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TGFBRAP1 - transforming growth factor beta receptor associated protein 1 Gene

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中文名称：转化生长因子β受体相关蛋白 1

种属: Homo sapiens

同用名: VPS3; TRAP1; TRAP-1

基因 ID: 9392 | 基因类型: protein coding

关于 TGFBRAP1

Cytogenetic location: 2q12.1-q12.2 Genomic coordinates (GRCh38): 2:105,249,404-105,329,735 (from NCBI)

This gene has 3 transcripts (splice variants), 206 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 7.3), thyroid (RPKM 6.4) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白质可与转化生长因子-β (TGF-β) 受体结合，并在 TGF-β 信号传导中发挥作用。编码的蛋白质在 TGF-β 下游的信号传导中充当伴侣蛋白。它参与与 SMAD4 的信号依赖性关联。该蛋白质也是哺乳动物 CORVET 的一个组成部分，CORVET 是一种多亚基束缚蛋白复合物，参与早期内体的融合。[RefSeq 提供，2016 年 6 月]

This gene encodes a protein that binds to transforming growth factor-beta (TGF-beta) receptors and plays a role in TGF-beta signaling. The encoded protein acts as a chaprone in signaling downstream of TGF-beta. It is involved in signal-dependent association with SMAD4. The protein is also a component of mammalian CORVET, a multisubunit tethering protein complex that is involved in fusion of early endosomes. [provided by RefSeq, Jun 2016]

TGFBRAP1 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001142621.3 NP_001136093.1 transforming growth factor-beta receptor-associated protein 1 isoform 1
NM_001328646.3 NP_001315575.1 transforming growth factor-beta receptor-associated protein 1 isoform 2
NM_004257.6 NP_004248.2 transforming growth factor-beta receptor-associated protein 1 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables SMAD binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
11278302 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11278302 GOA
enables transforming growth factor beta receptor binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
11278302 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in endosomal vesicle fusion IMP
IMP: 通过突变表型推断
25266290 GOA
involved in endosome to lysosome transport IMP
IMP: 通过突变表型推断
25266290 GOA
involved in regulation of DNA-templated transcription IDA
IDA: 通过直接分析推断
11278302 GOA
involved in signal transduction IDA
IDA: 通过直接分析推断
11278302 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in early endosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
25266290 GOA
located in membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
11278302 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

TGFBRAP1 蛋白结构

CNH

CNH: CNH domain (76 - 286)

Vps39_1

Vps39_1: Vacuolar sorting protein 39 domain 1 (448 - 550)

Clathrin

Clathrin: Region in Clathrin and VPS (573 - 700)

Vps39_2

Vps39_2: Vacuolar sorting protein 39 domain 2 (738 - 845)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 800
  • 860 a.a.
蛋白主名 其他名称

transforming growth factor-beta receptor-associated protein 1

TGF-beta receptor-associated protein 1

TGFBRAP1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
TGFBRAP1 Q8WUH2 VPS16 Homo sapiens Q9H269
Anti Bait CoIP
25266290
种属内
TGFBRAP1 Q8WUH2 VPS16 Homo sapiens Q9H269
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
TGFBRAP1 Q8WUH2 VPS16 Homo sapiens Q9H269
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
TGFBRAP1 Q8WUH2 VPS11 Homo sapiens Q9H270
Anti Bait CoIP
25266290
种属内
TGFBRAP1 Q8WUH2 VPS11 Homo sapiens Q9H270
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
TGFBRAP1 Q8WUH2 VPS11 Homo sapiens Q9H270
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
TGFBRAP1 Q8WUH2 VPS8 Homo sapiens Q8N3P4
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
TGFBRAP1 Q8WUH2 VPS8 Homo sapiens Q8N3P4
Anti Bait CoIP
25266290
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS14454 TGFBRAP1 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus TGFBRAP1 VGNC VGNC:35806
Canis familiaris TGFBRAP1 VGNC VGNC:47313
Rattus norvegicus TGFBRAP1 RGD RGD:1310772
Felis catus TGFBRAP1 VGNC VGNC:66138
Mus musculus TGFBRAP1 MGD MGI:2447427
Macaca mulatta TGFBRAP1 VGNC VGNC:78396
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