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KRT80 - keratin 80 Gene

中文名称:角蛋白 80

种属: Homo sapiens

同用名: KB20

基因 ID: 144501 | 基因类型: protein coding

关于 KRT80

Cytogenetic location: 12q13.13 Genomic coordinates (GRCh38): 12:52,168,996-52,192,014 (from NCBI)

This gene has 3 transcripts (splice variants), 120 orthologues and 68 paralogues. Biased expression in skin (RPKM 50.6), esophagus (RPKM 17.5) and 2 other tissues.

功能概要

角蛋白是负责上皮细胞结构完整性的中间丝蛋白,分为上皮角蛋白和毛发角蛋白。该基因的表达谱显示它编码 II 型上皮角蛋白,尽管在结构上编码的蛋白质更像是 II 型毛发角蛋白。这种蛋白质参与细胞分化,在分化的早期阶段定位在桥粒斑块附近,但随后在终末分化细胞中分散到整个细胞质中。 II 型角蛋白聚集在染色体 12q13 的区域。已为该基因发现编码两种不同全功能亚型的两种转录变体。[RefSeq 提供,2010 年 10 月]

Keratins are intermediate filament proteins responsible for the structural integrity of epithelial cells and are subdivided into epithelial keratins and hair keratins. This gene's expression profile shows that it encodes a type II epithelial keratin, although structurally the encoded protein is more like a type II hair keratin. This protein is involved in cell differentiation, localizing near desmosomal plaques in earlier stages of differentiation but then dispersing throughout the cytoplasm in terminally differentiating cells. The type II keratins are clustered in a region of chromosome 12q13. Two transcript variants encoding two different fully functional isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Oct 2010]

KRT80 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001081492.2 NP_001074961.1 keratin, type II cytoskeletal 80 isoform K80.1
NM_182507.3 NP_872313.2 keratin, type II cytoskeletal 80 isoform K80
基因本体论
  • 分子功能
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25416956 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
20843789 GOA
NOT located in desmosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
20843789 GOA
located in intermediate filament IDA
IDA: 通过直接分析推断
20843789 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

KRT80 蛋白结构

Filament

Filament: Intermediate filament protein (82 - 393)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 452 a.a.
蛋白主名 其他名称

keratin, type II cytoskeletal 80

CK-80

KRT80 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
KRT80 Q6KB66 KRT15 Homo sapiens P19012 25416956
种属内
KRT80 Q6KB66 KRT20 Homo sapiens P35900 25416956
种属内
KRT80 Q6KB66 KRT20 Homo sapiens P35900 25416956
种属内
KRT80 Q6KB66 MEOX2 Homo sapiens P50222 25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta KRT80 VGNC VGNC:74138
Rattus norvegicus KRT80 RGD RGD:1359177
Bos taurus KRT80 VGNC VGNC:30742
Canis familiaris KRT80 VGNC VGNC:42534
Mus musculus KRT80 MGD MGI:1921377
Felis catus KRT80 VGNC VGNC:63174