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  3. SF3B6 - splicing factor 3b subunit 6 Gene

SF3B6 - splicing factor 3b subunit 6 Gene

  • 基因
  • 蛋白
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中文名称：剪接因子 3b 亚基 6

种属: Homo sapiens

同用名: P14; Ht006; SAP14; SAP14a; SF3B14; CGI-110; HSPC175; SF3B14a

基因 ID: 51639 | 基因类型: protein coding

关于 SF3B6

Cytogenetic location: 2p23.3 Genomic coordinates (GRCh38): 2:24,067,586-24,076,326 (from NCBI)

This gene has 2 transcripts (splice variants) and 216 orthologues. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 53.9), colon (RPKM 39.5) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码剪接因子 3b 复合体的 14 kDa 蛋白质亚基。剪接因子 3b 与剪接体的 U2 和 U11/U12 小核核糖核蛋白复合物 (U2 snRNP) 相关。这种 14 kDa 的蛋白质直接与剪接因子 3b 复合物的亚基 1 相互作用。这种 14 kDa 的蛋白质还直接与腺苷相互作用，腺苷在 pre-mRNA 分支位点执行第一个酯交换步骤的剪接。[RefSeq 提供，2008 年 7 月]

This gene encodes a 14 kDa protein subunit of the splicing factor 3b complex. Splicing factor 3b associates with both the U2 and U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein complexes (U2 snRNP) of spliceosomes. This 14 kDa protein interacts directly with subunit 1 of the splicing factor 3b complex. This 14 kDa protein also interacts directly with the adenosine that carries out the first transesterification step of splicing at the pre-mRNA branch site. [provided by RefSeq, Jul 2008]

SF3B6 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_016047.4 NP_057131.1 splicing factor 3B subunit 6
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables mRNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
16432215 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16432215 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in mRNA splicing, via spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
27720643 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of U12-type spliceosomal complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
15146077 GOA
part of U2-type spliceosomal complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
32494006 GOA
part of U2-type spliceosomal complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
27720643 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
27720643 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SF3B6 蛋白结构

RRM_1

RRM_1: RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) (21 - 87)

  • 0
  • 100
  • 125 a.a.
蛋白主名 其他名称

splicing factor 3B subunit 6

SF3b 14 kDa subunit

SF3B6 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SF3B6 Q9Y3B4 SF3B1 Homo sapiens O75533-1
X-Ray Diffraction
16432215
种属内
SF3B6 Q9Y3B4 SF3B1 Homo sapiens O75533-1
GMS
16432215
种属内
SF3B6 Q9Y3B4 SF3B1 Homo sapiens O75533-1
Pull Down
16432215
种属内
SF3B6 Q9Y3B4 SF3A2 Homo sapiens Q15428
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SF3B6 Q9Y3B4 SF3A2 Homo sapiens Q15428
Affinity Chrom
17332742
种属内
SF3B6 Q9Y3B4 SF3B1 Homo sapiens O75533
Anti Tag CoIP
35271311
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS12765 SF3B6 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta SF3B6 VGNC VGNC:97825
Mus musculus SF3B6 MGD MGI:1913305
Bos taurus SF3B6 VGNC VGNC:34513
Rattus norvegicus SF3B6 RGD RGD:2318878
Canis familiaris SF3B6 VGNC VGNC:46074
Felis catus SF3B6 VGNC VGNC:81219
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