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COPS6 - COP9 signalosome subunit 6 Gene

中文名称:COP9 信号体亚基 6

种属: Homo sapiens

同用名: CSN6; MOV34-34KD

基因 ID: 10980 | 基因类型: protein coding

关于 COPS6

Cytogenetic location: 7q22.1 Genomic coordinates (GRCh38): 7:100,088,969-100,092,187 (from NCBI)

This gene has 10 transcripts (splice variants), 201 orthologues and 2 paralogues. Ubiquitous expression in esophagus (RPKM 33.2), testis (RPKM 32.7) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白质是 COP9 信号体的八个亚基之一,COP9 信号体是一种高度保守的蛋白质复合物,在多个信号通路中起重要调节作用。 COP9 信号体的结构和功能类似于 26S 蛋白酶体的 19S 调节颗粒。 COP9 信号体已被证明与 SCF 型 E3 泛素连接酶相互作用,并作为 E3 泛素连接酶的正调节剂。该蛋白属于翻译起始因子 3 (eIF3) 超家族。它参与细胞周期的调节,可能是 HIV-1 辅助基因产物 Vpr 的细胞辅助因子。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

The protein encoded by this gene is one of the eight subunits of COP9 signalosome, a highly conserved protein complex that functions as an important regulator in multiple signaling pathways. The structure and function of COP9 signalosome is similar to that of the 19S regulatory particle of 26S Proteasome. COP9 signalosome has been shown to interact with SCF-type E3 ubiquitin ligases and act as a positive regulator of E3 ubiquitin ligases. This protein belongs to translation initiation factor 3 (eIF3) superfamily. It is involved in the regulation of cell cycle and likely to be a cellular cofactor for HIV-1 accessory gene product Vpr. [provided by RefSeq, Jul 2008]

COPS6 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_006833.5 NP_006824.2 COP9 signalosome complex subunit 6
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16169070 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in protein deneddylation IDA
IDA: 通过直接分析推断
19141280 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of COP9 signalosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
18850735 GOA
part of COP9 signalosome IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25043011 GOA
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
24421388 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
24421388 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

COPS6 蛋白结构

JAB

JAB: JAB1/Mov34/MPN/PAD-1 ubiquitin protease (40 - 147)

MitMem_reg

MitMem_reg: Maintenance of mitochondrial structure and function (193 - 308)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 327 a.a.
蛋白主名 其他名称

COP9 signalosome complex subunit 6

COP9 constitutive photomorphogenic homolog subunit 6

COPS6 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
COPS6 Q7L5N1 COP1 Homo sapiens Q8NHY2 21625211
种属内
COPS6 Q7L5N1 COP1 Homo sapiens Q8NHY2 21625211
种属内
COPS6 Q7L5N1 BTRC Homo sapiens Q9Y297
TAP
21145461
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS3 Homo sapiens Q9UNS2 19615732
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS3 Homo sapiens Q9UNS2
TAP
21145461
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS3 Homo sapiens Q9UNS2 33961781
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS3 Homo sapiens Q9UNS2 28514442
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS3 Homo sapiens Q9UNS2 25043011
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS3 Homo sapiens Q9UNS2 24421388
种属内
COPS6 Q7L5N1 SFN Homo sapiens P31947 21625211
种属内
COPS6 Q7L5N1 SFN Homo sapiens P31947 21625211
种属内
COPS6 Q7L5N1 SFN Homo sapiens P31947 21625211
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS5 Homo sapiens Q92905
TAP
21145461
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS5 Homo sapiens Q92905 33961781
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS5 Homo sapiens Q92905 21625211
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS5 Homo sapiens Q92905 25043011
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS5 Homo sapiens Q92905 28514442
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS5 Homo sapiens Q92905 19615732
种属内
COPS6 Q7L5N1 BTBD2 Homo sapiens Q9BX70 19615732
种属内
COPS6 Q7L5N1 BTBD2 Homo sapiens Q9BX70
TAP
21145461
种属内
COPS6 Q7L5N1 BTBD2 Homo sapiens Q9BX70 33961781
种属内
COPS6 Q7L5N1 BTBD2 Homo sapiens Q9BX70 28514442
种属内
COPS6 Q7L5N1 USHBP1 Homo sapiens Q8N6Y0 32296183
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS4 Homo sapiens Q9BT78 33961781
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS4 Homo sapiens Q9BT78 32296183
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS4 Homo sapiens Q9BT78 25043011
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS4 Homo sapiens Q9BT78 32296183
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS4 Homo sapiens Q9BT78 19615732
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS4 Homo sapiens Q9BT78 32296183
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS4 Homo sapiens Q9BT78
TAP
21145461
种属内
COPS6 Q7L5N1 COPS4 Homo sapiens Q9BT78 28514442
种属内
COPS6 Q7L5N1 SHC3 Homo sapiens Q92529 32296183
种属内
COPS6 Q7L5N1 MAPK1 Homo sapiens P28482 26267535
种属内
COPS6 Q7L5N1 MAPK1 Homo sapiens P28482 26267535
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Xeroderma Pigmentosum, Complementation Group E

Xeroderma Pigmentosum V

Xp5

Xeroderma Pigmentosum, Group E, Ddb-Negative Subtype

Xpe

Xp, Group E

Xeroderma Pigmentosum, Type 5

Xeroderma Pigmentosum Complementation Group E

XP-E

Xp Group E

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus COPS6 VGNC VGNC:27603
Mus musculus COPS6 MGD MGI:1349439
Macaca mulatta COPS6 VGNC VGNC:71286
Rattus norvegicus COPS6 RGD RGD:1309919
Canis familiaris COPS6 VGNC VGNC:39512