POLR3F - RNA polymerase III subunit F Gene

中文名称：RNA 聚合酶 III 亚基 F

种属: Homo sapiens

同用名: C34; RPC6; RPC39; IMD101

基因 ID: 10621 | 基因类型: protein coding

关于 POLR3F

Cytogenetic location: 20p11.23 Genomic coordinates (GRCh38): 20:18,467,390-18,484,646 (from NCBI)

This gene has 22 transcripts (splice variants) and 203 orthologues. Ubiquitous expression in brain (RPKM 6.9), thyroid (RPKM 6.8) and 25 other tissues.

功能概要

由该基因编码的蛋白质是形成真核 RNA 聚合酶 III (RNA Pol III) 的十多个亚基之一，它转录 5S 核糖体 RNA 和 tRNA 基因。该蛋白已被证明可结合 TFIIIB90 和 TBP，这是 RNA 聚合酶 III 转录起始因子 IIIB (TFIIIB) 的两个亚基。与大多数其他 RNA Pol III 亚基不同，编码的蛋白质是这种聚合酶所独有的。可变剪接导致多个转录本变体。[RefSeq 提供，2013 年 9 月]

The protein encoded by this gene is one of more than a dozen subunits forming eukaryotic RNA polymerase III (RNA Pol III), which transcribes 5S ribosomal RNA and tRNA genes. This protein has been shown to bind both TFIIIB90 and TBP, two subunits of RNA polymerase III transcription initiation factor IIIB (TFIIIB). Unlike most of the Other RNA Pol III subunits, the encoded protein is unique to this polymerase. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2013]

POLR3F 基因产物(3)

mRNA	Protein	Name
NM_001282526.2	NP_001269455.1	DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6 isoform 2
NM_001410821.1	NP_001397750.1	DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6 isoform 3
NM_006466.4	NP_006457.2	DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6 isoform 1

基因本体论

分子功能
生物过程
细胞组分

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables 4 iron, 4 sulfur cluster binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	34675218	GOA
enables double-stranded DNA binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	21358628	GOA
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	11416169	GOA

生物过程 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
involved in positive regulation of innate immune response	IMP IMP: 通过突变表型推断	19631370	GOA
involved in positive regulation of interferon-beta production	IMP IMP: 通过突变表型推断	19631370	GOA

细胞组分 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
part of RNA polymerase III complex	IDA IDA: 通过直接分析推断	24107381	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

POLR3F 蛋白结构

RNA_pol_Rpc34

0
100
200
316 a.a.

蛋白主名

其他名称

DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6

RNA polymerase III C39 subunit

POLR3F 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
种属内	POLR3F	Q9H1D9	EIF2S3	Homo sapiens	P41091	Y2H Array	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	EIF2S3	Homo sapiens	P41091	Y2H Pooling	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	EIF2S3	Homo sapiens	P41091	Validated Y2H	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	KIF1B	Homo sapiens	O60333-2	Y2H Pooling	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	KIF1B	Homo sapiens	O60333-2	Validated Y2H	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	KIF1B	Homo sapiens	O60333-2	Y2H Array	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	POLR3G	Homo sapiens	O15318	Anti Tag CoIP	35271311
种属内	POLR3F	Q9H1D9	POLR3G	Homo sapiens	O15318	Anti Bait CoIP	20154270
种属内	POLR3F	Q9H1D9	APBB2	Homo sapiens	Q92870-2	Y2H Pooling	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	APBB2	Homo sapiens	Q92870-2	Validated Y2H	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	APBB2	Homo sapiens	Q92870-2	Y2H Array	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	PNRC1	Homo sapiens	Q12796	Y2H	17612402
种属内	POLR3F	Q9H1D9	POLR3GL	Homo sapiens	Q9BT43	Anti Tag CoIP	35271311
种属内	POLR3F	Q9H1D9	POLR3GL	Homo sapiens	Q9BT43	Anti Bait CoIP	20154270
种属内	POLR3F	Q9H1D9	HSPB1	Homo sapiens	P04792	Y2H Array	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	HSPB1	Homo sapiens	P04792	Validated Y2H	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	HSPB1	Homo sapiens	P04792	Y2H Pooling	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	PRP4K	Homo sapiens	Q13523	Y2H Pooling	16169070
种属内	POLR3F	Q9H1D9	PRP4K	Homo sapiens	Q13523	Anti Tag CoIP	16169070
种属内	POLR3F	Q9H1D9	PMP22	Homo sapiens	A0A6Q8PF08	Validated Y2H	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	PMP22	Homo sapiens	A0A6Q8PF08	Y2H Array	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	PMP22	Homo sapiens	A0A6Q8PF08	Y2H Pooling	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	POLR3C	Homo sapiens	Q9BUI4	Anti Tag CoIP	35271311
种属内	POLR3F	Q9H1D9	WFS1	Homo sapiens	O76024	Validated Y2H	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	WFS1	Homo sapiens	O76024	Y2H Array	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	WFS1	Homo sapiens	O76024	Y2H Pooling	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	PRPS1	Homo sapiens	P60891	Validated Y2H	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	PRPS1	Homo sapiens	P60891	Y2H Array	32814053
种属内	POLR3F	Q9H1D9	PRPS1	Homo sapiens	P60891	Y2H Pooling	32814053

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称

别名

Immunodeficiency 101

IMD101

Corneal Dystrophy, Posterior Polymorphous, 1

Posterior Polymorphous Corneal Dystrophy	Ppcd
Maumenee Corneal Dystrophy	Posterior Polymorphous Corneal Dystrophy 1
PPCD1	Corneal Dystrophy, Hereditary Polymorphous Posterior
Corneal Endothelial Dystrophy 1, Autosomal Dominant	Schlichting Dystrophy
Ched1	Corneal Endothelial Dystrophy 1, Autosomal Dominant, Formerly
Ched1, Formerly	Hereditary Polymorphus Posterior Corneal Dystrophy
Posterior Polymorphous Dystrophy	Hereditary Polymorphous Posterior Corneal Dystrophy
Dystrophy, Corneal, Posterior Polymorphous	Dystrophy, Corneal, Posterior Polymorphous, Type 1
Polymorphous Corneal Dystrophy	Corneal Endothelial Dystrophy 2

Hypomyelinating Leukoencephalopathy

Anauxetic Dysplasia 1

Anauxetic Dysplasia	Spondylometaepiphyseal Dysplasia, Menger Type
Spondylometaepiphyseal Dysplasia, Anauxetic Type	Spondyloepimetaphyseal Dysplasia, Anauxetic Type
ANXD1	Anxd
Spondylometaepiphyseal Dysplasia Anauxetic Type	Spondylometaepiphyseal Dysplasia Menger Type
Ad	Spondyloepimetaphyseal Dysplasia, Menger Type
Dysplasia, Anauxetic, Type 1

Hypomyelinating Leukodystrophy

Hld	Leukodystrophy, Hypomyelinating

疾病名称	别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia	Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-RS10859	POLR3F Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Felis catus	POLR3F	VGNC	VGNC:64294
Macaca mulatta	POLR3F	VGNC	VGNC:76032
Bos taurus	POLR3F	VGNC	VGNC:33150
Canis familiaris	POLR3F	VGNC	VGNC:44804
Rattus norvegicus	POLR3F	RGD	RGD:1306428
Mus musculus	POLR3F	MGD	MGI:1924086

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