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HOXC9 - homeobox C9 Gene

中文名称:同源框 C9

种属: Homo sapiens

同用名: HOX3; HOX3B

基因 ID: 3225 | 基因类型: protein coding

关于 HOXC9

Cytogenetic location: 12q13.13 Genomic coordinates (GRCh38): 12:54,000,161-54,003,337 (from NCBI)

This gene has 3 transcripts (splice variants), 210 orthologues and 42 paralogues. Biased expression in kidney (RPKM 2.8), fat (RPKM 2.6) and 10 other tissues.

功能概要

该基因属于同源盒基因家族。同源框基因编码一个高度保守的转录因子家族,在所有多细胞生物的形态发生中起着重要作用。哺乳动物拥有 4 个相似的同源盒基因簇 HOXA、HOXB、HOXC 和 HOXD,它们分别位于不同的染色体上,由 9~11 个串联排列的基因组成。该基因是位于 12 号染色体簇中的几个同源框 HOXC 基因之一。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

This gene belongs to the homeobox family of genes. The homeobox genes encode a highly conserved family of transcription factors that play an important role in morphogenesis in all multicellular organisms. Mammals possess four similar homeobox gene clusters, HOXA, HOXB, HOXC and HOXD, which are located on different chromosomes and consist of 9 to 11 genes arranged in tandem. This gene is one of several homeobox HOXC genes located in a cluster on chromosome 12. [provided by RefSeq, Jul 2008]

HOXC9 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_006897.3 NP_008828.1 homeobox protein Hox-C9
基因本体论
  • 分子功能
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
18305892 GOA
enables sequence-specific double-stranded DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
28473536 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of transcription repressor complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
22615398 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

HOXC9 蛋白结构

Hox9_act

Hox9_act: Hox9 activation region (1 - 179)

Homeobox

Homeobox: Homeobox domain (193 - 249)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 260 a.a.
蛋白主名 其他名称

homeobox protein Hox-C9

homeo box C9

HOXC9 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
HOXC9 P31274 NFKBID Homo sapiens Q8NI38
Validated Y2H
32296183
种属内
HOXC9 P31274 NFKBID Homo sapiens Q8NI38
Y2H Array
32296183
种属内
HOXC9 P31274 NFKBID Homo sapiens Q8NI38
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
HOXC9 P31274 TLE5 Homo sapiens Q08117-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
HOXC9 P31274 TLE5 Homo sapiens Q08117-2
Y2H Array
32296183
种属内
HOXC9 P31274 TLE5 Homo sapiens Q08117-2
Validated Y2H
32296183
种属内
HOXC9 P31274 KRTAP6-2 Homo sapiens Q3LI66
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
HOXC9 P31274 KRTAP6-2 Homo sapiens Q3LI66
Validated Y2H
32296183
种属内
HOXC9 P31274 KRTAP6-2 Homo sapiens Q3LI66
Y2H Array
32296183
种属内
HOXC9 P31274 ZMYND12 Homo sapiens Q9H0C1
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
HOXC9 P31274 ZMYND12 Homo sapiens Q9H0C1
Validated Y2H
32296183
种属内
HOXC9 P31274 ZMYND12 Homo sapiens Q9H0C1
Y2H Array
32296183
种属内
HOXC9 P31274 UFSP1 Homo sapiens Q6NVU6
Y2H Array
32296183
种属内
HOXC9 P31274 UFSP1 Homo sapiens Q6NVU6
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
HOXC9 P31274 UFSP1 Homo sapiens Q6NVU6
Validated Y2H
32296183
种属间
HOXC9 P31274 E2 Human papillomavirus P03120
Y2H
18305892
种属间
HOXC9 P31274 E2 Human papillomavirus P03120
SLC
22761572
种属内
HOXC9 P31274 PAX8 Homo sapiens Q06710
Validated Y2H
32296183
种属内
HOXC9 P31274 PAX8 Homo sapiens Q06710
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
HOXC9 P31274 PAX8 Homo sapiens Q06710
Y2H Array
32296183
种属内
HOXC9 P31274 PBX2 Homo sapiens P40425
Validated Y2H
32296183
种属内
HOXC9 P31274 PBX2 Homo sapiens P40425
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
HOXC9 P31274 PBX2 Homo sapiens P40425
Y2H Array
32296183
种属内
HOXC9 P31274 GMNN Homo sapiens O75496
Pull Down
22615398
种属内
HOXC9 P31274 GMNN Homo sapiens O75496
NMR
22615398
种属内
HOXC9 P31274 CYSRT1 Homo sapiens A8MQ03
Y2H Array
32296183
种属内
HOXC9 P31274 CYSRT1 Homo sapiens A8MQ03
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
HOXC9 P31274 MSX2 Homo sapiens P35548
Validated Y2H
32296183
种属内
HOXC9 P31274 MSX2 Homo sapiens P35548
Y2H Array
32296183
种属内
HOXC9 P31274 MSX2 Homo sapiens P35548
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
HOXC9 P31274 MAGED1 Homo sapiens Q9Y5V3
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
HOXC9 P31274 MAGED1 Homo sapiens Q9Y5V3
Validated Y2H
32296183
种属内
HOXC9 P31274 MAGED1 Homo sapiens Q9Y5V3
Y2H Array
32296183
种属内
HOXC9 P31274 SPMIP9 Homo sapiens Q96LM6
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
HOXC9 P31274 SPMIP9 Homo sapiens Q96LM6
Validated Y2H
32296183
种属内
HOXC9 P31274 SPMIP9 Homo sapiens Q96LM6
Y2H Array
32296183
种属内
HOXC9 P31274 LPXN Homo sapiens O60711
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
HOXC9 P31274 LPXN Homo sapiens O60711
Y2H Array
32296183
种属内
HOXC9 P31274 PAX6 Homo sapiens P26367
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
HOXC9 P31274 PAX6 Homo sapiens P26367
Y2H Array
32296183
种属内
HOXC9 P31274 POU2AF1 Homo sapiens Q16633
Y2H Array
32296183
种属内
HOXC9 P31274 POU2AF1 Homo sapiens Q16633
Validated Y2H
32296183
种属内
HOXC9 P31274 POU2AF1 Homo sapiens Q16633
Y2H Prey Pooling
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Distal Muscular Dystrophy With Anterior Tibial Onset

Dmat

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

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Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

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Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus HOXC9 VGNC VGNC:67630
Rattus norvegicus HOXC9 RGD RGD:1595784
Bos taurus HOXC9 VGNC VGNC:29928
Mus musculus HOXC9 MGD MGI:96199