RNF19B - ring finger protein 19B Gene

中文名称：无名指蛋白 19B

种属: Homo sapiens

同用名: NKLAM; IBRDC3

基因 ID: 127544 | 基因类型: protein coding

关于 RNF19B

Cytogenetic location: 1p35.1 Genomic coordinates (GRCh38): 1:32,929,036-32,964,809 (from NCBI)

This gene has 3 transcripts (splice variants), 204 orthologues and 9 paralogues. Broad expression in testis (RPKM 31.7), bone marrow (RPKM 15.6) and 23 other tissues.

功能概要

该基因编码包含两个 RING 型和一个 IBR 型锌指基序的多通道膜蛋白。编码的蛋白质是一种 E3 泛素蛋白连接酶，在自然杀伤 (NK) 细胞的细胞毒性作用中发挥作用。可变剪接导致多个转录本变体。在可能的假常染色体区域的 X 和 Y 染色体上存在该基因的假基因。[RefSeq 提供，2014 年 7 月]

This gene encodes a multi-pass membrane protein containing two RING-type and one IBR-type zinc finger motifs. The encoded protin is an E3 ubiquitin-protein Ligase that plays a role in the cytotoxic effects of natural killer (NK) cells. Alternative splicing results in multiple transcript variants. There are pseudogenes for this gene on chromosomes X and Y in a possible pseudoautosomal region. [provided by RefSeq, Jul 2014]

RNF19B 基因产物(3)

mRNA	Protein	Name
NM_001127361.3	NP_001120833.1	E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B isoform b
NM_001300826.2	NP_001287755.1	E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B isoform c
NM_153341.4	NP_699172.2	E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B isoform a

基因本体论

分子功能
生物过程
细胞组分

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	16709802	GOA
enables ubiquitin binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	27485036	GOA
enables ubiquitin protein ligase activity	IDA IDA: 通过直接分析推断	27485036	GOA

生物过程 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
involved in protein autoubiquitination	IDA IDA: 通过直接分析推断	27485036	GOA

细胞组分 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
located in endoplasmic reticulum	IDA IDA: 通过直接分析推断	27485036	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

RNF19B 蛋白结构

IBR

0
200
400
600
732 a.a.

蛋白主名

其他名称

E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B

IBR domain-containing protein 3

RNF19B 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
种属内	RNF19B	Q6ZMZ0	SLC30A3	Homo sapiens	Q99726	Validated Y2H	32296183
种属内	RNF19B	Q6ZMZ0	CLEC1A	Homo sapiens	Q8NC01	Validated Y2H	32296183
种属内	RNF19B	Q6ZMZ0	TMEM208	Homo sapiens	Q9BTX3	Validated Y2H	32296183
种属内	RNF19B	Q6ZMZ0	UBE2L6	Homo sapiens	O14933	Anti Bait CoIP	16709802
种属内	RNF19B	Q6ZMZ0	UBE2L6	Homo sapiens	O14933	Anti Tag CoIP	16709802
种属内	RNF19B	Q6ZMZ0	UCKL1	Homo sapiens	Q9NWZ5	Anti Tag CoIP	16709802
种属内	RNF19B	Q6ZMZ0	SACM1L	Homo sapiens	Q9NTJ5	Validated Y2H	32296183
种属内	RNF19B	Q6ZMZ0	AP1M1	Homo sapiens	Q9BXS5	Anti Tag CoIP	28514442
种属内	RNF19B	Q6ZMZ0	AP1M1	Homo sapiens	Q9BXS5	Validated Y2H	32296183
种属内	RNF19B	Q6ZMZ0	AP1M1	Homo sapiens	Q9BXS5	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	RNF19B	Q6ZMZ0	GIMAP5	Homo sapiens	Q96F15	Validated Y2H	32296183
种属内	RNF19B	Q6ZMZ0	UBE2L3	Homo sapiens	P68036	Anti Tag CoIP	16709802
种属内	RNF19B	Q6ZMZ0	TMEM100	Homo sapiens	Q9NV29	Validated Y2H	32296183
种属内	RNF19B	Q6ZMZ0	SEC22A	Homo sapiens	Q96IW7	Validated Y2H	32296183
种属内	RNF19B	Q6ZMZ0	SELENOK	Homo sapiens	Q9Y6D0	Validated Y2H	32296183

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-RS12073	RNF19B Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Felis catus	RNF19B	VGNC	VGNC:80344
Mus musculus	RNF19B	MGD	MGI:1922484
Bos taurus	RNF19B	VGNC	VGNC:34045
Rattus norvegicus	RNF19B	RGD	RGD:1305470
Macaca mulatta	RNF19B	VGNC	VGNC:106488
Canis familiaris	RNF19B	VGNC	VGNC:45651

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