SNRPB2 - small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B2 Gene

中文名称：小核核糖核蛋白多肽 B2

种属: Homo sapiens

同用名: Msl1; U2B''

基因 ID: 6629 | 基因类型: protein coding

关于 SNRPB2

Cytogenetic location: 20p12.1 Genomic coordinates (GRCh38): 20:16,730,026-16,742,564 (from NCBI)

This gene has 3 transcripts (splice variants), 248 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in lymph node (RPKM 22.1), appendix (RPKM 20.1) and 25 other tissues.

功能概要

在 snRNP-A' 存在的情况下，该基因编码的蛋白质与 U2 小核糖核蛋白 (U2 snRNP) 的茎环 IV 相关联。编码的蛋白质可能在 pre-mRNA 剪接中发挥作用。来自系统性红斑狼疮患者的自身抗体经常识别编码蛋白上的表位。已发现该基因编码相同蛋白质的两个转录变体。[RefSeq 提供，2008 年 7 月]

The protein encoded by this gene associates with stem loop IV of U2 small nuclear ribonucleoprotein (U2 snRNP) in the presence of snRNP-A'. The encoded protein may play a role in pre-mRNA splicing. Autoantibodies from patients with systemic lupus erythematosus frequently recognize epitopes on the encoded protein. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

SNRPB2 基因产物(2)

mRNA	Protein	Name
NM_003092.5	NP_003083.1	U2 small nuclear ribonucleoprotein B''
NM_198220.3	NP_937863.1	U2 small nuclear ribonucleoprotein B''

基因本体论

分子功能
生物过程
细胞组分

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	9716128	GOA

生物过程 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
involved in mRNA splicing, via spliceosome	IDA IDA: 通过直接分析推断	28076346	GOA

细胞组分 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
part of U2 snRNP	IDA IDA: 通过直接分析推断	2951739	GOA
part of U2-type catalytic step 2 spliceosome	IDA IDA: 通过直接分析推断	28076346	GOA
part of U2-type precatalytic spliceosome	IDA IDA: 通过直接分析推断	28781166	GOA
part of U2-type spliceosomal complex	IDA IDA: 通过直接分析推断	32494006	GOA
part of catalytic step 2 spliceosome	IDA IDA: 通过直接分析推断	11991638	GOA
located in nucleus	IDA IDA: 通过直接分析推断	28076346	GOA
part of spliceosomal complex	IDA IDA: 通过直接分析推断	9731529	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SNRPB2 蛋白结构

RRM_5

RRM_1

0
100
200
225 a.a.

蛋白主名

其他名称

U2 small nuclear ribonucleoprotein B''

U2 snRNP B''

SNRPB2 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
种属内	SNRPB2	P08579	HOMEZ	Homo sapiens	Q8IX15-3	Y2H Array	25416956
种属内	SNRPB2	P08579	HOMEZ	Homo sapiens	Q8IX15-3	Validated Y2H	25416956
种属内	SNRPB2	P08579	ZBTB14	Homo sapiens	O43829	Y2H Array	25416956
种属内	SNRPB2	P08579	ZBTB14	Homo sapiens	O43829	Y2H Array	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	ZBTB14	Homo sapiens	O43829	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	CMTM6	Homo sapiens	Q9NX76	Validated Y2H	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	CMTM6	Homo sapiens	Q9NX76	Y2H Array	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	CMTM6	Homo sapiens	Q9NX76	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	SF3A2	Homo sapiens	Q15428	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	SNRPB2	P08579	SF3A2	Homo sapiens	Q15428	Anti Tag CoIP	35271311
种属内	SNRPB2	P08579	SF3A2	Homo sapiens	Q15428	Affinity Chrom	17332742
种属内	SNRPB2	P08579	HMBOX1	Homo sapiens	Q6NT76	Validated Y2H	25416956
种属内	SNRPB2	P08579	PNMA1	Homo sapiens	Q8ND90	Validated Y2H	25416956
种属内	SNRPB2	P08579	PNMA1	Homo sapiens	Q8ND90	BFG-2H	27107012
种属内	SNRPB2	P08579	PNMA1	Homo sapiens	Q8ND90	Validated Y2H	27107012
种属内	SNRPB2	P08579	PNMA1	Homo sapiens	Q8ND90	Y2H Prey Pooling	25416956
种属内	SNRPB2	P08579	SNRPD3	Homo sapiens	P62318	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	SNRPB2	P08579	MCM6	Homo sapiens	Q14566	Y2H Array	25416956
种属内	SNRPB2	P08579	ALAS1	Homo sapiens	P13196	Y2H Array	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	ALAS1	Homo sapiens	P13196	Validated Y2H	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	ALAS1	Homo sapiens	P13196	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	GABPB1	Homo sapiens	Q06547	Y2H Prey Pooling	25416956
种属内	SNRPB2	P08579	GABPB1	Homo sapiens	Q06547	Y2H Array	25416956
种属内	SNRPB2	P08579	NAP1L5	Homo sapiens	Q96NT1	Validated Y2H	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	NAP1L5	Homo sapiens	Q96NT1	Y2H Array	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	NAP1L5	Homo sapiens	Q96NT1	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	TRIM27	Homo sapiens	P14373	Y2H Array	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	TRIM27	Homo sapiens	P14373	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	TRIM27	Homo sapiens	P14373	Validated Y2H	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	TRIM23	Homo sapiens	P36406	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	TRIM23	Homo sapiens	P36406	Validated Y2H	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	TRIM23	Homo sapiens	P36406	Y2H Array	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	MTUS2	Homo sapiens	Q5JR59	Y2H Prey Pooling	25416956
种属内	SNRPB2	P08579	PICK1	Homo sapiens	Q9NRD5	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	PICK1	Homo sapiens	Q9NRD5	Validated Y2H	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	PICK1	Homo sapiens	Q9NRD5	Y2H Array	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	GABPB2	Homo sapiens	Q8TAK5	Y2H Array	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	GABPB2	Homo sapiens	Q8TAK5	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	GABPB2	Homo sapiens	Q8TAK5	Validated Y2H	32296183
种属内	SNRPB2	P08579	SNRPA1	Homo sapiens	P09661	Y2H	22365833
种属内	SNRPB2	P08579	SNRPA1	Homo sapiens	P09661	Y2H Array	31515488
种属内	SNRPB2	P08579	SNRPA1	Homo sapiens	P09661	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	SNRPB2	P08579	SNRPA1	Homo sapiens	P09661	Anti Tag CoIP	35271311

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称

别名

Spinal Muscular Atrophy

Sma	5q Sma
Proximal Sma	Sma-Associated Sma
Spinal Amyotrophies	Spinal Amyotrophy
Spinal Muscle Degeneration	Spinal Muscle Wasting
Muscular Atrophy Spinal	Atrophy, Muscular, Spinal
Hereditary Motor Neuronopathy	Progressive Muscular Atrophy
Sma - [Spinal Muscular Atrophy]

Systemic Lupus Erythematosus

Lupus Nephritis	SLE
Disseminated Lupus Erythematosus	Systemic Lupus Erythematosus, Susceptibility To
Lupus Erythematosus, Systemic	Lupus Nephritis, Susceptibility To
Libman-Sacks Disease	Systemic Lupus Erythematosus Susceptibility To
Sle - Lupus Erythematosus, Systemic	Le Syndrome
Lupus	Lupus Erythematosus Systemic
Lupus Erythematosus, Systemic, Susceptibility To	Lupus Vulgaris
Lupus Erythematosus, Discoid	Lupus Erythematosus
Systemic Lupus Erythematosus Nos	Sle - [Systemic Lupus Erythematosus]

疾病名称	别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia	Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-RS13503	SNRPB2 Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Rattus norvegicus	SNRPB2	RGD	RGD:1310194
Felis catus	SNRPB2	VGNC	VGNC:65536
Mus musculus	SNRPB2	MGD	MGI:104805
Macaca mulatta	SNRPB2	VGNC	VGNC:108058
Bos taurus	SNRPB2	VGNC	VGNC:35077

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