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SNAPC1 - small nuclear RNA activating complex polypeptide 1 Gene

  • 基因
  • 蛋白
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中文名称：小核 RNA 激活复合多肽 1

种属: Homo sapiens

同用名: SNAP43; PTFgamma

基因 ID: 6617 | 基因类型: protein coding

关于 SNAPC1

Cytogenetic location: 14q23.2 Genomic coordinates (GRCh38): 14:61,762,420-61,796,428 (from NCBI)

This gene has 1 transcript (splice variant) and 252 orthologues. Broad expression in testis (RPKM 12.5), adrenal (RPKM 5.0) and 24 other tissues.

功能概要

预测可实现序列特异性 DNA 结合活性。预计参与 RNA 聚合酶 II 的 snRNA 转录和 RNA 聚合酶 III 的 snRNA 转录。位于核仁和核质中。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Predicted to enable sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in snRNA transcription by RNA polymerase II and snRNA transcription by RNA polymerase III. Located in nucleolus and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

SNAPC1 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_003082.4 NP_003073.1 snRNA-activating protein complex subunit 1
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11056176 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SNAPC1 蛋白结构

SNAPc_SNAP43

SNAPc_SNAP43: Small nuclear RNA activating complex (SNAPc), subunit SNAP43 (6 - 191)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 368 a.a.
蛋白主名 其他名称

snRNA-activating protein complex subunit 1

PSE-binding factor subunit gamma

SNAPC1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SNAPC1 Q16533 SNAPC3 Homo sapiens Q92966
Anti Bait CoIP
11056176
种属内
SNAPC1 Q16533 SNAPC3 Homo sapiens Q92966
GMS
36369505
种属内
SNAPC1 Q16533 SNAPC3 Homo sapiens Q92966
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
SNAPC1 Q16533 SNAPC3 Homo sapiens Q92966
Anti Tag CoIP
28514442
种属内
SNAPC1 Q16533 SNAPC3 Homo sapiens Q92966
Validated Y2H
32296183
种属内
SNAPC1 Q16533 SNAPC4 Homo sapiens Q5SXM2
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
SNAPC1 Q16533 SNAPC4 Homo sapiens Q5SXM2
Anti Tag CoIP
28514442
种属内
SNAPC1 Q16533 SNAPC4 Homo sapiens Q5SXM2
Anti Bait CoIP
11056176
种属内
SNAPC1 Q16533 SNAPC4 Homo sapiens Q5SXM2
GMS
36369505
种属内
SNAPC1 Q16533 EXOC8 Homo sapiens Q8IYI6
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS13478 SNAPC1 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta SNAPC1 VGNC VGNC:77665
Mus musculus SNAPC1 MGD MGI:1922877
Rattus norvegicus SNAPC1 RGD RGD:1304671
Felis catus SNAPC1 VGNC VGNC:65519
Bos taurus SNAPC1 VGNC VGNC:35054
Canis familiaris SNAPC1 VGNC VGNC:46591
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