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CMTM6 - CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 6 Gene

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中文名称：含 CKLF 样 MARVEL 跨膜结构域 6

种属: Homo sapiens

同用名: CKLFSF6; PRO2219

基因 ID: 54918 | 基因类型: protein coding

关于 CMTM6

Cytogenetic location: 3p22.3 Genomic coordinates (GRCh38): 3:32,481,312-32,502,852 (from NCBI)

This gene has 3 transcripts (splice variants), 205 orthologues and 14 paralogues. Ubiquitous expression in appendix (RPKM 47.3), thyroid (RPKM 44.1) and 25 other tissues.

功能概要

该基因属于趋化因子样因子基因超家族，这是一个类似于趋化因子和跨膜 4 超家族的新家族。该基因是位于 3 号染色体簇中的几个趋化因子样因子基因之一。该基因在许多组织中广泛表达，但编码蛋白质的确切功能尚不清楚。[RefSeq 提供，2008 年 7 月]

This gene belongs to the chemokine-like factor gene superfamily, a novel family that is similar to the chemokine and transmembrane 4 superfamilies. This gene is one of several chemokine-like factor genes located in a cluster on chromosome 3. This gene is widely expressed in many tissues, but the exact function of the encoded protein is unknown. [provided by RefSeq, Jul 2008]

CMTM6 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_017801.3 NP_060271.1 CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
28813410 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in endocytic recycling IMP
IMP: 通过突变表型推断
28813417 GOA
involved in protein transport IMP
IMP: 通过突变表型推断
28813417 GOA
involved in regulation of protein stability IMP
IMP: 通过突变表型推断
28813410 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in early endosome membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
28813417 GOA
located in plasma membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
28813410 GOA
located in recycling endosome membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
28813417 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

CMTM6 蛋白结构

MARVEL

MARVEL: Membrane-associating domain (39 - 153)

  • 0
  • 100
  • 183 a.a.
蛋白主名 其他名称

CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6

chemokine-like factor super family 6

CMTM6 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
CMTM6 Q9NX76 CD274 Homo sapiens Q9NZQ7
Anti Bait CoIP
28813410
种属内
CMTM6 Q9NX76 CD274 Homo sapiens Q9NZQ7
Confocal
28813417
种属内
CMTM6 Q9NX76 CD274 Homo sapiens Q9NZQ7
Anti Bait CoIP
28813417
种属内
CMTM6 Q9NX76 CD40 Homo sapiens P25942
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CMTM6 Q9NX76 CD40 Homo sapiens P25942
Y2H Array
32296183
种属内
CMTM6 Q9NX76 RUSC1 Homo sapiens Q9BVN2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CMTM6 Q9NX76 SPG21 Homo sapiens Q9NZD8
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS02868 CMTM6 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus CMTM6 MGD MGI:2447165
Macaca mulatta CMTM6 VGNC VGNC:84199
Rattus norvegicus CMTM6 RGD RGD:1307765
Canis familiaris CMTM6 VGNC VGNC:39383
Bos taurus CMTM6 VGNC VGNC:27486
Felis catus CMTM6 VGNC VGNC:102677
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