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MRPL28 - mitochondrial ribosomal protein L28 Gene

中文名称:线粒体核糖体蛋白 L28

种属: Homo sapiens

同用名: p15; MAAT1

基因 ID: 10573 | 基因类型: protein coding

关于 MRPL28

Cytogenetic location: 16p13.3 Genomic coordinates (GRCh38): 16:366,969-370,538 (from NCBI)

This gene has 10 transcripts (splice variants) and 202 orthologues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 24.9), kidney (RPKM 19.3) and 25 other tissues.

功能概要

哺乳动物线粒体核糖体蛋白由核基因编码,有助于线粒体内的蛋白质合成。线粒体核糖体 (线粒体核糖体) 由一个小的 28S 亚基和一个大的 39S 亚基组成。与原核核糖体相比,它们估计有 75% 的蛋白质与 rRNA 组成,而原核核糖体的比例是相反的。哺乳动物 线粒体核糖体 和原核核糖体之间的另一个区别是后者包含 5S rRNA。在不同的物种中,构成核糖体的蛋白质在序列上有很大差异,有时在生化特性上也有很大差异,这使得序列同源性难以识别。该基因编码一个 39S 亚基蛋白,其中一部分最初是通过其以 HLA-A24 限制性方式识别酪氨酸酶的能力而被分离出来的。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

Mammalian mitochondrial ribosomal proteins are encoded by nuclear genes and help in protein synthesis within the mitochondrion. Mitochondrial ribosomes (mitoribosomes) consist of a small 28S subunit and a large 39S subunit. They have an estimated 75% protein to rRNA composition compared to prokaryotic ribosomes, where this ratio is reversed. Another difference between mammalian mitoribosomes and prokaryotic ribosomes is that the latter contain a 5S rRNA. Among different species, the proteins comprising the mitoribosome differ greatly in sequence, and sometimes in biochemical properties, which prevents easy recognition by sequence homology. This gene encodes a 39S subunit protein, a part of which was originally isolated by its ability to recognize Tyrosinase in an HLA-A24-restricted fashion. [provided by RefSeq, Jul 2008]

MRPL28 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_006428.5 NP_006419.2 39S ribosomal protein L28, mitochondrial
基因本体论
  • 分子功能
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
20601428 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of mitochondrial large ribosomal subunit IDA
IDA: 通过直接分析推断
25278503 GOA
located in mitochondrial ribosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
20601428 GOA
located in mitochondrion IDA
IDA: 通过直接分析推断
28892042 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断
蛋白主名 其他名称

39S ribosomal protein L28, mitochondrial

L28mt

MRPL28 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra MRPL28 Q13084 FAM9B Homo sapiens Q8IZU0
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra MRPL28 Q13084 NFKBID Homo sapiens Q8NI38
Y2H Array
32296183
Intra MRPL28 Q13084 NFKBID Homo sapiens Q8NI38
Validated Y2H
32296183
Intra MRPL28 Q13084 NFKBID Homo sapiens Q8NI38
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra MRPL28 Q13084 ABI2 Homo sapiens Q9NYB9-2
Validated Y2H
32296183
Intra MRPL28 Q13084 CDR2 Homo sapiens Q01850
Y2H Array
25416956
Intra MRPL28 Q13084 LARP1B Homo sapiens Q659C4-6
Validated Y2H
32296183
Intra MRPL28 Q13084 HMBOX1 Homo sapiens Q6NT76
Validated Y2H
25416956
Intra MRPL28 Q13084 HMBOX1 Homo sapiens Q6NT76
Y2H Array
25416956
Intra MRPL28 Q13084 TEF Homo sapiens Q10587
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra MRPL28 Q13084 TEF Homo sapiens Q10587
Y2H Array
25416956
Intra MRPL28 Q13084 TRAF4 Homo sapiens Q9BUZ4
Y2H Array
25416956
Intra MRPL28 Q13084 TRAF4 Homo sapiens Q9BUZ4
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra MRPL28 Q13084 TSSK3 Homo sapiens Q96PN8
Validated Y2H
32296183
Intra MRPL28 Q13084 CDCA7L Homo sapiens Q96GN5
Validated Y2H
32296183
Intra MRPL28 Q13084 ZNF655 Homo sapiens Q8N720
Y2H Array
32296183
Intra MRPL28 Q13084 ZNF655 Homo sapiens Q8N720
Validated Y2H
32296183
Intra MRPL28 Q13084 ZNF655 Homo sapiens Q8N720
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra MRPL28 Q13084 LENG1 Homo sapiens Q96BZ8
Validated Y2H
32296183
Intra MRPL28 Q13084 ENKD1 Homo sapiens Q9H0I2
Validated Y2H
32296183
Intra MRPL28 Q13084 BANP Homo sapiens Q8N9N5
Validated Y2H
25416956
Intra MRPL28 Q13084 BANP Homo sapiens Q8N9N5
Y2H Array
25416956
Intra MRPL28 Q13084 IKZF3 Homo sapiens Q9UKT9
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra MRPL28 Q13084 IKZF3 Homo sapiens Q9UKT9
Validated Y2H
25416956
Intra MRPL28 Q13084 IKZF3 Homo sapiens Q9UKT9
Y2H Array
25416956
Intra MRPL28 Q13084 SCNM1 Homo sapiens Q9BWG6
Validated Y2H
32296183
Intra MRPL28 Q13084 TSHZ3 Homo sapiens Q63HK5
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Pancreatic Serous Cystadenoma
Megalencephalic Leukoencephalopathy With Subcortical Cysts 1

Van Der Knaap Disease

Leukoencephalopathy With Swelling And Cysts

MLC1

Vacuolating Megalencephalic Leukoencephalopathy With Subcortical Cysts

Lvm

Vl

Leukoencephalopathy, Megalencephalic, With Subcortical Cysts, 1

Leukoencephalopathy, Megalencephalic, With Subcortical Cysts, Type 1

Megalencephalic Leukoencephalopathy With Subcortical Cysts

Melanoma

Malignant Melanoma

Cutaneous Melanoma

Naevocarcinoma

Malignant Melanomas

Spastic Paraplegia 10, Autosomal Dominant

SPG10

Hereditary Spastic Paraplegia 10

Autosomal Dominant Spastic Paraplegia Type 10

Spastic Paraplegia 10

Spastic Paraplegia 10 With Or Without Peripheral Neuropathy

Autosomal Dominant Spastic Paraplegia 10

Autosomal Dominant Spastic Paraplegia

Spastic Paraplegia, Autosomal Dominant

Paraplegia, Spastic, Autosomal Dominant, Type 10

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus MRPL28 RGD RGD:1583741
Macaca mulatta MRPL28 VGNC VGNC:74758
Bos taurus MRPL28 VGNC VGNC:31629
Mus musculus MRPL28 MGD MGI:1915861
Canis familiaris MRPL28 VGNC VGNC:43389
Felis catus MRPL28 VGNC VGNC:107765