1. Gene
  2. SF3A2 - splicing factor 3a subunit 2 Gene

SF3A2 - splicing factor 3a subunit 2 Gene

中文名称:剪接因子 3a 亚基 2

种属: Homo sapiens

同用名: PRP11; SAP62; PRPF11; SF3a66

基因 ID: 8175 | 基因类型: protein coding

关于 SF3A2

Cytogenetic location: 19p13.3 Genomic coordinates (GRCh38): 19:2,236,824-2,248,655 (from NCBI)

This gene has 7 transcripts (splice variants) and 202 orthologues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 28.5), ovary (RPKM 22.4) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码剪接因子 3a 蛋白复合物的第 2 亚基。剪接因子 3a 异源三聚体包括亚基 1、2 和 3,并且是将 15S U2 snRNP 体外转化为活性 17S 颗粒以执行 pre-mRNA 剪接所必需的。亚基 2 通过其氨基末端与亚基 1 相互作用,而亚基 2 的单个锌指结构域在其与 15S U2 snRNP 的结合中发挥作用。亚基 2 也可以独立于其 RNA 剪接功能作为微管结合蛋白发挥作用。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

This gene encodes subunit 2 of the splicing factor 3a protein complex. The splicing factor 3a heterotrimer includes subunits 1, 2 and 3 and is necessary for the in vitro conversion of 15S U2 snRNP into an active 17S particle that performs pre-mRNA splicing. Subunit 2 interacts with subunit 1 through its amino-terminus while the single zinc finger domain of subunit 2 plays a role in its binding to the 15S U2 snRNP. Subunit 2 may also function independently of its RNA splicing function as a microtubule-binding protein. [provided by RefSeq, Jul 2008]

SF3A2 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_007165.5 NP_009096.2 splicing factor 3A subunit 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
17332742 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in U2-type prespliceosome assembly IDA
IDA: 通过直接分析推断
11533230 GOA
involved in mRNA processing IMP
IMP: 通过突变表型推断
15647371 GOA
involved in mRNA splicing, via spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
29360106 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of U2 snRNP IDA
IDA: 通过直接分析推断
11533230 GOA
part of U2-type precatalytic spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
29360106 GOA
part of U2-type spliceosomal complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
32494006 GOA
part of U2-type spliceosomal complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
10882114 GOA
part of catalytic step 2 spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
11991638 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
18559850 GOA
part of spliceosomal complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
9731529 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

SF3A2 蛋白结构

zf-met

zf-met: Zinc-finger of C2H2 type (54 - 78)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 464 a.a.
蛋白主名 其他名称

splicing factor 3A subunit 2

SAP 62

SF3A2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SF3A2 Q15428 SNRNP200 Homo sapiens O75643
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 SNRNP200 Homo sapiens O75643
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 DNAJC8 Homo sapiens O75937
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SF3B6 Homo sapiens Q9Y3B4
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 PLRG1 Homo sapiens O43660
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SF3A3 Homo sapiens Q12874
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SNRPB2 Homo sapiens P08579
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SF3A1 Homo sapiens Q15459
Crosslink
30021884
种属内
SF3A2 Q15428 SF3A1 Homo sapiens Q15459
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SF3A1 Homo sapiens Q15459
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 SF3A1 Homo sapiens Q15459
Y2H
22365833
种属内
SF3A2 Q15428 DHX15 Homo sapiens O43143
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 LIN54 Homo sapiens Q6MZP7
Validated Y2H
32296183
种属内
SF3A2 Q15428 MISP Homo sapiens Q8IVT2
Validated Y2H
32296183
种属内
SF3A2 Q15428 PHF5A Homo sapiens Q7RTV0
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 SF3B5 Homo sapiens Q9BWJ5
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SNRPD2 Homo sapiens P62316
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SNRPD2 Homo sapiens P62316
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 SF3B3 Homo sapiens Q15393
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SNRPE Homo sapiens P62304
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 SF3B4 Homo sapiens Q15427
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 SF3B4 Homo sapiens Q15427
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 HSPA8 Homo sapiens P11142
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 SNRPF Homo sapiens P62306
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SNRPF Homo sapiens P62306
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 TFG Homo sapiens Q92734
Validated Y2H
32296183
种属内
SF3A2 Q15428 EFTUD2 Homo sapiens Q15029
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SNRPD1 Homo sapiens P62314
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SNRPD1 Homo sapiens P62314
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 SNRPB Homo sapiens P14678
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 CDC5L Homo sapiens Q99459
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 CDC5L Homo sapiens Q99459
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 ACIN1 Homo sapiens Q9UKV3
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 NCBP1 Homo sapiens Q09161
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 PRPF6 Homo sapiens O94906
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 PRPF6 Homo sapiens O94906
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 PRPF8 Homo sapiens Q6P2Q9
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 DDX23 Homo sapiens Q9BUQ8
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SART1 Homo sapiens O43290
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SART1 Homo sapiens O43290
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 TRIP10 Homo sapiens Q15642-2
Validated Y2H
32296183
种属内
SF3A2 Q15428 PNN Homo sapiens Q9H307
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 PNN Homo sapiens Q9H307
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 HTATSF1 Homo sapiens O43719
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 HTATSF1 Homo sapiens O43719
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 DDX42 Homo sapiens Q86XP3
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 TRA2B Homo sapiens P62995
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 PRPF3 Homo sapiens O43395
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SF1 Homo sapiens Q15637
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 SF3B2 Homo sapiens Q13435
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SF3B2 Homo sapiens Q13435
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 SNRPA1 Homo sapiens P09661
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SF3B1 Homo sapiens O75533
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3A2 Q15428 SF3B1 Homo sapiens O75533
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3A2 Q15428 BAIAP2 Homo sapiens Q9UQB8-6
Validated Y2H
32296183
种属内
SF3A2 Q15428 BEND2 Homo sapiens Q8NDZ0
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus SF3A2 MGD MGI:104912
Rattus norvegicus SF3A2 RGD RGD:1308627
Felis catus SF3A2 VGNC VGNC:65053
Bos taurus SF3A2 VGNC VGNC:34507
Macaca mulatta SF3A2 VGNC VGNC:77178
Canis familiaris SF3A2 VGNC VGNC:46068