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  3. SF3B5 - splicing factor 3b subunit 5 Gene

SF3B5 - splicing factor 3b subunit 5 Gene

  • 基因
  • 蛋白
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  • 直系同源

中文名称：剪接因子 3b 亚基 5

种属: Homo sapiens

同用名: Ysf3; SF3b10

基因 ID: 83443 | 基因类型: protein coding

关于 SF3B5

Cytogenetic location: 6q24.2 Genomic coordinates (GRCh38): 6:144,094,884-144,095,573 (from NCBI)

This gene has 1 transcript (splice variant) and 208 orthologues.

功能概要

启用 RNA 结合活性和剪接因子结合活性。通过剪接体参与 mRNA 剪接。位于核质中。 U12 型剪接体复合物和 U2 型预催化剪接体的一部分。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables RNA binding activity and splicing factor binding activity. Involved in mRNA splicing, via spliceosome. Located in nucleoplasm. Part of U12-type spliceosomal complex and U2-type precatalytic spliceosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

SF3B5 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_031287.3 NP_112577.1 splicing factor 3B subunit 5
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables RNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
27720643 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
17332742 GOA
enables splicing factor binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
27720643 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in mRNA splicing, via spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
27720643 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of U12-type spliceosomal complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
15146077 GOA
part of U2-type precatalytic spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
28781166 GOA
part of U2-type spliceosomal complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
32494006 GOA
part of U2-type spliceosomal complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
27720643 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
27720643 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SF3B5 蛋白结构

SF3b10

SF3b10: Splicing factor 3B subunit 10 (SF3b10) (3 - 80)

  • 0
  • 86 a.a.
蛋白主名 其他名称

splicing factor 3B subunit 5

pre-mRNA-splicing factor SF3b 10 kDa subunit

SF3B5 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra SF3B5 Q9BWJ5 SF3A2 Homo sapiens Q15428
Affinity Chrom
17332742
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS12764 SF3B5 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus SF3B5 MGD MGI:1913375
Canis familiaris SF3B5 VGNC VGNC:46073
Bos taurus SF3B5 VGNC VGNC:34512
Felis catus SF3B5 VGNC VGNC:65059
Rattus norvegicus SF3B5 RGD RGD:1586993
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