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SCEL - sciellin Gene

中文名称:谢林

种属: Homo sapiens

基因 ID: 8796 | 基因类型: protein coding

关于 SCEL

Cytogenetic location: 13q22.3 Genomic coordinates (GRCh38): 13:77,535,706-77,645,263 (from NCBI)

This gene has 5 transcripts (splice variants), 146 orthologues and 1 paralogue. Biased expression in esophagus (RPKM 207.5), skin (RPKM 141.4) and 1 other tissue.

功能概要

由该基因编码的蛋白质是终末分化角质形成细胞角质化包膜的前体。这种蛋白质定位于细胞外围,可能在角质化包膜中的蛋白质组装或调节中发挥作用。存在编码不同异构体的转录变体。文献中描述了利用替代 polyA 信号的转录变体,但尚未确定其全长性质。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

The protein encoded by this gene is a precursor to the cornified envelope of terminally differentiated keratinocytes. This protein localizes to the periphery of cells and may function in the assembly or regulation of proteins in the cornified envelope. Transcript variants encoding different isoforms exist. A transcript variant utilizing an alternative polyA signal has been described in the literature, but its full-length nature has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

SCEL 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001160706.2 NP_001154178.1 sciellin isoform 3
NM_003843.4 NP_003834.3 sciellin isoform 2
NM_144777.3 NP_659001.2 sciellin isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
14632196 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in keratinocyte differentiation IDA
IDA: 通过直接分析推断
14632196 GOA
involved in positive regulation of canonical Wnt signaling pathway IMP
IMP: 通过突变表型推断
27013588 GOA
involved in response to mechanical stimulus IEP
IEP: 通过表达模式推断
19211270 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
9813070 GOA
located in perinuclear region of cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
19211270 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断
蛋白主名 其他名称

sciellin

SCEL 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SCEL O95171 KIFC3 Homo sapiens Q9BVG8
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
SCEL O95171 KIFC3 Homo sapiens Q9BVG8
Validated Y2H
25416956
种属内
SCEL O95171 NMI Homo sapiens Q13287
Validated Y2H
25416956
种属内
SCEL O95171 NMI Homo sapiens Q13287
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
SCEL O95171 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Validated Y2H
25416956
种属内
SCEL O95171 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Y2H
21516116
种属内
SCEL O95171 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
SCEL O95171 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Y2H Array
25416956
种属内
SCEL O95171 FXR2 Homo sapiens P51116
Y2H Array
31515488
种属内
SCEL O95171 FXR2 Homo sapiens P51116
Validated Y2H
25416956
种属内
SCEL O95171 FXR2 Homo sapiens P51116
Y2H Array
25416956
种属内
SCEL O95171 MTUS2 Homo sapiens Q5JR59
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
SCEL O95171 MTUS2 Homo sapiens Q5JR59
Validated Y2H
25416956
种属内
SCEL O95171 TSGA10 Homo sapiens Q9BZW7
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
SCEL O95171 TSGA10 Homo sapiens Q9BZW7
Validated Y2H
25416956
种属内
SCEL O95171 TSGA10 Homo sapiens Q9BZW7
Y2H Array
25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Canis familiaris SCEL VGNC VGNC:45902
Bos taurus SCEL VGNC VGNC:34329
Mus musculus SCEL MGD MGI:1891228
Rattus norvegicus SCEL RGD RGD:1305102
Macaca mulatta SCEL VGNC VGNC:76976
Felis catus SCEL VGNC VGNC:64906