LIN54 - lin-54 DREAM MuvB core complex component Gene

中文名称：lin-54 DREAM MuvB 核心复杂组件

种属: Homo sapiens

同用名: TCX1; JC8.6; CXCDC1; MIP120

基因 ID: 132660 | 基因类型: protein coding

关于 LIN54

Cytogenetic location: 4q21.22 Genomic coordinates (GRCh38): 4:82,924,603-83,012,941 (from NCBI)

This gene has 10 transcripts (splice variants), 206 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in thyroid (RPKM 5.1), esophagus (RPKM 4.0) and 25 other tissues.

功能概要

LIN54 是 LIN 或 DREAM 复合体的一个组成部分，它是细胞周期基因的重要调节因子 (Schmit 等人，2009 [PubMed 19725879]) 。[OMIM 提供，2010 年 12 月]

LIN54 is a component of the LIN, or DREAM, complex, an essential regulator of cell cycle genes (Schmit et al., 2009 [PubMed 19725879]).[supplied by OMIM, Dec 2010]

LIN54 基因产物(5)

mRNA	Protein	Name
NM_001115007.3	NP_001108479.1	protein lin-54 homolog isoform b
NM_001115008.3	NP_001108480.1	protein lin-54 homolog isoform b
NM_001288996.2	NP_001275925.1	protein lin-54 homolog isoform c
NM_001288997.1	NP_001275926.1	protein lin-54 homolog isoform b
NM_194282.4	NP_919258.2	protein lin-54 homolog isoform a

基因本体论

分子功能
生物过程
细胞组分

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables minor groove of adenine-thymine-rich DNA binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	27465258	GOA
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	17531812	GOA
enables transcription regulatory region nucleic acid binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	27465258	GOA

生物过程 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
acts upstream of or within nucleosome organization	IDA IDA: 通过直接分析推断	27465258	GOA

细胞组分 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
part of RNA polymerase II transcription repressor complex	IDA IDA: 通过直接分析推断	27465258	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

LIN54 蛋白结构

TCR

0
200
400
600
749 a.a.

蛋白主名

其他名称

protein lin-54 homolog

CXC domain-containing protein 1

LIN54 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
Intra	LIN54	Q6MZP7	BANP	Homo sapiens	Q8N9N5-2	Validated Y2H	32296183
Intra	LIN54	Q6MZP7	BANP	Homo sapiens	Q8N9N5-2	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	LIN54	Q6MZP7	BANP	Homo sapiens	Q8N9N5-2	Y2H Array	32296183
Intra	LIN54	Q6MZP7	MYBL2	Homo sapiens	P10244	Anti Tag CoIP	19725879
Intra	LIN54	Q6MZP7	MYBL2	Homo sapiens	P10244	Anti Bait CoIP	17531812
Intra	LIN54	Q6MZP7	SF3A2	Homo sapiens	Q15428	Y2H Array	32296183
Intra	LIN54	Q6MZP7	SF3A2	Homo sapiens	Q15428	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	LIN54	Q6MZP7	ZNF143	Homo sapiens	P52747	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	LIN54	Q6MZP7	ZNF143	Homo sapiens	P52747	Y2H Array	32296183
Intra	LIN54	Q6MZP7	SP3	Homo sapiens	Q02447	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	LIN54	Q6MZP7	SP3	Homo sapiens	Q02447	Y2H Array	32296183
Intra	LIN54	Q6MZP7	ZNF76	Homo sapiens	P36508	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	LIN54	Q6MZP7	ZNF76	Homo sapiens	P36508	Y2H Array	32296183
Intra	LIN54	Q6MZP7	RBL2	Homo sapiens	Q08999	Anti Tag CoIP	19725879
Intra	LIN54	Q6MZP7	RBL2	Homo sapiens	Q08999	Anti Bait CoIP	17531812

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称

别名

Spondyloarthropathy 1

Ankylosing Spondylitis	Spondyloarthropathy, Susceptibility To, 1
SPDA1	Marie-Strumpell Spondylitis
Bechterew Syndrome	Spa
Spondylarthritis Ankylopoietica	Reiter Syndrome
Ankylosing Spondylitis, Susceptibility To	Bekhterev Syndrome
Bekhterev'S Disease	Marie-Strumpell Disease
Axial Spondylarthritis	Bechterew Disease
Marie-Struempell Disease	Spondylitis Ankylopoietica
Spondyloarthritis	Spondyloarthritis Ankylopoietica
Spas	Ankylosing Spondylarthritis
Psoriatic Arthritis	Reactive Arthritis
Rheumatoid Spondylitis	Spondylitis Ankylosans
Spondylitis Ankylosing	Spondylitis, Ankylosing
Spondylarthropathies	Arthritis, Psoriatic
Arthritis, Reactive

疾病名称	别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia	Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-RS07675	LIN54 Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Mus musculus	LIN54	MGD	MGI:2140902
Canis familiaris	LIN54	VGNC	VGNC:42685
Bos taurus	LIN54	VGNC	VGNC:30894
Rattus norvegicus	LIN54	RGD	RGD:1311361
Felis catus	LIN54	VGNC	VGNC:63232
Macaca mulatta	LIN54	VGNC	VGNC:74123

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