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ELK3 - ETS transcription factor ELK3 Gene

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中文名称：ETS 转录因子 ELK3

种属: Homo sapiens

同用名: ERP; NET; SAP2; SAP-2

基因 ID: 2004 | 基因类型: protein coding

关于 ELK3

Cytogenetic location: 12q23.1 Genomic coordinates (GRCh38): 12:96,194,375-96,269,824 (from NCBI)

This gene has 6 transcripts (splice variants), 204 orthologues and 28 paralogues. Ubiquitous expression in spleen (RPKM 23.7), endometrium (RPKM 22.8) and 24 other tissues.

功能概要

该基因编码 ETS 结构域转录因子家族和三元复合因子 (TCF) 亚家族的成员。当被血清反应因子募集以结合血清反应元件时，该亚家族中的蛋白质调节转录。这种蛋白质被信号诱导的磷酸化激活；对啮齿动物的研究表明，它在没有 Ras 的情况下是一种转录抑制剂，但在存在 Ras 时激活转录。交替剪接导致多个转录本变体。[RefSeq 提供，2015 年 1 月]

This gene encodes a member of the ETS-domain transcription factor family and the ternary complex factor (TCF) subfamily. Proteins in this subfamily regulate transcription when recruited by serum response factor to bind to serum response elements. This protein is activated by signal-induced phosphorylation; studies in rodents suggest that it is a transcriptional inhibitor in the absence of Ras, but activates transcription when Ras is present. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2015]

ELK3 基因产物(8)

mRNA Protein Name
NM_001303511.2 NP_001290440.1 ETS domain-containing protein Elk-3 isoform 2
NM_001413760.1 NP_001400689.1 ETS domain-containing protein Elk-3 isoform 1
NM_001413761.1 NP_001400690.1 ETS domain-containing protein Elk-3 isoform 1
NM_001413762.1 NP_001400691.1 ETS domain-containing protein Elk-3 isoform 3
NM_001413763.1 NP_001400692.1 ETS domain-containing protein Elk-3 isoform 4
NM_001413764.1 NP_001400693.1 ETS domain-containing protein Elk-3 isoform 5
NM_001413765.1 NP_001400694.1 ETS domain-containing protein Elk-3 isoform 6
NM_005230.4 NP_005221.2 ETS domain-containing protein Elk-3 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific IDA
IDA: 通过直接分析推断
12788937 GOA
enables DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific IDA
IDA: 通过直接分析推断
12933792 GOA
enables RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
12788937 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
17474147 GOA
enables purine-rich negative regulatory element binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
12933792 GOA
enables sequence-specific double-stranded DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
28473536 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of transcription by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
12933792 GOA
involved in positive regulation of transcription by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
12788937 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
is active in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
12933792 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

ELK3 蛋白结构

Ets

Ets: Ets-domain (5 - 86)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 407 a.a.
蛋白主名 其他名称

ETS domain-containing protein Elk-3

ELK3, ETS transcription factor

ELK3 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
ELK3 P41970 SP4 Homo sapiens Q02446
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
ELK3 P41970 SP4 Homo sapiens Q02446
Validated Y2H
32296183
种属内
ELK3 P41970 SP4 Homo sapiens Q02446
Y2H Array
32296183
种属内
ELK3 P41970 PFDN5 Homo sapiens Q99471
Validated Y2H
32296183
种属内
ELK3 P41970 PFDN5 Homo sapiens Q99471
Y2H Array
32296183
种属内
ELK3 P41970 PFDN5 Homo sapiens Q99471
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
ELK3 P41970 LSAMP Homo sapiens Q13449
Y2H Pooling
32814053
种属内
ELK3 P41970 LSAMP Homo sapiens Q13449
Validated Y2H
32814053
种属内
ELK3 P41970 LSAMP Homo sapiens Q13449
Y2H Array
32814053
种属内
ELK3 P41970 BPIFA1 Homo sapiens Q9NP55
Y2H Array
32296183
种属内
ELK3 P41970 BPIFA1 Homo sapiens Q9NP55
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
ELK3 P41970 BPIFA1 Homo sapiens Q9NP55
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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生物活性分子 (2)
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纯度 是否罕见病
HY-107753 XRP44X Inhibitor 98.09% 否
HY-RS04306 ELK3 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus ELK3 VGNC VGNC:28433
Canis familiaris ELK3 VGNC VGNC:40304
Macaca mulatta ELK3 VGNC VGNC:72210
Felis catus ELK3 VGNC VGNC:61811
Rattus norvegicus ELK3 RGD RGD:1307764
Mus musculus ELK3 MGD MGI:101762
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