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ZKSCAN8 - zinc finger with KRAB and SCAN domains 8 Gene

中文名称:具有 KRAB 和 SCAN 结构域 8 的锌指

种属: Homo sapiens

同用名: LD5-1; ZNF192; ZSCAN40

基因 ID: 7745 | 基因类型: protein coding

关于 ZKSCAN8

Cytogenetic location: 6p22.1 Genomic coordinates (GRCh38): 6:28,141,635-28,159,460 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants), 94 orthologues and 31 paralogues. Ubiquitous expression in endometrium (RPKM 9.3), ovary (RPKM 8.6) and 25 other tissues.

功能概要

预测可实现 DNA 结合转录因子活性、RNA 聚合酶 II 特异性和 RNA 聚合酶 II 顺式调节区序列特异性 DNA 结合活性。预计参与 RNA 聚合酶 II 的转录调控。预测位于核内。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to be located in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

ZKSCAN8 基因产物(4)

mRNA Protein Name
NM_001278119.2 NP_001265048.1 zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 8 isoform 1
NM_001278121.2 NP_001265050.1 zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 8 isoform 2
NM_001278122.2 NP_001265051.1 zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 8 isoform 2
NM_006298.4 NP_006289.2 zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 8 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
28514442 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

ZKSCAN8 蛋白结构

SCAN

SCAN: SCAN domain (47 - 134)

KRAB

KRAB: KRAB box (222 - 259)

zf-C2H2_6

zf-C2H2_6: C2H2-type zinc finger (322 - 335)

zf-H2C2_2

zf-H2C2_2: Zinc-finger double domain (337 - 361)

zf-H2C2_2

zf-H2C2_2: Zinc-finger double domain (364 - 388)

zf-H2C2_2

zf-H2C2_2: Zinc-finger double domain (396 - 416)

zf-H2C2_2

zf-H2C2_2: Zinc-finger double domain (424 - 445)

zf-H2C2_2

zf-H2C2_2: Zinc-finger double domain (452 - 472)

zf-H2C2_2

zf-H2C2_2: Zinc-finger double domain (480 - 500)

zf-H2C2_2

zf-H2C2_2: Zinc-finger double domain (505 - 527)

zf-H2C2_2

zf-H2C2_2: Zinc-finger double domain (533 - 555)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 578 a.a.
蛋白主名 其他名称

zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 8

zinc finger protein 192

ZKSCAN8 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
ZKSCAN8 Q15776 NF2 Homo sapiens P35240
Validated Y2H
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 NF2 Homo sapiens P35240
Y2H Array
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 NF2 Homo sapiens P35240
Y2H Pooling
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 KIF1B Homo sapiens O60333-2
Y2H Pooling
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 KIF1B Homo sapiens O60333-2
Validated Y2H
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 KIF1B Homo sapiens O60333-2
Y2H Array
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 DMWD Homo sapiens G5E9A7
Y2H Array
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 DMWD Homo sapiens G5E9A7
Validated Y2H
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 DMWD Homo sapiens G5E9A7
Y2H Pooling
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 ZNF444 Homo sapiens Q8N0Y2-2
Validated Y2H
32296183
种属内
ZKSCAN8 Q15776 PPIA Homo sapiens P62937-2
Validated Y2H
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 PPIA Homo sapiens P62937-2
Y2H Array
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 PPIA Homo sapiens P62937-2
Y2H Pooling
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 YWHAG Homo sapiens P61981
Y2H Array
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 YWHAG Homo sapiens P61981
Validated Y2H
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 YWHAG Homo sapiens P61981
Y2H Pooling
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 RNF11 Homo sapiens Q9Y3C5
Validated Y2H
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 RNF11 Homo sapiens Q9Y3C5
Y2H Pooling
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 RNF11 Homo sapiens Q9Y3C5
Y2H Array
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 NEFL Homo sapiens P07196
Validated Y2H
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 NEFL Homo sapiens P07196
Y2H Array
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 NEFL Homo sapiens P07196
Y2H Pooling
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 SPRED1 Homo sapiens Q7Z699
Validated Y2H
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 SPRED1 Homo sapiens Q7Z699
Y2H Array
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 SPRED1 Homo sapiens Q7Z699
Y2H Pooling
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 ZNF587 Homo sapiens Q96SQ5
Validated Y2H
32296183
种属内
ZKSCAN8 Q15776 WFS1 Homo sapiens O76024
Validated Y2H
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 WFS1 Homo sapiens O76024
Y2H Array
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 WFS1 Homo sapiens O76024
Y2H Pooling
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 PRPS1 Homo sapiens P60891
Y2H Array
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 PRPS1 Homo sapiens P60891
Y2H Pooling
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 PRPS1 Homo sapiens P60891
Validated Y2H
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 SETDB1 Homo sapiens Q15047-2
Validated Y2H
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 SETDB1 Homo sapiens Q15047-2
Y2H Array
32814053
种属内
ZKSCAN8 Q15776 SETDB1 Homo sapiens Q15047-2
Y2H Pooling
32814053
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus ZKSCAN8 MGD MGI:1913815
Rattus norvegicus ZKSCAN8 RGD RGD:1308983
Canis familiaris ZKSCAN8 VGNC VGNC:49668
Bos taurus ZKSCAN8 VGNC VGNC:107041
Felis catus ZKSCAN8 VGNC VGNC:67250
Macaca mulatta ZKSCAN8 VGNC VGNC:78417