2. Gene
  3. CPSF2 - cleavage and polyadenylation specific factor 2 Gene

CPSF2 - cleavage and polyadenylation specific factor 2 Gene

  • 基因
  • 蛋白
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中文名称：裂解和聚腺苷酸化特异性因子 2

种属: Homo sapiens

同用名: CPSF100

基因 ID: 53981 | 基因类型: protein coding

关于 CPSF2

Cytogenetic location: 14q32.12 Genomic coordinates (GRCh38): 14:92,121,969-92,172,145 (from NCBI)

This gene has 5 transcripts (splice variants), 210 orthologues and 3 paralogues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 13.0), thyroid (RPKM 12.9) and 25 other tissues.

功能概要

预测启用 RNA 结合活性。通过茎环结合活性和切割参与 mRNA 3'-末端加工。位于膜内。部分 mRNA 裂解和聚腺苷酸化特异性因子复合物。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Predicted to enable RNA binding activity. Involved in mRNA 3'-end processing by stem-loop binding activity and cleavage. Located in membrane. Part of mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

CPSF2 基因产物(4)

mRNA Protein Name
NM_001322270.2 NP_001309199.1 cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 isoform 2
NM_001322271.2 NP_001309200.1 cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 isoform 3
NM_001322272.2 NP_001309201.1 cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 isoform 1
NM_017437.3 NP_059133.1 cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
18288197 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in mRNA 3'-end processing by stem-loop binding and cleavage IDA
IDA: 通过直接分析推断
18688255 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
18305108 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

CPSF2 蛋白结构

Lactamase_B

Lactamase_B: Metallo-beta-lactamase superfamily (17 - 181)

Beta-Casp

Beta-Casp: Beta-Casp domain (243 - 367)

RMMBL

RMMBL: Zn-dependent metallo-hydrolase RNA specificity domain (527 - 569)

CPSF100_C

CPSF100_C: Cleavage and polyadenylation factor 2 C-terminal (608 - 779)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 782 a.a.
蛋白主名 其他名称

cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2

CPSF 100 kDa subunit

CPSF2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
CPSF2 Q9P2I0 SYMPK Homo sapiens Q92797
GMS
35177536
种属内
CPSF2 Q9P2I0 SYMPK Homo sapiens Q92797
Anti Tag CoIP
18688255
种属内
CPSF2 Q9P2I0 SYMPK Homo sapiens Q92797
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
CPSF2 Q9P2I0 CSTF2 Homo sapiens P33240
Anti Tag CoIP
18688255
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS03117 CPSF2 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus CPSF2 VGNC VGNC:61140
Canis familiaris CPSF2 VGNC VGNC:39574
Bos taurus CPSF2 VGNC VGNC:27671
Macaca mulatta CPSF2 VGNC VGNC:71473
Mus musculus CPSF2 MGD MGI:1861601
Rattus norvegicus CPSF2 RGD RGD:1309687
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