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SYMPK - symplekin scaffold protein Gene

中文名称:symplekin 支架蛋白

种属: Homo sapiens

同用名: SPK; SYM; Pta1

基因 ID: 8189 | 基因类型: protein coding

关于 SYMPK

Cytogenetic location: 19q13.32 Genomic coordinates (GRCh38): 19:45,815,410-45,863,147 (from NCBI)

This gene has 18 transcripts (splice variants) and 200 orthologues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 32.3), spleen (RPKM 15.5) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码一种核蛋白,该蛋白在多聚腺苷酸化的调节中发挥作用并促进基因表达。该蛋白质与聚腺苷酸化机制的成分形成高分子量复合物。它被认为是将调节因子募集到聚腺苷酸化复合体的支架。它还参与不进行聚腺苷酸化的组蛋白 mRNA 的 3' 端成熟。该蛋白质还定位于某些细胞类型中紧密连接的细胞质斑块。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

This gene encodes a nuclear protein that functions in the regulation of polyadenylation and promotes gene expression. The protein forms a high-molecular weight complex with components of the polyadenylation machinery. It is thought to serve as a scaffold for recruiting regulatory factors to the polyadenylation complex. It also participates in 3'-end maturation of histone mRNAs, which do not undergo polyadenylation. The protein also localizes to the cytoplasmic plaques of tight junctions in some cell types. [provided by RefSeq, Jul 2008]

SYMPK 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_004819.3 NP_004810.2 symplekin
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
14707147 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of protein binding IMP
IMP: 通过突变表型推断
29158257 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
8769423 GOA
located in nuclear stress granule IDA
IDA: 通过直接分析推断
14707147 GOA
located in nucleoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
8769423 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

SYMPK 蛋白结构

DUF3453

DUF3453: Domain of unknown function (DUF3453) (117 - 351)

Symplekin_C

Symplekin_C: Symplekin tight junction protein C terminal (887 - 1069)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 800
  • 1000
  • 1200
  • 1274 a.a.
蛋白主名 其他名称

symplekin

SYMPK 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SYMPK Q92797 CPSF2 Homo sapiens Q9P2I0
Anti Bait CoIP
18288197
种属内
SYMPK Q92797 CPSF2 Homo sapiens Q9P2I0
Anti Tag CoIP
18688255
种属内
SYMPK Q92797 CPSF2 Homo sapiens Q9P2I0
GMS
35177536
种属内
SYMPK Q92797 CPSF2 Homo sapiens Q9P2I0
Anti Tag CoIP
26496610
种属内
SYMPK Q92797 SSU72 Homo sapiens Q9NP77-1
X-Ray Diffraction
20861839
种属内
SYMPK Q92797 SSU72 Homo sapiens Q9NP77-1
GMS
20861839
种属内
SYMPK Q92797 CSTF2 Homo sapiens P33240
Anti Tag CoIP
33961781
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Canis familiaris SYMPK VGNC VGNC:47022
Felis catus SYMPK VGNC VGNC:65877
Bos taurus SYMPK VGNC VGNC:35514
Rattus norvegicus SYMPK RGD RGD:1306735
Macaca mulatta SYMPK VGNC VGNC:78195
Mus musculus SYMPK MGD MGI:1915438