1. Gene
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ZNRF1 - zinc and ring finger 1 Gene

中文名称:锌和无名指 1

种属: Homo sapiens

同用名: NIN283

基因 ID: 84937 | 基因类型: protein coding

关于 ZNRF1

Cytogenetic location: 16q23.1 Genomic coordinates (GRCh38): 16:74,999,024-75,110,994 (from NCBI)

This gene has 11 transcripts (splice variants), 203 orthologues and 2 paralogues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 4.3), thyroid (RPKM 4.3) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码一种在神经细胞分化中起作用的 E3 泛素蛋白连接酶。该基因的过度表达会导致神经突样伸长。编码的蛋白质包含锌指和无名指基序,位于核内体/溶酶体区室中,表明它可能参与泛素介导的蛋白质修饰,以及神经元中的突触小泡膜。[RefSeq 提供,2012 年 2 月]

This gene encodes an E3 ubiquitin-protein Ligase that plays a role in neural-cell differentiation. Overexpression of this gene causes neurite-like elongation. The encoded protein contains both a zinc finger and a RING finger motif and is localized in the endosome/lysosome compartment, indicating that it may be involved in ubiquitin-mediated protein modification, and in synaptic vessicle membranes in neurons. [provided by RefSeq, Feb 2012]

ZNRF1 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_032268.5 NP_115644.1 E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
19549727 GOA
enables ubiquitin protein ligase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
22797923 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in positive regulation of autophagosome-lysosome fusion IGI
IGI: 通过遗传相互作用推断
38360932 GOA
involved in positive regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway IDA
IDA: 通过直接分析推断
28593998 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
is active in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
22797923 GOA
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
38360932 GOA
located in cytosol IDA
IDA: 通过直接分析推断
22797923 GOA
located in membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
22797923 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

ZNRF1 蛋白结构

zf-RING_2

zf-RING_2: Ring finger domain (182 - 222)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 227 a.a.
蛋白主名 其他名称

E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1

RING-type E3 ubiquitin transferase ZNRF1

ZNRF1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
ZNRF1 Q8ND25 UBE2V1 Homo sapiens Q13404 19549727
种属内
ZNRF1 Q8ND25 UBE2N Homo sapiens P61088 19549727
种属内
ZNRF1 Q8ND25 UBE2N Homo sapiens P61088 33961781
种属内
ZNRF1 Q8ND25 UBE2N Homo sapiens P61088
Y2H
19549727
种属内
ZNRF1 Q8ND25 UBE2D2 Homo sapiens P62837 19690564
种属内
ZNRF1 Q8ND25 UBE2D3 Homo sapiens P61077 19690564
种属内
ZNRF1 Q8ND25 UBE2E1 Homo sapiens P51965 19549727
种属内
ZNRF1 Q8ND25 UBE2D1 Homo sapiens P51668 19549727
种属内
ZNRF1 Q8ND25 UBE2D1 Homo sapiens P51668 19549727
种属内
ZNRF1 Q8ND25 UBE2D1 Homo sapiens P51668
Y2H
19549727
种属内
ZNRF1 Q8ND25 UBE2D4 Homo sapiens Q9Y2X8 19549727
种属内
ZNRF1 Q8ND25 UBE2D4 Homo sapiens Q9Y2X8
Y2H
19549727
种属内
ZNRF1 Q8ND25 UBE2D4 Homo sapiens Q9Y2X8 32296183
种属内
ZNRF1 Q8ND25 UBE2D4 Homo sapiens Q9Y2X8 19690564
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Intermittent Explosive Disorder

Explosive Personality Disorder

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta ZNRF1 VGNC VGNC:79140
Felis catus ZNRF1 VGNC VGNC:67371
Rattus norvegicus ZNRF1 RGD RGD:1592195
Canis familiaris ZNRF1 VGNC VGNC:48839
Bos taurus ZNRF1 VGNC VGNC:37363
Mus musculus ZNRF1 MGD MGI:2177308