizes with mitotic spindle pole	IDA IDA: 通过直接分析推断	22351768	GOA
colocalizes with nuclear chromosome	IMP IMP: 通过突变表型推断	24252166	GOA
located in nucleoplasm	IDA IDA: 通过直接分析推断	24252166	GOA
located in nucleus	IDA IDA: 通过直接分析推断	28781166	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

IK 蛋白结构

RED_N

RED_C

0
100
200
300
400
500
557 a.a.

蛋白主名

其他名称

protein Red

IK cytokine, down-regulator of HLA II

IK 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
Intra	IK	Q13123	MFAP1	Homo sapiens	P55081	Y2H	22365833
Intra	IK	Q13123	MFAP1	Homo sapiens	P55081	Anti Tag CoIP	22365833
Intra	IK	Q13123	DNAJB6	Homo sapiens	O75190	Y2H Array	32814053
Intra	IK	Q13123	DNAJB6	Homo sapiens	O75190	Validated Y2H	32814053
Intra	IK	Q13123	DNAJB6	Homo sapiens	O75190	Y2H Pooling	32814053
Intra	IK	Q13123	EGLN3	Homo sapiens	Q9H6Z9	Validated Y2H	32296183
Intra	IK	Q13123	RNF113A	Homo sapiens	O15541	Y2H	22365833
Intra	IK	Q13123	RNF113A	Homo sapiens	O15541	Anti Tag CoIP	22365833
Intra	IK	Q13123	XAB2	Homo sapiens	Q9HCS7	Anti Tag CoIP	22365833
Intra	IK	Q13123	SMU1	Homo sapiens	Q2TAY7	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	IK	Q13123	SMU1	Homo sapiens	Q2TAY7	Y2H	22365833
Intra	IK	Q13123	SMU1	Homo sapiens	Q2TAY7	Validated Y2H	32296183
Intra	IK	Q13123	SMU1	Homo sapiens	Q2TAY7	Y2H Array	32296183
Intra	IK	Q13123	SPRED1	Homo sapiens	Q7Z699	Y2H Array	32814053
Intra	IK	Q13123	SPRED1	Homo sapiens	Q7Z699	Validated Y2H	32814053
Intra	IK	Q13123	SPRED1	Homo sapiens	Q7Z699	Y2H Pooling	32814053
Intra	IK	Q13123	PRPF6	Homo sapiens	O94906	Y2H	22365833
Intra	IK	Q13123	PRPF6	Homo sapiens	O94906	Anti Tag CoIP	22365833
Intra	IK	Q13123	CEP70	Homo sapiens	Q8NHQ1	Validated Y2H	25416956
Intra	IK	Q13123	RBM10	Homo sapiens	P98175	Y2H	22365833
Intra	IK	Q13123	RBM10	Homo sapiens	P98175	Anti Tag CoIP	22365833
Intra	IK	Q13123	OPTN	Homo sapiens	Q96CV9	Validated Y2H	32814053
Intra	IK	Q13123	OPTN	Homo sapiens	Q96CV9	Y2H Pooling	32814053
Intra	IK	Q13123	OPTN	Homo sapiens	Q96CV9	Y2H Array	32814053
Intra	IK	Q13123	SNIP1	Homo sapiens	Q8TAD8	Anti Tag CoIP	22365833
Intra	IK	Q13123	SNIP1	Homo sapiens	Q8TAD8	Y2H	22365833
Intra	IK	Q13123	DR1	Homo sapiens	Q01658	Y2H Array	32814053
Intra	IK	Q13123	DR1	Homo sapiens	Q01658	Validated Y2H	32814053
Intra	IK	Q13123	DR1	Homo sapiens	Q01658	Y2H Pooling	32814053
Cross	IK	Q13123	rev	Human immunodeficiency virus	P04618	Pull Down	22190034

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称

别名

Skin Amelanotic Melanoma

Skin Amelanotic Malignant Melanoma

Amelanotic Skin Melanoma

Influenza

Flu	Influenza With Non-Respiratory Manifestation
Influenza With Other Manifestations	Influenza, Human
Influenza, Susceptibility To	Seasonal Influenza, Virus Identified

Overhydrated Hereditary Stomatocytosis

Ohs	Potassium Sodium Disorder Of Erythrocyte
OHST	Stomatocytosis I
Potassium-Sodium Disorder Of Erythrocyte	Stomatocytosisiohst
Hereditary, Overhydrated, Cation-Leak Stomatocytosis	Overhydrated Cation Leak Stomatocytosis
Stomatocytosis, Overhydrated Hereditary

Chronic Atrial And Intestinal Dysrhythmia

CAID	Caid Syndrome
Cohesinopathy Affecting Heart And Gut Rhythm	Chronic Atrial Intestinal Dysrhythmia Syndrome
Chronic Atrial And Intestinal Dysrhythmia Syndrome	Chronic Atrial Dysrhythmia-Intestinal Motility Disorder
Dysrhythmia, Atrial And Intestinal, Chronic

Gordon Holmes Syndrome

Cerebellar Ataxia And Hypogonadotropic Hypogonadism	Lhrh Deficiency And Ataxia
Cerebellar Ataxia-Hypogonadism Syndrome	GDHS
Cahh	Luteinizing Hormone-Releasing Hormone Deficiency With Ataxia
Gordon-Holmes Syndrome	Deficiency Of Luteinizing Hormone-Releasing Hormone With Ataxia
Luteinizing Hormone-Releasing Hormone, Deficiency Of, With Ataxia	Cerebellar Ataxia - Hypogonadism
Luteinizing Hormone Releasing Hormone, Deficiency Of With Ataxia	Ataxia, Cerebellar, And Hypogonadotropic Hypogonadism

疾病名称	别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia	Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma

目录号	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-100795A	Pirmenol hydrochloride	Inhibitor	99.34%	否
HY-100795	Pirmenol	Inhibitor	/	否

目录号	产品名	作用方式	纯度	Phase
HY-153585	IK-930	Inhibitor	99.26%	Phase 1
HY-118148	UK-66914	Inhibitor	/	Phase 1

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-15416	NS309	Activator	99.09%	否
HY-103137	Zacopride hydrochloride		99.69%	否
HY-101253	AM-92016 hydrochloride		≥98.0%	否
HY-112544	IK1 inhibitor PA-6	Inhibitor	99.62%	否
HY-10219GL	Rapamycin (GMP Like)	Inhibitor	98.8%	否
HY-120685	WAY-125971	Antagonist	/	否
HY-126704	Tedisamil		/	否
HY-136805	Kv1.5-IN-1		/	否
HY-144122	HIV-1 inhibitor-15	Inhibitor	/	否
HY-146365	HIV-1 inhibitor-30		/	否
HY-146746	HIV-1 inhibitor-19	Inhibitor	/	否
HY-152161	HIV-1 inhibitor-51	Inhibitor	/	否
HY-RS06656	IK Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否
HY-118317	Zacopride		/	否
HY-118734	IK-862	Inhibitor	/	否
HY-120059	NS4591		/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Bos taurus	IK	VGNC	VGNC:30100
Felis catus	IK	VGNC	VGNC:67750
Mus musculus	IK	MGD	MGI:1345142
Canis familiaris	IK	VGNC	VGNC:54958
Rattus norvegicus	IK	RGD	RGD:1359352
Macaca mulatta	IK	VGNC	VGNC:73703
Macaca fascicularis	IK	NCBI	NCBI:102130643
Susscrofa domestica	IK	NCBI
Leporidae	IK	NCBI
Others	IK	NCBI

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