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PLEKHF1 - pleckstrin homology and FYVE domain containing 1 Gene

中文名称:含 pleckstrin 同源性和 FYVE 结构域 1

种属: Homo sapiens

同用名: APPD; LAPF; PHAFIN1; ZFYVE15

基因 ID: 79156 | 基因类型: protein coding

关于 PLEKHF1

Cytogenetic location: 19q12 Genomic coordinates (GRCh38): 19:29,665,461-29,675,477 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants), 234 orthologues and 13 paralogues. Ubiquitous expression in fat (RPKM 4.0), spleen (RPKM 2.2) and 24 other tissues.

功能概要

启用 phosphatidylinositol-3-phosphate 结合活性;磷脂酰肌醇-4-磷酸结合活性;和磷脂酰肌醇-5-磷酸结合活性。参与内体组织;自噬的正调节;和蛋白质定位到质膜。位于溶酶体中。与核内体共定位。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Enables phosphatidylinositol-3-phosphate binding activity; phosphatidylinositol-4-phosphate binding activity; and phosphatidylinositol-5-phosphate binding activity. Involved in endosome organization; positive regulation of autophagy; and protein localization to plasma membrane. Located in lysosome. Colocalizes with endosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

PLEKHF1 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_024310.5 NP_077286.3 pleckstrin homology domain-containing family F member 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables phosphatidylinositol-3-phosphate binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
22115783 GOA
enables phosphatidylinositol-4-phosphate binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
22115783 GOA
enables phosphatidylinositol-5-phosphate binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
22115783 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25416956 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in endosome organization IMP
IMP: 通过突变表型推断
22115783 GOA
involved in positive regulation of autophagy IDA
IDA: 通过直接分析推断
22115783 GOA
involved in protein localization to plasma membrane IMP
IMP: 通过突变表型推断
22115783 GOA
involved in vesicle organization IMP
IMP: 通过突变表型推断
22115783 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
colocalizes with endosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
22115783 GOA
located in lysosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
22115783 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

PLEKHF1 蛋白结构

PH

PH: PH domain (39 - 130)

FYVE

FYVE: FYVE zinc finger (148 - 211)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 279 a.a.
蛋白主名 其他名称

pleckstrin homology domain-containing family F member 1

PH and FYVE domain-containing protein 1

PLEKHF1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
PLEKHF1 Q96S99 L3MBTL3 Homo sapiens Q96JM7-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
PLEKHF1 Q96S99 L3MBTL3 Homo sapiens Q96JM7-2
Y2H Array
32296183
种属内
PLEKHF1 Q96S99 NPM2 Homo sapiens Q86SE8-2
Y2H Array
32296183
种属内
PLEKHF1 Q96S99 NPM2 Homo sapiens Q86SE8-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
PLEKHF1 Q96S99 L3MBTL3 Homo sapiens Q96JM7
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
PLEKHF1 Q96S99 L3MBTL3 Homo sapiens Q96JM7
Validated Y2H
25416956
种属内
PLEKHF1 Q96S99 L3MBTL3 Homo sapiens Q96JM7
Y2H Array
25416956
种属内
PLEKHF1 Q96S99 CHIC2 Homo sapiens Q9UKJ5
Validated Y2H
32296183
种属内
PLEKHF1 Q96S99 CAVIN2 Homo sapiens O95810
Y2H Array
32296183
种属内
PLEKHF1 Q96S99 CAVIN2 Homo sapiens O95810
Y2H Prey Pooling
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus PLEKHF1 MGD MGI:1919537
Macaca mulatta PLEKHF1 VGNC VGNC:76085
Felis catus PLEKHF1 VGNC VGNC:64224
Bos taurus PLEKHF1 VGNC VGNC:33012
Canis familiaris PLEKHF1 VGNC VGNC:44675
Rattus norvegicus PLEKHF1 RGD RGD:1310544