2. Gene
  3. SF3A1 - splicing factor 3a subunit 1 Gene

SF3A1 - splicing factor 3a subunit 1 Gene

  • 基因
  • 蛋白
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中文名称：剪接因子 3a 亚基 1

种属: Homo sapiens

同用名: PRP21; PRPF21; SAP114; SF3A120

基因 ID: 10291 | 基因类型: protein coding

关于 SF3A1

Cytogenetic location: 22q12.2 Genomic coordinates (GRCh38): 22:30,331,988-30,356,894 (from NCBI)

This gene has 10 transcripts (splice variants) and 210 orthologues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 34.4), ovary (RPKM 24.5) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码剪接因子 3a 蛋白复合物的一个亚基。剪接因子 3a 异源三聚体是成熟 U2 小核核糖核蛋白颗粒 (snRNP) 的一个组成部分。 U2 小核核糖核蛋白在剪接体组装和 pre-mRNA 剪接中起关键作用。[RefSeq 提供，2014 年 8 月]

This gene encodes a subunit of the splicing factor 3a protein complex. The splicing factor 3a heterotrimer is a component of the mature U2 small nuclear ribonucleoprotein particle (snRNP). U2 small nuclear ribonucleoproteins play a critical role in spliceosome assembly and pre-mRNA splicing. [provided by RefSeq, Aug 2014]

SF3A1 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_005877.6 NP_005868.1 splicing factor 3A subunit 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables RNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
10882114 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
10976766 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in U2-type prespliceosome assembly IDA
IDA: 通过直接分析推断
10882114 GOA
involved in mRNA processing IMP
IMP: 通过突变表型推断
15647371 GOA
involved in mRNA splicing, via spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
10882114 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of U2 snRNP IDA
IDA: 通过直接分析推断
10882114 GOA
part of U2-type precatalytic spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
10882114 GOA
part of U2-type prespliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
10882114 GOA
part of U2-type spliceosomal complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
10882114 GOA
part of U2-type spliceosomal complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
10882114 GOA
part of catalytic step 2 spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
11991638 GOA
located in nuclear speck IDA
IDA: 通过直接分析推断
21349847 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
10882114 GOA
part of spliceosomal complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
9731529 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SF3A1 蛋白结构

Surp

Surp: Surp module (50 - 102)

Surp

Surp: Surp module (163 - 215)

PRP21_like_P

PRP21_like_P: Pre-mRNA splicing factor PRP21 like protein (226 - 472)

ubiquitin

ubiquitin: Ubiquitin family (722 - 788)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 793 a.a.
蛋白主名 其他名称

splicing factor 3A subunit 1

SAP 114

SF3A1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra SF3A1 Q15459 SF3A3 Homo sapiens Q12874
Anti Tag CoIP
33961781
Intra SF3A1 Q15459 SF3A3 Homo sapiens Q12874
Anti Tag CoIP
28514442
Intra SF3A1 Q15459 SF3A3 Homo sapiens Q12874
Anti Tag CoIP
22365833
Intra SF3A1 Q15459 SF3A3 Homo sapiens Q12874
Y2H
22365833
Intra SF3A1 Q15459 SF3A3 Homo sapiens Q12874
Anti Tag CoIP
35271311
Intra SF3A1 Q15459 SF3A2 Homo sapiens Q15428
Anti Tag CoIP
22365833
Intra SF3A1 Q15459 SF3A2 Homo sapiens Q15428
Anti Tag CoIP
35271311
Intra SF3A1 Q15459 MAP1LC3C Homo sapiens Q9BXW4
Pull Down
20562859
Intra SF3A1 Q15459 SP1 Homo sapiens P08047
Y2H
10976766
Intra SF3A1 Q15459 PRPF40A Homo sapiens O75400
Anti Tag CoIP
35271311
Intra SF3A1 Q15459 RBM10 Homo sapiens P98175
Y2H
22365833
Intra SF3A1 Q15459 SF1 Homo sapiens Q15637
Pull Down
26420826
Intra SF3A1 Q15459 SF1 Homo sapiens Q15637
Y2H
22365833
Intra SF3A1 Q15459 SF1 Homo sapiens Q15637
Y2H Fragment Pooling
26420826
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Retinitis Pigmentosa 61

RP61

Retinitis Pigmentosa, Type 61
疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

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Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

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Lymphoplasmacytic Lymphoma

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生物活性分子 (1)
目录号 产品名 作用方式
纯度 Phase
HY-111517 H3B-8800 98.85% Phase 1
Pre-clinical Phase
生物活性分子 (8)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-16399 Pladienolide B ≥99.0% 否
HY-141881 PROTAC-O4I2 99.66% 否
HY-16466 Spliceostatin A 95.09% 否
HY-146221 Dyrk1A-IN-5 Inhibitor 98.56% 否
HY-162386 UM4118 Inducer 99.95% 否
HY-RS12757 SF3A1 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否
HY-RS12760 SF3B1 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否
HY-158783 SACLAC / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus SF3A1 VGNC VGNC:65052
Bos taurus SF3A1 VGNC VGNC:34506
Rattus norvegicus SF3A1 RGD RGD:1311477
Mus musculus SF3A1 MGD MGI:1914715
Canis familiaris SF3A1 VGNC VGNC:46067
Macaca mulatta SF3A1 VGNC VGNC:77177
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