SCAF1 - SR-related CTD associated factor 1 Gene

中文名称：SR 相关 CTD 相关因素 1

种属: Homo sapiens

同用名: SRA1

基因 ID: 58506 | 基因类型: protein coding

关于 SCAF1

Cytogenetic location: 19q13.33 Genomic coordinates (GRCh38): 19:49,640,465-49,658,642 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants), 201 orthologues and 2 paralogues. Ubiquitous expression in fat (RPKM 11.1), brain (RPKM 11.1) and 25 other tissues.

功能概要

启用 RNA 聚合酶 II C 端域结合活性。预计参与 RNA 剪接； mRNA 处理；和 RNA 聚合酶 II 的转录。预测位于核内。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables RNA polymerase II C-terminal domain binding activity. Predicted to be involved in RNA splicing; mRNA processing; and transcription by RNA polymerase II. Predicted to be located in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

SCAF1 基因产物(1)

mRNA	Protein	Name
NM_021228.3	NP_067051.2	splicing factor, arginine/serine-rich 19

基因本体论

分子功能

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables RNA polymerase II C-terminal domain binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	15992770	GOA
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	32296183	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

蛋白主名

其他名称

splicing factor, arginine/serine-rich 19

SCAF

SCAF1 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
种属内	SCAF1	Q9H7N4	MEOX2	Homo sapiens	Q6FHY5	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SCAF1	Q9H7N4	MEOX2	Homo sapiens	Q6FHY5	Y2H Array	32296183
种属内	SCAF1	Q9H7N4	GSC2	Homo sapiens	O15499	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SCAF1	Q9H7N4	GSC2	Homo sapiens	O15499	Y2H Array	32296183
种属内	SCAF1	Q9H7N4	MTSS2	Homo sapiens	Q765P7	Y2H Array	32296183
种属内	SCAF1	Q9H7N4	MTSS2	Homo sapiens	Q765P7	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SCAF1	Q9H7N4	CIB1	Homo sapiens	Q99828	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SCAF1	Q9H7N4	CIB1	Homo sapiens	Q99828	Y2H Array	32296183
种属内	SCAF1	Q9H7N4	RTN4IP1	Homo sapiens	Q8WWV3	Y2H Array	32296183
种属内	SCAF1	Q9H7N4	RTN4IP1	Homo sapiens	Q8WWV3	Y2H Prey Pooling	32296183

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称

别名

Spinocerebellar Ataxia, Autosomal Recessive 3

SCAR3	Scabd
Autosomal Recessive Spinocerebellar Ataxia Type 3	Autosomal Recessive Spinocerebellar Ataxia-Blindness-Deafness Syndrome
Autosomal Recessive Spinocerebellar Ataxia-Blindness-Hearing Loss Syndrome	Spinocerebellar Ataxia With Blindness And Deafness
Autosomal Recessive Spinocerebellar Ataxia 3	Spinocerebellar Ataxia Autosomal Recessive 3
Autosomal Recessive Cerebellar Ataxia - Blindness - Deafness	Autosomal Recessive Cerebellar Ataxia-Blindness-Deafness Syndrome

Pituitary Adenoma 3, Multiple Types

PITA3	Pituitary Adenoma 3, Multiple Types, Somatic
Pituitary Adenoma 3

疾病名称	别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia	Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-RS12474	SCAF1 Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Mus musculus	SCAF1	MGD	MGI:2141980
Bos taurus	SCAF1	VGNC	VGNC:34313
Macaca mulatta	SCAF1	VGNC	VGNC:77137
Canis familiaris	SCAF1	VGNC	VGNC:45888
Rattus norvegicus	SCAF1	RGD	RGD:708405

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