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FBXL16 - F-box and leucine rich repeat protein 16 Gene

中文名称:F-box 和富亮氨酸的重复蛋白 16

种属: Homo sapiens

同用名: Fbl16; C16orf22; c380A1.1

基因 ID: 146330 | 基因类型: protein coding

关于 FBXL16

Cytogenetic location: 16p13.3 Genomic coordinates (GRCh38): 16:692,500-705,801 (from NCBI)

This gene has 5 transcripts (splice variants), 221 orthologues and 15 paralogues. Biased expression in brain (RPKM 76.4), testis (RPKM 4.8) and 1 other tissue.

功能概要

F-box 蛋白家族的成员,例如 FBXL16,以大约 40 个氨基酸的 F-box 基序为特征。由 SKP1 (MIM 601434) 、cullin (参见 CUL1;MIM 603134) 和 F-box 蛋白形成的 SCF 复合物充当蛋白质-泛素连接酶。 F-box 蛋白通过 F-box 与 SKP1 相互作用,并且它们通过其他蛋白质相互作用域与泛素化目标相互作用 (Jin 等人,2004 [PubMed 15520277]) 。[OMIM 提供,2008 年 3 月]

Members of the F-box protein family, such as FBXL16, are characterized by an approximately 40-amino acid F-box motif. SCF complexes, formed by SKP1 (MIM 601434), cullin (see CUL1; MIM 603134), and F-box proteins, act as protein-ubiquitin ligases. F-box proteins interact with SKP1 through the F box, and they interact with ubiquitination targets through Other protein interaction domains (Jin et al., 2004 [PubMed 15520277]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

FBXL16 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_153350.4 NP_699181.2 F-box/LRR-repeat protein 16
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
34818544 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

FBXL16 蛋白结构

LRR_6

LRR_6: Leucine Rich repeat (319 - 339)

LRR_6

LRR_6: Leucine Rich repeat (345 - 365)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 479 a.a.
蛋白主名 其他名称

F-box/LRR-repeat protein 16

FBXL16 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
FBXL16 Q8N461 HIF1A Homo sapiens Q16665
PLA
34818544
种属内
FBXL16 Q8N461 HIF1A Homo sapiens Q16665 34818544
种属内
FBXL16 Q8N461 HIF1A Homo sapiens Q16665 34818544
种属内
FBXL16 Q8N461 HIF1A Homo sapiens Q16665 34818544
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta FBXL16 VGNC VGNC:81405
Canis familiaris FBXL16 VGNC VGNC:54023
Bos taurus FBXL16 VGNC VGNC:52773
Rattus norvegicus FBXL16 RGD RGD:1309127
Mus musculus FBXL16 MGD MGI:2448488
Felis catus FBXL16 VGNC VGNC:80572