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HTATSF1 - HIV-1 Tat specific factor 1 Gene

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中文名称：HIV-1 Tat 特异性因子 1

种属: Homo sapiens

同用名: TATSF1; TAT-SF1; dJ196E23.2

基因 ID: 27336 | 基因类型: protein coding

关于 HTATSF1

Cytogenetic location: Xq26.3 Genomic coordinates (GRCh38): X:136,497,229-136,512,346 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants) and 217 orthologues. Ubiquitous expression in adrenal (RPKM 48.7), brain (RPKM 28.0) and 25 other tissues.

功能概要

由该基因编码的蛋白质作为辅助因子来刺激 HIV-1 Tat 的转录延伸，它通过 Tat-TAR 相互作用与 HIV-1 启动子结合。这种蛋白质还可以作为一种双重功能因子来偶联转录和剪接并促进它们的相互激活。已发现该基因的可变剪接转录本变体。[RefSeq 提供，2009 年 9 月]

The protein encoded by this gene functions as a cofactor for the stimulation of transcriptional elongation by HIV-1 Tat, which binds to the HIV-1 promoter through Tat-TAR interaction. This protein may also serve as a dual-function factor to couple transcription and splicing and to facilitate their reciprocal activation. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene.[provided by RefSeq, Sep 2009]

HTATSF1 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001163280.2 NP_001156752.1 HIV Tat-specific factor 1
NM_014500.5 NP_055315.2 HIV Tat-specific factor 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables chromatin-protein adaptor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
35597237 GOA
enables poly-ADP-D-ribose modification-dependent protein binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
35597237 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
17332742 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in U2-type prespliceosome assembly IDA
IDA: 通过直接分析推断
32494006 GOA
involved in double-strand break repair via homologous recombination IDA
IDA: 通过直接分析推断
35597237 GOA
involved in mRNA splicing, via spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
32494006 GOA
involved in protein localization to site of double-strand break IDA
IDA: 通过直接分析推断
35597237 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of U2-type spliceosomal complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
32494006 GOA
is active in site of double-strand break IDA
IDA: 通过直接分析推断
35597237 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

HTATSF1 蛋白结构

RRM_1

RRM_1: RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) (135 - 212)

RRM_5

RRM_5: RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) (291 - 344)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 755 a.a.
蛋白主名 其他名称

HIV Tat-specific factor 1

HIV TAT specific factor 1

HTATSF1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
HTATSF1 O43719 SF3B1 Homo sapiens O75533-1
ITC
30567737
种属内
HTATSF1 O43719 SF3B1 Homo sapiens O75533-1
X-Ray Diffraction
30567737
种属内
HTATSF1 O43719 SF3B1 Homo sapiens O75533-1
Pull Down
30567737
种属内
HTATSF1 O43719 SF3B1 Homo sapiens O75533-1
Anti Bait CoIP
30567737
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS06454 HTATSF1 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus HTATSF1 MGD MGI:1919709
Bos taurus HTATSF1 VGNC VGNC:29990
Macaca mulatta HTATSF1 VGNC VGNC:73535
Felis catus HTATSF1 VGNC VGNC:67666
Canis familiaris HTATSF1 VGNC VGNC:41822
Rattus norvegicus HTATSF1 RGD RGD:1563377
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