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  3. COP1 - COP1 E3 ubiquitin ligase Gene

COP1 - COP1 E3 ubiquitin ligase Gene

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中文名称：COP1 E3 泛素连接酶

种属: Homo sapiens

同用名: FAP78; RFWD2; CFAP78; RNF200

基因 ID: 64326 | 基因类型: protein coding

关于 COP1

Cytogenetic location: 1q25.1-q25.2 Genomic coordinates (GRCh38): 1:175,944,831-176,207,286 (from NCBI)

This gene has 11 transcripts (splice variants), 220 orthologues and 26 paralogues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 5.8), colon (RPKM 4.2) and 25 other tissues.

功能概要

启用泛素蛋白连接酶活性。参与蛋白酶体泛素依赖性蛋白质分解代谢过程的正调控；蛋白酶体介导的泛素依赖性蛋白质分解代谢过程；和对电离辐射的反应。 Cul4A-RING E3 泛素连接酶复合物的一部分。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables ubiquitin protein Ligase activity. Involved in positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; and response to ionizing radiation. Part of Cul4A-RING E3 ubiquitin Ligase complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

COP1 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001001740.4 NP_001001740.1 E3 ubiquitin-protein ligase COP1 isoform b
NM_001286644.2 NP_001273573.1 E3 ubiquitin-protein ligase COP1 isoform c precursor
NM_022457.7 NP_071902.2 E3 ubiquitin-protein ligase COP1 isoform a
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
14739464 GOA
enables ubiquitin protein ligase activity IMP
IMP: 通过突变表型推断
19805145 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process IMP
IMP: 通过突变表型推断
19805145 GOA
involved in proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process IMP
IMP: 通过突变表型推断
14739464 GOA
involved in response to ionizing radiation IDA
IDA: 通过直接分析推断
19805145 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of Cul4A-RING E3 ubiquitin ligase complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
14739464 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

COP1 蛋白结构

zf-C3HC4

zf-C3HC4: Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) (136 - 173)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (471 - 499)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (506 - 542)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (556 - 584)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (590 - 626)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 731 a.a.
蛋白主名 其他名称

E3 ubiquitin-protein ligase COP1

E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2

COP1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra COP1 Q8NHY2 ETV1 Homo sapiens P50549
Anti Tag CoIP
33961781
Intra COP1 Q8NHY2 ETV1 Homo sapiens P50549
Anti Bait CoIP
21572435
Intra COP1 Q8NHY2 ETV5 Homo sapiens P41161
Anti Tag CoIP
33961781
Intra COP1 Q8NHY2 SFN Homo sapiens P31947
Anti Tag CoIP
20843328
Intra COP1 Q8NHY2 COPS6 Homo sapiens Q7L5N1
Anti Bait CoIP
21625211
Intra COP1 Q8NHY2 ETS1 Homo sapiens P14921-1
Anti Tag CoIP
25117710
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Bn2 Diffuse Large B-Cell Lymphoma

Bn2 Dlbcl

Doid:0081064
疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

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Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

相关产品

Pre-clinical Phase
生物活性分子 (2)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-157416 COP1-ATGL modulator 1 Modulator 99.31% 否
HY-RS03020 COP1 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta COP1 VGNC VGNC:106344
Mus musculus COP1 MGD MGI:1347046
Canis familiaris COP1 VGNC VGNC:53338
Felis catus COP1 VGNC VGNC:97388
Bos taurus COP1 VGNC VGNC:50041
Rattus norvegicus COP1 RGD RGD:1304773
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